Name : HPAG1_1119 (HPAG1_1119) Accession : YP_627860.1 Strain : Helicobacter pylori HPAG1 Genome accession: NC_008086 Putative virulence/resistance : Unknown Product : pyrimidine nucleoside transport protein Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG1972 EC number : - Position : 1178764 - 1180020 bp Length : 1257 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTTTTAGCTCTCTTTTTAGTGTTGTAGGGATGGCGGTGCTTTTTCTTATTGCTTGGGTGTTTTCTAGCAATAAAAG GGCTATTAATTATCGCACGATTGTCAGCGCCTTTGTGATTCAAGTGGCTTTAGGGGCGTTGGCTTTATATGTGCCTTTGG GTAGGGAAATGTTGCAAGGCTTAGCCAGCGGCATACAAAGCGTGATTTCTTACGGCTATGAGGGGGTGCGTTTCTTGTTT GGCAATCTCGCTCCAAACGCTAAGGGCGATCAAGGGATAGGGGGGTTTGTCTTTGCGATCAATGTTTTAGCGATCATTAT CTTCTTTGCTAGCTTGATTTCACTTCTATATTATTTAAAAATCATGCCTTTATTTATCAATCTCATCGGTGGGGCGTTGC AAAAATGCTTAGGCACTTCTAAAGCAGAAAGCATGAGTGCAGCGGCTAATATTTTTGTAGCGCACACCGAAGCGCCCCTA GTCATTAAACCTTATTTGAAAAGCATGAGCGATTCAGAGATTTTTGCGGTCATGTGCGTGGGCATGGCTAGCGTTGCGGG GCCTGTGTTAGCCGGGTATGCGAGCATGGGCATTCCTTTGCCTTATTTAATCGCTGCTTCGTTTATGTCCGCTCCTGGGG GGTTGTTGTTCGCTAAGATCATTTACCCGCAAAACGAAGCCATTTCTAGCCATGCAGATGTTTCTGCAGAAAAGCATGTC AATGCCATAGAAGCTATCGCTAATGGGGCAAGCACAGGGCTAAATTTAGCCTTGCATGTGGGAGCGATGCTTTTAGCCTT TGTGGGAATGCTCGCGCTCATTAACGGGCTTTTAGGGGTTGTAGGGGGGTTTTTAGGCATGGAGCATTTGTCTTTAGGGT TGATTTTAGGCACGCTCTTAAAACCCTTAGCCTTTATGTTAGGCATTCCGTGGAGCCAGGCTGGGATTGCCGGAGAAATC ATAGGTATTAAAATCGCGCTCAATGAATTTGTGGGCTATATGCAGTTATTGCCTTATTTGGGCGATAACCCTCCTTTAGT TTTGAGCGAGAAAACTAAAGCGATCATCACTTTTGCGTTGTGCGGGTTTGCTAACTTAAGCTCAGTCGCTATGCTCATTG GAGGGCTTGGTAGTTTAGTGCCTAAAAAGAAGGATCTCATTATAAGGCTTGCTTTAAAAGCGGTGCTTGTGGGCACGCTT TCTAATTTCATGAGCGCGACTATCGCCGGGTTATTCATAGGGCTAAACGCTCATTAA Protein sequence : MIFSSLFSVVGMAVLFLIAWVFSSNKRAINYRTIVSAFVIQVALGALALYVPLGREMLQGLASGIQSVISYGYEGVRFLF GNLAPNAKGDQGIGGFVFAINVLAIIIFFASLISLLYYLKIMPLFINLIGGALQKCLGTSKAESMSAAANIFVAHTEAPL VIKPYLKSMSDSEIFAVMCVGMASVAGPVLAGYASMGIPLPYLIAASFMSAPGGLLFAKIIYPQNEAISSHADVSAEKHV NAIEAIANGASTGLNLALHVGAMLLAFVGMLALINGLLGVVGGFLGMEHLSLGLILGTLLKPLAFMLGIPWSQAGIAGEI IGIKIALNEFVGYMQLLPYLGDNPPLVLSEKTKAIITFALCGFANLSSVAMLIGGLGSLVPKKKDLIIRLALKAVLVGTL SNFMSATIAGLFIGLNAH |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
yutK | YP_005163383.1 | putative sodium/nucleoside cotransporter | Not tested | Not named | Protein | 2e-50 | 42 |