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Name : ECP_3028 (ECP_3028) Accession : YP_670912.1 Strain : Escherichia coli 536 Genome accession: NC_008253 Putative virulence/resistance : Virulence Product : capsule export protein KpsC Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG3563 EC number : - Position : 3186695 - 3188824 bp Length : 2130 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTTTATATACAAATTCAAAAGGGATTTTAGCTAAGAAATATTATATACAATCCATCCTAAATATGGAATTGCGTTA TTTAAAAAAACAACAAACCCCTGATAAAAATAGTGTCTTTATAGGCTGGGGTCAGAAAGATAACACAAGAAAAATAAAAA GCATAGCCGAAAAATGGAGTGCTCCTTACTGGCAATTGGAAGATGGTTTTATAGGATATATTGGTCATCCAGGGCGAACT GGGAAAGCCGTGTCTCTGATCGCAGACCCAATAGGTATATATTATGATGCCAGACAACCTAGTCAGCTAGAGAATTTAAT TGCTTCCCCTATTGATAGACAGTTGATAGAACGTGCAGAACATTTGATCAAAAATATCGTACGTTTGGGTATCACCAAAT ATAACTGCTACGCACAAGATAGTACTTTTGATAATGACAATAGCATAATTTGTAATTCGGATAATGCCTCGATATATTTA TCAACCAACACTCAACCTTTGATTAACGATAGCTCCCCCTCTCATAATTTTATTTCTTTTGTGAGTGATTCAAAACCTCG TATCTTGTTGGTCGATCAGGTTCTAGGTGATTTATCCATTCAGGGGGCCATGGCTAGTGAAGACGATTTTCTGGCAATGG TTGTTGCAGCACGTCGTAATCACCCTAATGCGCGCATATTGTTGCGTACGCACCCAGATACGCGTTTTAGCAAAAAAAGA GGTGTGCTAGCGAGCTTGGTCAATCGCGAGCCTATATTAGCTGAAGTAGAGGTGGTGAGTGATTCTATACATCCACATAA GTTGCTCAATACTGTTGATGCGGTATATACCGTTTCTTCTCAAGTTGGGTTTGAAGCATTGCTCTTGGGTAAAAAGGTAT ACTGTTTTGGCATGCCATTCTATGCTGGTTGGGGGTTAACTCATGACAGCAAAAAGTGTGCTCGCCGACAAGAGGCAATG TCAGTCTATGGTTTCTCCTCCATTTCATTACCTCAATTAGTTGCTGCTGCATTGATTCGTTATCCTTACTATTTTGATCC TATCCTAGAGAAATGCTGTGAGGTCGAAGATGTCATTGATATCATTGCGCACCAGCAAGTTGAAGCTACACGCTGGCGGC GCCTCTATTTGGTCGGGTTCTCTCTATGGAAACGCTCATTTATGCGTACATTCTGTGCTCATTTAGCCAAAGAGCTTTGT TTTGTGAGTTCTTTGCCTCCACATCTTAAAGATGATGAGCATGTTTTAGTCTGGGGAAATAGTTATCCAGAGTTACAATC TGTTATTCGTGTTGAAGATGGCTTTATTCGTTCCAATGGGTTGGGTTCAAATTTTTGTCGACCCTCATCACTTTGTATTG ATCCTGTAGGAATATATTTTAATAGCTTTAGACCAAGTAAGTTGGAACAATTGCTTAATACATATCCTTTGGATAATAAA ATATTGATTCGGGGCAATGCATTGCTAAGGCTATTACGAACATCCAGAGTGAGTAAATATAACGTAGGTGTATCTCACGA ATTCCACCCACCACAAGATGGCCGCGAGTTGGTGCTAGTAGTAGGACAGGTGGATGGAGATGCATCAATTTTATATGGAA GCCCATTTATCCGTAGTAATGAACAATTATTATGGGCAGTACGAAAAACTAAACCAAATGCACATATTCTTTTTAAGCCA CATCCAGATGTGATTTCCGGTAATAGAAAGGGTGCTGTTTCAGCAAAGTGTCAATCTCAATGTGTTGACAGCTTGGTAAT AGATATTGAACTGGCCTCTCTTTACCCTCACATTGATGAGTTGCATACAATGACTTCGCTGAGTGGATTCGAAGCCTTAG TTCAGGGAGTGAATGTTATTACTTGGGGACAACCTTTTTATAGTGGATGGGGGTTGACACAAGACATATATCCTCCAACG AGACGTCAGCGTACATTAACACTAAGTGCGTTAGTGTATATTACATTAACTAAATATCCACGATATATCGATTGGAAAAC TGGTCTTTGGTGTAGTTCTGAACAATTAATTCATCTTATGGCAGGGCAAAATAAGACTCCAGTCGTAGGTCTAAATCGTT GGAGACGCTGGCGGATTAAATTTAATTATTTATTTCAATCACTAAAATAG Protein sequence : MILYTNSKGILAKKYYIQSILNMELRYLKKQQTPDKNSVFIGWGQKDNTRKIKSIAEKWSAPYWQLEDGFIGYIGHPGRT GKAVSLIADPIGIYYDARQPSQLENLIASPIDRQLIERAEHLIKNIVRLGITKYNCYAQDSTFDNDNSIICNSDNASIYL STNTQPLINDSSPSHNFISFVSDSKPRILLVDQVLGDLSIQGAMASEDDFLAMVVAARRNHPNARILLRTHPDTRFSKKR GVLASLVNREPILAEVEVVSDSIHPHKLLNTVDAVYTVSSQVGFEALLLGKKVYCFGMPFYAGWGLTHDSKKCARRQEAM SVYGFSSISLPQLVAAALIRYPYYFDPILEKCCEVEDVIDIIAHQQVEATRWRRLYLVGFSLWKRSFMRTFCAHLAKELC FVSSLPPHLKDDEHVLVWGNSYPELQSVIRVEDGFIRSNGLGSNFCRPSSLCIDPVGIYFNSFRPSKLEQLLNTYPLDNK ILIRGNALLRLLRTSRVSKYNVGVSHEFHPPQDGRELVLVVGQVDGDASILYGSPFIRSNEQLLWAVRKTKPNAHILFKP HPDVISGNRKGAVSAKCQSQCVDSLVIDIELASLYPHIDELHTMTSLSGFEALVQGVNVITWGQPFYSGWGLTQDIYPPT RRQRTLTLSALVYITLTKYPRYIDWKTGLWCSSEQLIHLMAGQNKTPVVGLNRWRRWRIKFNYLFQSLK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| kpsC | CAE85217.1 | KpsC protein | Virulence | PAI V 536 | Protein | 0.0 | 100 |
