Gene Information

Name : HPAG1_1119 (HPAG1_1119)
Accession : YP_627860.1
Strain : Helicobacter pylori HPAG1
Genome accession: NC_008086
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : pyrimidine nucleoside transport protein
Function : -
COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism
COG ID : COG1972
EC number : -
Position : 1178764 - 1180020 bp
Length : 1257 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGATTTTTAGCTCTCTTTTTAGTGTTGTAGGGATGGCGGTGCTTTTTCTTATTGCTTGGGTGTTTTCTAGCAATAAAAG
GGCTATTAATTATCGCACGATTGTCAGCGCCTTTGTGATTCAAGTGGCTTTAGGGGCGTTGGCTTTATATGTGCCTTTGG
GTAGGGAAATGTTGCAAGGCTTAGCCAGCGGCATACAAAGCGTGATTTCTTACGGCTATGAGGGGGTGCGTTTCTTGTTT
GGCAATCTCGCTCCAAACGCTAAGGGCGATCAAGGGATAGGGGGGTTTGTCTTTGCGATCAATGTTTTAGCGATCATTAT
CTTCTTTGCTAGCTTGATTTCACTTCTATATTATTTAAAAATCATGCCTTTATTTATCAATCTCATCGGTGGGGCGTTGC
AAAAATGCTTAGGCACTTCTAAAGCAGAAAGCATGAGTGCAGCGGCTAATATTTTTGTAGCGCACACCGAAGCGCCCCTA
GTCATTAAACCTTATTTGAAAAGCATGAGCGATTCAGAGATTTTTGCGGTCATGTGCGTGGGCATGGCTAGCGTTGCGGG
GCCTGTGTTAGCCGGGTATGCGAGCATGGGCATTCCTTTGCCTTATTTAATCGCTGCTTCGTTTATGTCCGCTCCTGGGG
GGTTGTTGTTCGCTAAGATCATTTACCCGCAAAACGAAGCCATTTCTAGCCATGCAGATGTTTCTGCAGAAAAGCATGTC
AATGCCATAGAAGCTATCGCTAATGGGGCAAGCACAGGGCTAAATTTAGCCTTGCATGTGGGAGCGATGCTTTTAGCCTT
TGTGGGAATGCTCGCGCTCATTAACGGGCTTTTAGGGGTTGTAGGGGGGTTTTTAGGCATGGAGCATTTGTCTTTAGGGT
TGATTTTAGGCACGCTCTTAAAACCCTTAGCCTTTATGTTAGGCATTCCGTGGAGCCAGGCTGGGATTGCCGGAGAAATC
ATAGGTATTAAAATCGCGCTCAATGAATTTGTGGGCTATATGCAGTTATTGCCTTATTTGGGCGATAACCCTCCTTTAGT
TTTGAGCGAGAAAACTAAAGCGATCATCACTTTTGCGTTGTGCGGGTTTGCTAACTTAAGCTCAGTCGCTATGCTCATTG
GAGGGCTTGGTAGTTTAGTGCCTAAAAAGAAGGATCTCATTATAAGGCTTGCTTTAAAAGCGGTGCTTGTGGGCACGCTT
TCTAATTTCATGAGCGCGACTATCGCCGGGTTATTCATAGGGCTAAACGCTCATTAA

Protein sequence :
MIFSSLFSVVGMAVLFLIAWVFSSNKRAINYRTIVSAFVIQVALGALALYVPLGREMLQGLASGIQSVISYGYEGVRFLF
GNLAPNAKGDQGIGGFVFAINVLAIIIFFASLISLLYYLKIMPLFINLIGGALQKCLGTSKAESMSAAANIFVAHTEAPL
VIKPYLKSMSDSEIFAVMCVGMASVAGPVLAGYASMGIPLPYLIAASFMSAPGGLLFAKIIYPQNEAISSHADVSAEKHV
NAIEAIANGASTGLNLALHVGAMLLAFVGMLALINGLLGVVGGFLGMEHLSLGLILGTLLKPLAFMLGIPWSQAGIAGEI
IGIKIALNEFVGYMQLLPYLGDNPPLVLSEKTKAIITFALCGFANLSSVAMLIGGLGSLVPKKKDLIIRLALKAVLVGTL
SNFMSATIAGLFIGLNAH

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
yutK YP_005163383.1 putative sodium/nucleoside cotransporter Not tested Not named Protein 2e-50 42