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Name : lldP (Hac_0321) Accession : YP_664161.1 Strain : Helicobacter acinonychis Sheeba Genome accession: NC_008229 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 273222 - 274868 bp Length : 1647 bp Strand : + Note : High confidence in function and specificity DNA sequence : ATGGAATTTCATCAAATCTATGACCCATTAGGCAATATTTGGATGAGTGCTCTAGTTGCACTCTCGCCTATTGCACTCTT TTTTGTCTCTCTTATTGTCTTTAAGCTTAAGGGGTATAGTGCTGGGTTTTTGAGTTTGGCACTTTCAGTGTTGATCGCGC TATTTGTGTATAAAATGCCTACTGAAATGGTGAGCACGAGTTTTATTTATGGCTTTCTCTATGGCTTATGGCCGATCGCT TGGATCGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATCTT AAGTTTGACCCCAGATCATCGCATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATTGGTT TTGGAGGTCCAGTAGCAATCACAGCAGCGATTTTAGTAGGTCTTGGGCTAAACCCTTTATACGCTGCTGGGTTATGCTTA ATCGCTAATACCGCCCCTGTGGCTTTTGGTGCGGTGGGTATCCCTATTACCGCTATGGCTAGTGTGGTGGGTGTCCCTGA ATTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGCAGGGTGTTGCCCATTTTTTCTATTGGCATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAAGGGCGTTAGAGAAACCTTTCCGGCGGTGGCGGTTACTGGGTTTAGCTTTGCTATCGTGCAATTTTTAAGC TCTAATTATTTGGGACCACAACTCCCAGATATTATTTCAGCTTTAGTGTCATTGATTGCTACCACTTTATTTTTAAAGTT TTGGCAACCTAAAAATATTTTCACTAGCAATGGCAAAGAGCCTACGATTAGCACAGAAAAACACCATATTTGCAAGGTGA TCGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACTATCACGATTATTATATGGACGCAACCTTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGTGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTCAGTTCTATCAGTCAAAAGATTTTCAAAACCGCTCCCAT CGTCGCTGAAGCGAAAAGTTTTCCTGTCGTGTTTAAATTACCTTTAATCTTAACGACAGGCACTTCCATCTTTTTAGCCG CCATTTTGAGCGTGTTTATTTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCAATAGGGGTGTTTGGGACCACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTCTTGGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGTGGCATGAGCGCTACTTTAGCGTT GGCGTTAGCCGATACTGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTTGTAGGCTGGCTTGGAGTGTTTTTAACCGGAAGCG ATACGAGCTCCAACCTTTTATTTGGCTCTTTGCAAATGCTCATCGCCACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTG GCGGCAAACACTTCAGGAGGCGTTGTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGTGCGGCGGTGGGGTT AGTGGGTAAAGAGAGCGAATTGTTCAAATTCACGGTTAAATATTCCCTTGTTTTTGTAGTAATCATGGGAGTTGTGTTCA GCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MEFHQIYDPLGNIWMSALVALSPIALFFVSLIVFKLKGYSAGFLSLALSVLIALFVYKMPTEMVSTSFIYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILSLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGVPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFKGVRETFPAVAVTGFSFAIVQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKFWQPKNIFTSNGKEPTISTEKHHICKVIVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFSSISQKIFKTAPIVAEAKSFPVVFKLPLILTTGTSIFLAAILSVFILRVKISDAIGVFGTTLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFKFTVKYSLVFVVIMGVVFSAIAYLIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 3e-131 | 56 |
