Gene Information

Name : aufB (UTI89_C3935)
Accession : YP_542895.1
Strain : Escherichia coli UTI89
Genome accession: NC_007946
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : Auf fimbiral chaperone 1
Function : -
COG functional category : N : Cell motility
COG ID : COG3121
EC number : -
Position : 3824245 - 3825024 bp
Length : 780 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence : 
ATGTTATTTCATCAACAAGGATGCTGTATGAAATGTATTATTGGAAATAAAAAATGGGTTTGTGGATTCAGGGATGAATT
AAAAGTATCACAAAATATTATACGCTCAGGGATTCTTTTTTTACTATCGATATTATTTATTAATAATGCGTCCGCGGGCG
GGTTTGGCCTTGGCGTAACGCGATTGATTTATCCGGCAGAAAGTAAGCAAATAACACTCAGTGTGCAAAATAGCGGTGAC
AACACCAGTTATTTAATTCAATCATGGGTTGATGACAGTAAAACGGAAAAAAAGAGCCAGGATTTTGTTATCACTCCTCC
CCTCTTTATGTTGCCAACGCGTAAAGAAGCTTCATTACGTATCATGTTTCTTGGTAAGACTAATTTGCCGACCGATCGTG
AAACTTTGTATTGGATGAATGTTAAAGCAATTCCGCCAACAGATGAGAAAAATACACAGAAGAATACCTTACAGTTGGCA
TTACAAAACAAAATCAAGCTATTTTATCGCCCGGAAAATCTACCTGTGCAACCAGGAAAAGCACGAAATATGTTGCGGTT
TAAGTATGAGGGAAAACAACTAAAAGTTATCAATCCTTCGCCTTATTACCTGACACTGACAGGAATTAAAGTACAAGGGA
GTAAATTGCCCAATATGTTTGTACCACCGAAAAGTGATATTACGGTCTCGTCGCCAGTGACGTTGGCTGGTGAAATTACT
TATCAAACAATTAATGACTTTGGCGCTACGACGGAGCGGCAGAAAGGAATAATGCAGTAA

Protein sequence : 
MLFHQQGCCMKCIIGNKKWVCGFRDELKVSQNIIRSGILFLLSILFINNASAGGFGLGVTRLIYPAESKQITLSVQNSGD
NTSYLIQSWVDDSKTEKKSQDFVITPPLFMLPTRKEASLRIMFLGKTNLPTDRETLYWMNVKAIPPTDEKNTQKNTLQLA
LQNKIKLFYRPENLPVQPGKARNMLRFKYEGKQLKVINPSPYYLTLTGIKVQGSKLPNMFVPPKSDITVSSPVTLAGEIT
YQTINDFGATTERQKGIMQ

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
fim2C AFH78430.1 putative fimbrial chaperone protein Virulence KpGI-5 Protein 2e-46 47
sfaE CAC16952.2 SfaE protein Virulence PAI III 536 Protein 3e-45 47

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
aufB YP_542895.1 Auf fimbiral chaperone 1 VFG0911 Protein 1e-45 48
aufB YP_542895.1 Auf fimbiral chaperone 1 VFG1644 Protein 2e-45 47
aufB YP_542895.1 Auf fimbiral chaperone 1 VFG0875 Protein 6e-50 46
aufB YP_542895.1 Auf fimbiral chaperone 1 VFG0445 Protein 3e-48 45
aufB YP_542895.1 Auf fimbiral chaperone 1 VFG0455 Protein 3e-37 41