|
Name : recG (MGAS2096_Spy1546) Accession : YP_601142.1 Strain : Streptococcus pyogenes MGAS2096 Genome accession: NC_008023 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : 3.6.1.- Position : 1490873 - 1492888 bp Length : 2016 bp Strand : - Note : catalyzes branch migration in Holliday junction intermediates DNA sequence : ATGATATTAACAGCTCCTATGTCCAACTTAAAGGGATTTGGACCAAAATCAGCAGAAAAATTTCAGAAATTAGATATTTA TACAGTAGAAGATTTACTGCTTTATTATCCGTTTCGCTATGAAGATTTTAAATCAAAATCTGTTTTTGATTTAGTGGATG GTGAAAAAGCAGTCATTACAGGCTTAGTCGTTACTCCAGCTAATGTACAATATTATGGTTTTAAACGTAACCGTTTAAGT TTCAAATTGCGTCAAGGGGAAGCTGTCTTAAATGTTAGTTTTTTTAATCAACCCTATTTAGCTGATAAAATAGAACTTGG TCAAGAGGTAGCTGTTTTTGGTAAATGGGATGCCACTAAATCGGCTATTACTGGGATGAAGGTTTTAGCTCAAGTTGAAG ATGACATGCAACCTGTTTATCGCGTAGCTCAGGGAATTTCACAGTCTACTTTGATTAAAGCTATTAAGTCAGCTTTTGAA ATCGATGCGCATTTGGAATTGAAGGAAAATTTACCAGCTACTTTATTGGAAAAATACCGATTGATGGGTCGTAGTCAGGC TTGTTTAGCTATGCATTTCCCAAAAGATATCACAGAGTATAAGCAAGCGCTCCGTCGGATTAAATTTGAAGAATTATTTT ACTTTCAAATGAACCTTCAAGTTTTGAAAGCCGAAAATAAATCTGAAACAAATGGTTTGCCTATTCTTTATAGTAAACAT GCTATGGAGACAAAGATTTCCTCTTTACCCTTTATTCTAACAAATGCTCAAAAGCGCTCTTTAGATGACATATTATCTGA TATGTCATCGGGAGCTCATATGAATCGTTTATTGCAAGGAGATGTAGGATCAGGAAAGACAGTCATTGCTGGTCTATCAA TGTATGCAGCTTATACAGCAGGTTTTCAATCGGCTTTGATGGTTCCAACGGAAATCCTAGCTGAACAACACTACATTAGT CTGCAAGAGTTATTTCCAGATCTATCAATTGCTATATTAACTTCGGGTATGAAAGCCGCTGTCAAGCGTACGGTTTTAGC AGCTATTGCAAATGGCTCAGTGGATATGATTGTAGGAACTCATGCTCTTATCCAAGACTCGGTACAGTACCATAAACTGG GGCTTGTCATTACAGACGAGCAACATCGTTTTGGTGTTAAACAGCGTAGAATTTTCCGTGAAAAGGGAGAAAATCCTGAT GTTTTAATGATGACAGCCACCCCAATTCCCCGAACTCTAGCAATCACAGCTTTTGGAGAAATGGATGTTTCTGTTATTGA TGAATTACCTGCCGGTCGTAAACCTATTATGACACGCTGGGTGAAACACGAGCAGCTAGGGACTGTGTTGGAATGGGTAA AAGGTGAATTGCAAAAAGATGCTCAAGTGTATGTCATTTCACCGTTGATTGAAGAATCAGAAGCTTTAGATTTAAAGAAT GCAGTAGCATTGCATGCCGAATTATCTACTTATTTTGAAGGAATTGCTAAGGTTGCTCTTGTACATGGACGTATGAAAAA TGATGAAAAAGATGCCAGAATGCAAGATTTCAAGGATAAAAAAAGTCATATTTTAGTATCCACAACAGTTATTGAAGTAG GGGTAAATGTCCCAAATGCAACGATCATGATTATTATGGATGCCGATCGTTTTGGATTAAGTCAGTTACATCAACTTCGT GGGCGTGTTGGTCGTGGATATAAACAATCATACGCTGTTTTAGTGGCTAATCCCAAAACTGATTCGGGGAAAAAACGAAT GACAATCATGACAGAAACGACAGATGGTTTCGTTTTAGCTGAGTCGGATTTAAAAATGCGTGGTTCTGGTGAAATCTTTG GTACTCGTCAGTCTGGAATTCCAGAATTTCAAGTAGCTGATATCGTTGAGGATTATCCTATTTTAGAAGAAGCACGCAAA GTTTCTGCAGCGATTGTTTCTGATCCTAACTGGATATATGAAAAACAGTGGCAATTAGTGGCACAAAATATTAGAAAAAA AGAAGTTTATGATTAA Protein sequence : MILTAPMSNLKGFGPKSAEKFQKLDIYTVEDLLLYYPFRYEDFKSKSVFDLVDGEKAVITGLVVTPANVQYYGFKRNRLS FKLRQGEAVLNVSFFNQPYLADKIELGQEVAVFGKWDATKSAITGMKVLAQVEDDMQPVYRVAQGISQSTLIKAIKSAFE IDAHLELKENLPATLLEKYRLMGRSQACLAMHFPKDITEYKQALRRIKFEELFYFQMNLQVLKAENKSETNGLPILYSKH AMETKISSLPFILTNAQKRSLDDILSDMSSGAHMNRLLQGDVGSGKTVIAGLSMYAAYTAGFQSALMVPTEILAEQHYIS LQELFPDLSIAILTSGMKAAVKRTVLAAIANGSVDMIVGTHALIQDSVQYHKLGLVITDEQHRFGVKQRRIFREKGENPD VLMMTATPIPRTLAITAFGEMDVSVIDELPAGRKPIMTRWVKHEQLGTVLEWVKGELQKDAQVYVISPLIEESEALDLKN AVALHAELSTYFEGIAKVALVHGRMKNDEKDARMQDFKDKKSHILVSTTVIEVGVNVPNATIMIIMDADRFGLSQLHQLR GRVGRGYKQSYAVLVANPKTDSGKKRMTIMTETTDGFVLAESDLKMRGSGEIFGTRQSGIPEFQVADIVEDYPILEEARK VSAAIVSDPNWIYEKQWQLVAQNIRKKEVYD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 3e-94 | 44 |
