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Name : HPAG1_0139 (HPAG1_0139) Accession : YP_626880.1 Strain : Helicobacter pylori HPAG1 Genome accession: NC_008086 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 147698 - 149353 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGTCAGAATTTCATCAAGTCTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGCTGAGCGCTCTTGTAGCCTTATTGCCGATTTTGTT ATTTTTCTTATCCTTAATGGTTTTCAAGCTCAAAGGTTATGCGGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCTCTGTCAGTCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTTCTTTATGGCTTATGGCCGATC GCATGGATTATTATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCGT CCAATCCATCACTTTAGATCACCGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCG GGTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACAGCAGCGATTTTAGTGGGCTTAGGGTTAAGCCCCTTATATTCTGCCGGATTGTGC CTAATCGCTAATACCGCTCCTGTGGCTTTTGGCGCAGTGGGTATCCCTATAAGCGCTATGGCGAGCGCGGTAGGGGTTCC AGCGATTTTAATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTAGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTGA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTATCGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTATTTAGGGCCAGAATTGCCTGGTATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGCGATTTTTAGAAGCGACGGCAAAGCGGCCTCATTCACTAAGAGTAACCATCATATCTGTAAAA TTTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTGGTTTTAGTGATTGTTTTATGGATACAGCCTTTTTTTAAGGCTTTATTT GAAAAAGACGGCTTATTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGCAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAAGCCAATCAAAGCGTGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTCTCTTAATCAACACGGTTGGTACTTCCATTT TTTTGGCCGCTCTTGTTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTTTTTGGCGAAACCTTGAAA GAAATGCGCTATCCCATTCTTACTATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACGCATACGGGTTTGGCTTTTACTTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTAGGCGTGTTTTTAA CCGGAAGCGATACGAGCTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGGTT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGTACTTTGGGCAAAATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCAGC GGTGGGATTAGCCGGGAAAGAGAGCGATTTGTTCAAATTCACGGTTAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TTGTGATTAGCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MSEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYAAAFLSVALSVIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYSAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAIAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKAIFRSDGKAASFTKSNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVEANQSVSFPVVFKFLLINTVGTSIFLAALVSMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEV LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 6e-97 | 52 |
