Gene Information

Name : YPA_0139 (YPA_0139)
Accession : YP_650053.1
Strain : Yersinia pestis Antiqua
Genome accession: NC_008150
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 167532 - 168911 bp
Length : 1380 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAGAAAAATAATGTTAAGACCAACAAAGCCATTAATATCTTCCGGCATTTCGCAGTCTACCACTGCGGTCTATTGCCG
CCGCCCATATTTTCTTGCTGGGATGACATTACTGATTGGGTTATTTAGCACCTCCGCATGGTCAAACTGCACCCGTATTA
CCGCACAAAATCAGATAAGTTCCAGTGATGGTACCGCCGCTTCATGGTTGGGTTCCAGAGACGATAATAATGGTTCGCTC
AACTTACCCAGTATTGTTGATCTCAGCACCAATGCGAATTTTCAGCCCGATGGCACGTTACTGGCATCAGCAACCTCAGA
CTTTACGACCTTTGCAGTGAATACCGGTTATGCCCTTGACCAGGTCCTCTTTCGCTGTGATGCGGCTGATGTGGATCAGC
TCTATGAGATGTATGCCACTAACGGTGACAGCACTTATGGTGGCAGATATGAAGACGGCACGATTGCAGGCAATGTGTCC
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GAAAGGCCGACGCTTAACCGGGCTTGATACTGACAGTAGCGGACGGATTTTAGTTAAAGCGAAAAATTTCAGTAATGTGT
ATACCGAGCTATTTCGTATTGATTATGCCCGTAGTGGCGCTAACAATACGCCATCTTATCTCTATGGACGTAGTCAGCCC
AATGCCTATATCGCGTTTAAAGGGCCAGGAATTACTGGCCCGATTGAGGGTACTGACTCGTACTCAAACTGGCCCGGTTG
GTATTCTACCTGGCCTGCATCACTTGGTTTGTACAAATACGTCACATTCCGCCGGACCACTATTTGTGCGGTAAGCAACT
TTACCCCGACGGTCGTGTTACCCAGGATTTCGGTGGCAGAACTGAATAATGGGAATACCAGCTCTGCTGATTTTAATGTG
GATTTTCAGTGCCAGACCGGAATTAACTCTGGCGTGACGGCTGGCACAGTGGCGATGGGATTTTTAGTGCCGGCGGCCAA
TGCAGCCAAAGCTCAGGCGCTGGGGTTAATGAACGGCAACGGGGGAGTAAGCCATTTGGTCTCCGATAACTATGGCGCTG
CTGGCACCGCGGGCGGGGTGGGTATTCGCATCTACCGTAACAATAGCCCGATGTATCTACTGTCAAAAAACGTAACTCAG
ACAGGTAACAATGGGGGGTGGTATGGTATCTTACAGGGCGCACAAGAAACCACAGGCAGCGTAGATGGGGGGAACAGTTA
CACCGAAACTTTCCGTGCTGAGTTAAGCAAAATAAGCGGGCAAACAGTGACCGCCGGAGCAGTGAATGCACATGCGCAAG
TGGTTATCCGTGTCCAATAA

Protein sequence :
MRKIMLRPTKPLISSGISQSTTAVYCRRPYFLAGMTLLIGLFSTSAWSNCTRITAQNQISSSDGTAASWLGSRDDNNGSL
NLPSIVDLSTNANFQPDGTLLASATSDFTTFAVNTGYALDQVLFRCDAADVDQLYEMYATNGDSTYGGRYEDGTIAGNVS
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• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cupD4 AAP84168.1 fimbrial subunit Not tested PAPI-1 Protein 9e-74 44