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Name : CPR_0417 (CPR_0417) Accession : YP_697746.1 Strain : Clostridium perfringens SM101 Genome accession: NC_008262 Putative virulence/resistance : Unknown Product : oligo-1,6-glucosidase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 502193 - 503857 bp Length : 1665 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00128 DNA sequence : ATGAATAAAAAGTGGTGGAAAGAACTAATTGCTTACCAGATTTATCCTAAGAGCTTTATGGATTCTAATGGTGATGGTAT AGGTGATATTCAAGGTATAATATCTAAATTAGATTATTTAAAAGATTTAGGTATTGATTTAATATGGCTATGTCCAATGT ATAAATCACCAAATCATGATAATGGTTATGACATTAGTGATTATAAAGATATCTTAGATGAATTTGGAACTATGGATGAT TTTAATGAATTGCTTAATGAGGTTCATAATAGAGGGATGAAGCTTATTATAGATTTAGTAATAAATCATACTAGTCATGA ACATCCATGGTTCATAGAATCAAGATCTTCTAGGGATAATCCTAAAAGAGATTGGTATATTTGGAGAGAAGGTAAAGGGT ATGAGGAACCAAATAACTGGGAGAGCATATTTAAAGGTTCAGCTTGGGAATTCTGTGAGAATAGTGAAGAGTATTACCTA CATTTATTTGCTAAAGAGCAACCAGATTTAAACTGGGAGAATAAAGAGGTAAGAAGAGAACTATATAATATGATAAACTG GTGGCTTGATAAGGGTATTGATGGATTTAGAGTTGATGCTATAAGTCACATAAAAAAAGAAGAAGGTCTTAAGGATATGG ATAATCCAGAGGGGCTTAAATATGTTTCATCCTTTGAAAAACATATGAATGTAGAGGGAATAAATTCTCATCTTAAGGAA CTAAAAGAAGAAACTTTTTCAAAGTACGATATAGTTACCGTTGGAGAAGCAAATGGAGTTAGTGCTAATGAAGCTGATCA CTGGGTAGCTGAAGATGAGGGAACATTTAATATGATATTCCAATTTGAGCATCTTAATCTTTGGAATTATGAAGAGGGAC AAGGATTTGATGTGAAGGCATACAAAGATGTTTTAACAAATTGGCAAAATTCTTTAGAAGGCAAAGGATGGAATGCACTT TTTATTGAAAATCATGATATACCTAGAGTTGTTTCAACTTGGGGAAATGACAAGGAATATTTAACTGAATGTGCAAAAGC TTTTGGAGCAATTTATTTCTTACAAAAGGGAACCCCTTTCATATATCAAGGGCAAGAGCTTGGTATGACAAATGTTAAAT ATCATAGTATATGTGAGTATGATGATGTTAAAACTATAAATACTTACAATGAAAGAATTGAAAGTGGTGTTTCAGAGGAA ATAGCATTAAAAGAAGCTTGGGTAACTTCAAGAGATAATTCAAGAACACCTATGCAATGGAACTCAAGTAAGAATGCAGG ATTTACTTGTGGAAAACCTTGGATAGGAGTTAATGAAAATTATAAAACAATAAATGTAGAAGTTGAAGAAAGGGATGAAA ATTCAGTTTTAAACTTCTATAAAAAGCTTATAAAACTTAAAAAGTCTAATGAAGCTTTAATCTATGGTGTATATGATTTA ATCCTTGAAGAGGATGAAAATATATTTGCTTACACAAGAACTTTAAATAATGATAAATTCTTGATAATGGCTAATTTAAC TGGAGAAAATGCCAAGTATGTGTATGAGAAAGAAAAACTTAATTCTAAGGATTTAATTCTTAACAATTATGAGGTTTGTG AACATAAAAACTTAACAGAGTTTATATTAAAACCTTATGAATGCAGAGTATATAAGCTTTCCTAA Protein sequence : MNKKWWKELIAYQIYPKSFMDSNGDGIGDIQGIISKLDYLKDLGIDLIWLCPMYKSPNHDNGYDISDYKDILDEFGTMDD FNELLNEVHNRGMKLIIDLVINHTSHEHPWFIESRSSRDNPKRDWYIWREGKGYEEPNNWESIFKGSAWEFCENSEEYYL HLFAKEQPDLNWENKEVRRELYNMINWWLDKGIDGFRVDAISHIKKEEGLKDMDNPEGLKYVSSFEKHMNVEGINSHLKE LKEETFSKYDIVTVGEANGVSANEADHWVAEDEGTFNMIFQFEHLNLWNYEEGQGFDVKAYKDVLTNWQNSLEGKGWNAL FIENHDIPRVVSTWGNDKEYLTECAKAFGAIYFLQKGTPFIYQGQELGMTNVKYHSICEYDDVKTINTYNERIESGVSEE IALKEAWVTSRDNSRTPMQWNSSKNAGFTCGKPWIGVNENYKTINVEVEERDENSVLNFYKKLIKLKKSNEALIYGVYDL ILEEDENIFAYTRTLNNDKFLIMANLTGENAKYVYEKEKLNSKDLILNNYEVCEHKNLTEFILKPYECRVYKLS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 1e-118 | 47 |
