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Name : YPN_3210 (YPN_3210) Accession : YP_649137.1 Strain : Yersinia pestis Nepal516 Genome accession: NC_008149 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ABC-transporter transmembrane protein Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG1132 EC number : - Position : 3632872 - 3634647 bp Length : 1776 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGCCAAGGCAGTCTCTTATGATTAAGTTATCAGGTTTAAGCACGTTAACCGGAGGCCGCTTAAAGGGGCTGAAAGGCAT GGTCAGTATTGCCATCATTGATGCTTTTCTGGCATCGCTACCCTATGCTTTTCTCTATTATATTGTGTTGGATATGTTGT CCTCTCACCCTGATGCCATCTATCAACTTAAACTGACCGGATTTTGTGGGTTATTGATGTTGGTCCGAGTGATATTAGCC AGAGTCCTGTACTTCCATGTCGCAATTATTGGGTTCGATGCAGGGGCTAAAATTCGAATACGTCTTGGTGAGCACCTACG ACGTTTGCCGATGGGTTTTTTCTACCGTTCGGATATGAGCAGTGTCAATAATACGCTGCTAAAAGACATTGATATGATCG AAAATATTTTCACTCATCTCTATGCGCCCATTATTGCGACTGCTTCGGTGCTCTGTTTCTTTTCCTTAGGACTCTTGCTA AAAGATTGGCGCATGGCGTTAGCCATGCTTTCAACGTTACCCTTGGCGGTATGCGCATATATTTTGACTCGTCGTTATGC CCAGCGTTGGCAGGAATATATGCAGCTATTAATGTTTAAACTTAATGATGCATTGATGGAATACATTGATGGCTTAAAAG AGTTAAAAGCTTACCGTATGACAGGGGCCGCTTTTCAGCGGTTATCACAGGTATTAACCACCACCTATCAACAATCATTA ACGGCAGAAAAAGCCGGTGTCTGGCCGATCTACAGTTTTAATGTATTGGTTGAGTGCGGCTTTATTGTGTTGTTGGTTGC ACTCACCTGGGGCTGGGTAGGGGGGAGGATCCCCTTGTCTGAAGTATTGATTTTTTTAATTGCTGCAGTACGGTTTTTCC GTCCTTTACTCAACATGTCGATGTTTTTGGCAGAGCTAAATTACTTTGGGTTAGCCGTAGAGCGAGTCGAAAAGGTTTTT GCTATTCCTGAACTTGTTCATGGTGATTTACAGCCTAATATTACTGATATGCGGATTCGATTGGATAATGTTTGTTTTGC ATATCCGGATAAACCATTGCTATTTAATCATCTCAATCTCACGATAGAGAAAAATAAGATTACTGCATTGGTCGGGCCTT CCGGTTCGGGGAAATCAACACTGGCATCATTAATTGCACGTTTTTGGGATATTGAACAAGGCCATATATTGGTTGGCGAT AAAGCTAATGAAATGAGTCTTGCAGAGATAGATGTGGACTATTGGCAGCGCCATTTAAGCGTAGTCTTCCAAAAAAGCTA TGTGTTAAATGAGACGATCGCCAATAATTTAAGGGTTGCCTGCCCTGATGCGACGAATGAGCAGTTGCTGTCGGTTTGCC GTGCAGCACAACTCTTGCCATTGCTTGATAAGCTCCCCTCAGGGTTAGACACCGAGATCGGGGCGGGTGGTGTGCATCTC TCCGGTGGGGAGTTACAGCGGCTGGCCATTGCCAGAGCTTTATTAAAAGATGCGCCCTTGATTATTTTAGATGAAGCCAC CGCATCACTCGATCCAGAAAATGAACAAGATATTCAGTTGGCAATGCAAGCCTTAATCCGAGGGAAAACCGTGCTGGTGA TTGCGCATAAATTATCTTCTATTCAATATGTCGATCATATTATTGTTATGGATAGCGGGCAGATTGTTGAAGAAGGGGAC CATTCGACACTTATTCAGCATCAAGGGCTTTACGCTGAATTATGGTCATTACAACAGCAAGCACAAGCCTGGCAACCAGG GAGACTGGGTGAATAG Protein sequence : MPRQSLMIKLSGLSTLTGGRLKGLKGMVSIAIIDAFLASLPYAFLYYIVLDMLSSHPDAIYQLKLTGFCGLLMLVRVILA RVLYFHVAIIGFDAGAKIRIRLGEHLRRLPMGFFYRSDMSSVNNTLLKDIDMIENIFTHLYAPIIATASVLCFFSLGLLL KDWRMALAMLSTLPLAVCAYILTRRYAQRWQEYMQLLMFKLNDALMEYIDGLKELKAYRMTGAAFQRLSQVLTTTYQQSL TAEKAGVWPIYSFNVLVECGFIVLLVALTWGWVGGRIPLSEVLIFLIAAVRFFRPLLNMSMFLAELNYFGLAVERVEKVF AIPELVHGDLQPNITDMRIRLDNVCFAYPDKPLLFNHLNLTIEKNKITALVGPSGSGKSTLASLIARFWDIEQGHILVGD KANEMSLAEIDVDYWQRHLSVVFQKSYVLNETIANNLRVACPDATNEQLLSVCRAAQLLPLLDKLPSGLDTEIGAGGVHL SGGELQRLAIARALLKDAPLIILDEATASLDPENEQDIQLAMQALIRGKTVLVIAHKLSSIQYVDHIIVMDSGQIVEEGD HSTLIQHQGLYAELWSLQQQAQAWQPGRLGE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| YPO0770 | YP_002345826.1 | ABC transporter transmembrane protein | Not tested | HPI-2 | Protein | 0.0 | 100 |
