Gene Information

Name : aufC (UTI89_C3934)
Accession : YP_542894.1
Strain : Escherichia coli UTI89
Genome accession: NC_007946
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : outer membrane usher protein AufC
Function : -
COG functional category : N : Cell motility
COG ID : COG3188
EC number : -
Position : 3821614 - 3824208 bp
Length : 2595 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
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ATCCTGTTAGCTATGCAACTCTGGAGTGCCGCTAA

Protein sequence :
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• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
fim2D AFH78429.1 putative fimbrial usher protein Virulence KpGI-5 Protein 4e-172 46
sfaF CAC16953.2 SfaF protein Virulence PAI III 536 Protein 8e-171 44

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
aufC YP_542894.1 outer membrane usher protein AufC VFG0446 Protein 2e-173 47
aufC YP_542894.1 outer membrane usher protein AufC VFG0876 Protein 0.0 46
aufC YP_542894.1 outer membrane usher protein AufC VFG1645 Protein 5e-171 44
aufC YP_542894.1 outer membrane usher protein AufC VFG0912 Protein 2e-170 44
aufC YP_542894.1 outer membrane usher protein AufC VFG0454 Protein 1e-161 43