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Name : Patl_2001 (Patl_2001) Accession : YP_661573.1 Strain : Pseudoalteromonas atlantica T6c Genome accession: NC_008228 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : R : General function prediction only COG ID : COG1033 EC number : - Position : 2434888 - 2437203 bp Length : 2316 bp Strand : + Note : KEGG: cps:CPS_2803 putative membrane protein DNA sequence : ATGAGTAATATTATAAAATTTTTAGAATCCTTGATTTTCAAAAACCGTATCGCCGTTCTGTTGCTCTTTTTGGTAGCGAC TATTTTTCTCGGATACCAATCGTCACAACTCCGTCTAGATGCGGGCTTTACCAAGAATATCCCCCTTAATCATGATTACA TGCAAAACTACATGAAGCATGTCAATGATTTTGGTGGTGCGAATAGTATTTTGGTCTCTGTTTGTGACAAAGACGGTGAC ATCTTTAATCAAAACTTTTTTGATACTTTGAAAGACGTACACGATCAGTTATTTTTCATTAATGGTGTTGACCGCTCTTT GGTTAAATCACTCTTTTCATCCTCAACGCGATTTACTGAGATTGTAGAGGGTGGTTTTGCAGGTGGTCCGGTTATCCCTG CTGATTTCAATTCTTCTGAGCAACGTGGCTTAGATAAAGTGTCATCCAATATTGAAAAAGCAGGTATTGTCGGCAGTTTG GTGTCTGATGATTATCAGTGTGCCATGGTCAACGCAAAATTATTGGATTTGGATCCAGAAACGGGTGAGAAGCTTGACAC TCTGGCCTTAGCGGATGAGCTCGAAACTCAGCTTCGTGGTCAGTTTGAAACCGACGATATCTCTATACATATTATTGGCT TTGCAAAGATGATTGGTGATGTGGCCAATGGTGCTAAAGACGTATTGGTGTTTTTTGCCATCGCTATTGCGATTACCGCA GTGCTCGTTTATTTCTTCTGTAAATCGCTGATGTTGACCGTATTACCACTGCTGTGTTCAATCATTGCGGTGATTTGGCA AATGGGGTTGCTCACGTTACTGGGTTTTGGTCTTGACCCCATGTCGATATTAGTGCCTTTCCTCGTTTTTGCGATTGGGA TTAGTCATGGTGTACAAATGATCAATTCTGTCGGTAAAGAGGTCACTAAAGGCAGTTCCTCGTTTGATGCCGCTAAGCTG GCCTTTACCACCTTGTTAATACCTGGTGGCGTGGCGCTACTGTCCGACACGATTGGCTTTATGACATTATTGGTTATTGA TATTGGTATCATTCGCGAGCTTGCTATCACGGCAAGTATGGGTGTGGCGGTAATCATTTTAACGAACCTATTGTTGCTGC CTGTGCTGATGTCTTTCGTTAAATTTAGCGAAAAATATAAGCAAAAATTTGCAGGTAAGGAAAATCGCGCAGATAAGTTT TGGGATGGGATAGCAGCATGCTCTAGCCCGAAAGTGGCGATTGTTATACTCGTTGTCACTGCAGTCTTATTTGGTTTCGG TTGGATGCAAGCCCAAAAAATGAAAATTGGTGATTTGCACGCTGGTGCGCCTGCGCTTCATGCATCGTCTCGTTACAATC AAGACACGTTTTTGATTACTGACAAATATGAAATCAGCACTGATTACATGTCGATTCTGGTCGAAGCGACCAAAGATGCT TGTACTTCATATGACGTGATGAATTCAATTGACGAACTACAATGGCGCATGAGCAATATCGAGGGTGTGCAATCTGCAGT TAGCTTAGCCTCGGTGGCTAAAATTATTAATGCGGGCTACAACGAAGGAAACGCGAAATGGCGCGTACTTCCGCGCAATC AACAGACTTTAGTTCAGGATATCGCGCGGGTTGATACCTCATCTGGTTTGTTAAATGGTGATTGTTCTGTGATGCCGATT ATTCTGTTTATGGAAGATCACAAAGCAGAAACCATTAATCGTGTGGTTGATGCGGTAAAAGCCTATCGTGTTGATTTTGA GACACCTGAATTGCAATTTAAATTAGCCTCTGGGCCAATTGGGGTTATGGCCGCTCAAAATGAAGCGGTTGAAGCATCTC AAGATCCTATGATGTTATACGTGTTCGGGGCCGTTATTCTATTGTGCTTGCTGAGCTTTAAGTCTTTACGTGCAACACTT GCGGTGGTTATTCCTTTGTATGTGGTATCGGTTTTAGCCCAGGCGTTAATGACGTATTTGCAGATTGGTTTAACGGTTTC TACATTGCCGGTTATTGCGCTAGGCGTGGGTATCGGTGTTGATTATGGTATTTATATCTTATCGACTATGAATGCGAAAT TAAAAGCGGGTATGGCTGTGCGTCAAGCGTACTTTGAAGCACTTAAAGAGCGGGGCAGTGCCGTATTGTTTACTGGTGCA ACCTTAGCCGTTGGCGTAAGTACTTGGGTATTCTCATCACTTAAATTCCAAATGGATATGGGAATTTTACTCACGTTCAT GTTTATCGTGAATATGATGGGGGCAATTATTGTATTACCCGCGTTAGCCAGTGTGTTTTGGCGCAAACAAAAATAA Protein sequence : MSNIIKFLESLIFKNRIAVLLLFLVATIFLGYQSSQLRLDAGFTKNIPLNHDYMQNYMKHVNDFGGANSILVSVCDKDGD IFNQNFFDTLKDVHDQLFFINGVDRSLVKSLFSSSTRFTEIVEGGFAGGPVIPADFNSSEQRGLDKVSSNIEKAGIVGSL VSDDYQCAMVNAKLLDLDPETGEKLDTLALADELETQLRGQFETDDISIHIIGFAKMIGDVANGAKDVLVFFAIAIAITA VLVYFFCKSLMLTVLPLLCSIIAVIWQMGLLTLLGFGLDPMSILVPFLVFAIGISHGVQMINSVGKEVTKGSSSFDAAKL AFTTLLIPGGVALLSDTIGFMTLLVIDIGIIRELAITASMGVAVIILTNLLLLPVLMSFVKFSEKYKQKFAGKENRADKF WDGIAACSSPKVAIVILVVTAVLFGFGWMQAQKMKIGDLHAGAPALHASSRYNQDTFLITDKYEISTDYMSILVEATKDA CTSYDVMNSIDELQWRMSNIEGVQSAVSLASVAKIINAGYNEGNAKWRVLPRNQQTLVQDIARVDTSSGLLNGDCSVMPI ILFMEDHKAETINRVVDAVKAYRVDFETPELQFKLASGPIGVMAAQNEAVEASQDPMMLYVFGAVILLCLLSFKSLRATL AVVIPLYVVSVLAQALMTYLQIGLTVSTLPVIALGVGIGVDYGIYILSTMNAKLKAGMAVRQAYFEALKERGSAVLFTGA TLAVGVSTWVFSSLKFQMDMGILLTFMFIVNMMGAIIVLPALASVFWRKQK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | AAK01517.1 | transport protein | Not tested | PAGI-1 | Protein | 5e-127 | 42 |
