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Name : pdpD1 (FTF1360c) Accession : YP_667444.1 Strain : Francisella tularensis FSC 198 Genome accession: NC_008245 Putative virulence/resistance : Virulence Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1401294 - 1404881 bp Length : 3588 bp Strand : - Note : Similar to AAP58961.1 (Q7C3J6) PdpD from Francisella novicida (1245 aa). BLAST Score = 2194, Expect = 0.0 Identities = 1133/1245 (91), Positives = 1154/1245 (92), Gaps = 50/1245 (4) Identical to FTF1715. It is part of the duplicated region 1374371..140828 DNA sequence : ATGGATCAAGATATCAACGATTTATTATATGATACTAATGATTTGAAAAAAGAAAAAGTATGTGGCGGCTTTTTTGATTT TATCAAAGCTTGGTTTTATAATGACGTTGAAAGACATATGTTTTTTGAAGATGAGATTATTGTGGCTCAGAAACTTAAAA CGATGGATGTCATGGCTAATACATACGCCTTAGAGAGAAAAAAATATTTTGAAAAATTTCTCAAAGATTCTCATAAACAA AAAGGTTTTTTTACAAGAATAAAAGATAGAGATTTTGCTTTTTATAAAGATCCTACTAGGGTTAAACTATGGAGTAGTAT TACTGATACTGATGTCTATAGCTTTTTTATAAAGTCAAGCGTTAACCAAGTGCTTGGTGGTGGTAATATAGCTCAACTGA CATCATTACCAAAATTTAAGTTTAATGCAATAGCATCAGTTAATAATGAAAACATCTCGGCAGCAGCTAATCTTGCAGCT ACTGGAGCAAAAAGTTTTTTTGGAAGTTCATGTATAAATATTTGGTCTAATTTACCTGTATTTGATAGTGAAAGAGGAGA TGTTAAATCATTTATTCCATTATACCTAAGAATAAGTGGTAAAGCTTCATCGGCATTATTTAATTATAATATAGATATAA GTGCTAGCACAAATAGATTAAAATTTACTGAATCAAAATGCATGGAATTATTAAATAACTTTAAGGGCAATGTAAATCTT AGATTAGTGGCTGCAAAAAGCTCTAGAGAAGCAAAAAGCTTTATTTATACTCCAAAATTTAAAGAAGATAGTAATAAGCA TTTAAATGATTTAGGTTTTATTCTAAATACTCAGCAAGGTTCATATAGATATTTAGTTCCTGAAATTAGGGATGGACTTG ATCTAATTAGAGAATATACATACCCCGAAATTGAACAGATTTATTTTGGTAGGAGTGCACTTTCTGGTTATTCAAAAAGT AATTATGACAAGCAAAGTTTAGGTATTGAGAAAAATGGTGAGGGTCTTATGACTCTTAGGGTTAGTTCCAAAGATTATGA AAATCCACTAATTCAGGTCAAAACATCAGTTAATGTAACTAGTTTTGATCTTTTATCAGGACAAATAAAAGGTAAGATTT TAGCTGATGACTTAATTGGTTTTTCAGATGCTAAAGGTGCTATTAATAAGTTCAGAAACGAAGTTGATACAATTATTAAA AACAATATTAGTGAAAGCTTTAAGTCTCCTTTTAAGATACCAAACTTATCTGAATTTAGTGATATGGAGATAAGAGTGAG GTTTGGCTTATATTCTAAACAATCAGCATCCAAGTTGAGGACCATAAGAATCTCTATTCCTATGACTACTAAAATGTTAG ATTTTAATCAAACATCTGGGTCATATAATACAAAATCAGGTATGGGTTATTCAATGGCTCAGAGACATCAATTAAAAGAA GCAATACCTTATAATGAAGGTCTTCTAGAAAATTCTGCTCAGCAGGATTTTGATTTGGTTAAACCAACCGGAAATAGTAC TCTTGGAGCTGTGCAAGATAATTTATCAAACATATATGATAAAAGTAGTACGTTTGACTCAGTAATAGGTTCTTTGAGAG AGCTTTATAAACTTAAAGGTGAAGACCTAACAAATATTGATTCTCATGATATCCTTAATGTTTTATCACAAAACTCGTCT TTATCAGGGTTATCTAGTAGTATCGCAGCAGATCTAAATGAGTTAAACTCTAAGTTTAAGGATATTACGTCTATAAATAA AAAAACATCTGAAGCGATATTATCTACGAATTACCAGCAATATAATCCTAGTTTTAATAAAGCAAAAATATTCGATAATC CAGATTCTTTCTATGTTCAAGATACTTTAATTAACTACTCACAAACCCTAAAAAAAGAAGAATTTAGAGATCAGATGTCA ACAATAAATATTATTGAATTTGGTAGTGATGGTGACTTACCTATATTATTTAATCTTTGTAAAATGATGACTAGCGAGTC AGCAAAAGATGGCGCAAAAAATTTTCTAAGTCAAAAGGAGAATGTTAATAAGACTAAAGAGTTTTTTGATGCTCTAGAAA ATACCACTTCTGTAATAAGTCCAGAATCAAATATCAGTTATACATCTATTAATGTGCTTTGTAGCAAAAATGCTGGAGGT GTAATTACTGAGAATAACAAAGCATCTTCTGTATCCCTAGGTTCAACTATTAGTTTAGCGGATTTTAATAGAATGTATTC GCTTGACTCAAGAGTTTCTGTGCTTGGAGTATCTCCTTTAGAAGAGTTATCAAGTTTTTCAGCGAAAAAAAATGAATATA AAATCACTTTTGAAGAATATTTTACTAAGTTAGCGATTCAAAGATATATGGAAGTTATTATGATAGATGATGAAGCTGAC TTTATAAAATCATTTGTATTACCAATGATGGAGTGTCAAAAGAAACTATTAGATAATTTAGTTATTCTAAATAAGGATGC TAAATGGAAAAGTAGTTCATCATTTAAGAGAGCTTTCTCAAATAGAGGTAGTTTTAGTTTTACTGGTTGGCTTAAAGAGA GACTTCCTGGCTTTGATTTTGAGCTTTCTCAGGAGTATGCTTATTTTACTGGCTTAGTAATAAACTTTGCCTTTGAAGAA GATAACTCTTCTTCTGAAACTGTAATTAAACTATGTAAAATTATAAAATCTTTAGATAGGCTTGTTCGAGGTTTTTATTT CTTACTAAGAAGGATGGTGAAAAATAGAAATACTAAAGTTGGTTCTCATAATGTCTCTGAAAGTCACATTAATATGGTTA AGCAGATTTTAACATCCTTATGTGAACCATATCAGATTTTAACTCAGAAGGTAAGCGATAATGCTGAACTGTTGTCTGCT TTAGTTAATATGTTGAGTTTTATGGATAGCCTTGTTGAAGTACAGCGGCTATGTGCTTCGATTTGTATTCCAACCAGTGC ATTTTTCACTTTAGTGAATGAAAATAAAAATTTGTTGAAAGATATTTGCTACACTGTCGAAAAAAGTGGTGTTACAGGAA TAGTGGTTGAATCGACATTTAGCTATTCGCCAGAACTCTTCAAAGAAAATCAACAAGATATTAAGCTTAACATTAAAAAC ACGTCAGTCAGAGTACGAGATGGTAAAGTCAAGAGGGTTACCAGCATTGATAGGAATGCTAATACTGAAGCTATCTTACA AAGTATTTATGATAATATAATTGCGTTTGATGAACAAGATTTAGAAAGACTATTTACGGGGTTTAGGATTTTAAAACAAG AAAATTCGACAAACACTAATAAAGCCGTTTTCAATATTGGTTTAACATATCATCCAATAACTAATAATGCTTTTGTTGAA TTTAATAAGGATCAACAAAGTTTATTGTACTCATATAATAATTTAAGCAAAGATGCGTATGTTACAAAAATTAAAAGTAT AGTTGATGCTAAAGTTGCTTTAAACCTTAGTTTTGAACATGAAGAGATTAGAAGTTCACAAGGTTTTAGTGTCTTAGCAA CTGTACCAGCTAGAGGATATTCTATAGATGATTTAAATAGAAAGTATAGACCAATGATCTGGGTTTAA Protein sequence : MDQDINDLLYDTNDLKKEKVCGGFFDFIKAWFYNDVERHMFFEDEIIVAQKLKTMDVMANTYALERKKYFEKFLKDSHKQ KGFFTRIKDRDFAFYKDPTRVKLWSSITDTDVYSFFIKSSVNQVLGGGNIAQLTSLPKFKFNAIASVNNENISAAANLAA TGAKSFFGSSCINIWSNLPVFDSERGDVKSFIPLYLRISGKASSALFNYNIDISASTNRLKFTESKCMELLNNFKGNVNL RLVAAKSSREAKSFIYTPKFKEDSNKHLNDLGFILNTQQGSYRYLVPEIRDGLDLIREYTYPEIEQIYFGRSALSGYSKS NYDKQSLGIEKNGEGLMTLRVSSKDYENPLIQVKTSVNVTSFDLLSGQIKGKILADDLIGFSDAKGAINKFRNEVDTIIK NNISESFKSPFKIPNLSEFSDMEIRVRFGLYSKQSASKLRTIRISIPMTTKMLDFNQTSGSYNTKSGMGYSMAQRHQLKE AIPYNEGLLENSAQQDFDLVKPTGNSTLGAVQDNLSNIYDKSSTFDSVIGSLRELYKLKGEDLTNIDSHDILNVLSQNSS LSGLSSSIAADLNELNSKFKDITSINKKTSEAILSTNYQQYNPSFNKAKIFDNPDSFYVQDTLINYSQTLKKEEFRDQMS TINIIEFGSDGDLPILFNLCKMMTSESAKDGAKNFLSQKENVNKTKEFFDALENTTSVISPESNISYTSINVLCSKNAGG VITENNKASSVSLGSTISLADFNRMYSLDSRVSVLGVSPLEELSSFSAKKNEYKITFEEYFTKLAIQRYMEVIMIDDEAD FIKSFVLPMMECQKKLLDNLVILNKDAKWKSSSSFKRAFSNRGSFSFTGWLKERLPGFDFELSQEYAYFTGLVINFAFEE DNSSSETVIKLCKIIKSLDRLVRGFYFLLRRMVKNRNTKVGSHNVSESHINMVKQILTSLCEPYQILTQKVSDNAELLSA LVNMLSFMDSLVEVQRLCASICIPTSAFFTLVNENKNLLKDICYTVEKSGVTGIVVESTFSYSPELFKENQQDIKLNIKN TSVRVRDGKVKRVTSIDRNANTEAILQSIYDNIIAFDEQDLERLFTGFRILKQENSTNTNKAVFNIGLTYHPITNNAFVE FNKDQQSLLYSYNNLSKDAYVTKIKSIVDAKVALNLSFEHEEIRSSQGFSVLATVPARGYSIDDLNRKYRPMIWV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| pdpD2 | YP_170620.1 | hypothetical protein | Not tested | FPI | Protein | 0.0 | 100 |
| pdpD1 | YP_001121161.1 | pathogenicity determinant protein D, pdpD | Virulence | FPI | Protein | 0.0 | 100 |
| pdpD2 | YP_001121564.1 | pathogenicity determinant protein D, pdpD | Virulence | FPI | Protein | 0.0 | 100 |
| pdpD1 | YP_170312.1 | hypothetical protein | Not tested | FPI | Protein | 0.0 | 100 |
| pdpD1 | YP_001891779.1 | hypothetical protein | Virulence | FPI | Protein | 0.0 | 94 |
| pdpD2 | YP_001892274.1 | hypothetical protein | Virulence | FPI | Protein | 0.0 | 94 |
| pdpD | AAP58961.1 | PdpD | Virulence | FPI | Protein | 0.0 | 90 |
