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Name : gabD (RBE_0336) Accession : YP_537506.1 Strain : Rickettsia bellii RML369-C Genome accession: NC_007940 Putative virulence/resistance : Unknown Product : succinate semialdehyde dehydrogenase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1012 EC number : 1.2.1.16 Position : 376128 - 377519 bp Length : 1392 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATTTACTAGCAAGTATTACCGGCAAGAATTATGTAAACGGGAAGTTTATAACTGCTTCAAAGCAAGTTTCGGTTGT TAATCCTTCGACTTTAAAAGAAATTGCAACTGTGCCGAATTTGGAATTATCAGAAATTAATTCTGCAATAGATAACACAG TGCAAACCTTTTCAGCATGGTCGCAAAGTTTTTTTGAGGAAAGAATAGCGATTCTACGCAAATGGCATGCTTTAGTGATC GAAAATATTGATGAGCTAAGTCATATATTAACCTTAGAGCAGGGGAAAATACTTGCTGAATCAAAAAAAGAAATCCTATA TGGGGCATCTTTTATTAATTGGTATACATATGCAATTCATAATATTCATTCTGTTGTAAAGCCTGGCAATAACAAGAATC ATAAAATCGTTACGCATTATGAGCCTGTTGGTCCAGCTGCTGCTATAACACCTTGGAATTTCCCAAATGCCATGATTACC CGCAAGGTAGTTCCTGCAATAGCAGCCGGTTGCAGCGTTATATTAAAGCCGTCAAGTCTTACACCGCTTTCGGCTTTAGT ACTAGCAAAGTTAGCTTACGACGCCGGATTGCCGGCAGGAGTGTTTAACGTTATTACTGGTGATTCTAACATTATCGGTA AAGCTTTTTGTGAAGATTTTAGACTGCGTAAATTATCGTTTACTGGTTCTACAAATGTTGGCAAAATTCTATATCAAGCT TCGGCAAATACTGTAAAGCGTTTATCTTTAGAGCTTGGCGGTAATGCTCCTTTCATTATAACAGCTGATAATGATCTAGA AAAAGTCGCAGATGATTTGGTTATTTCTAAGACTCGAAATAGCGGACAGTCTTGCACTTCCCCTAATAGAATATTTGTAG AAGAATCTATATATGAAAAATTTATAGAAATTCTAACTCCTAAATTTAACAAACTTAAAGCAGGCGACGGATTTGATAAC GCATCGGATGTAGGTCCACTAATTAATTCTGCTGCTATAGAGAAAATCCAAAAATTGCTTGCCGATGCTCAAAATAGAGG GGCTAAGTTAATTTGCGGTGGTAAGGCTAATAATAATTTCATTGAGCCAACTATTATTATTGATTGTTTAGATAATATGG ATATCTTTAAAACGGAAATATTCGGTCCGGTAATTGCTTGCTATAAATTTAAGAGTTTAGACGAGGTAATAGAGCGTGCT AATAATACCGAATATGGCTTGCAAGGATATGTATATTCGCAGAATTTAAGCGTTGCTAAGATGATGGCAACAAAGCTTGA TTTCGGTATGATATCGATTAATGATCCGCTGCCGGCTAATGCTAAAGCTCCTTTTGCGGGGCGTAAAGCGTCAGGTTTTG GAGTTGAAGGATCATTTGAAGGAATTATTTGA Protein sequence : MNLLASITGKNYVNGKFITASKQVSVVNPSTLKEIATVPNLELSEINSAIDNTVQTFSAWSQSFFEERIAILRKWHALVI ENIDELSHILTLEQGKILAESKKEILYGASFINWYTYAIHNIHSVVKPGNNKNHKIVTHYEPVGPAAAITPWNFPNAMIT RKVVPAIAAGCSVILKPSSLTPLSALVLAKLAYDAGLPAGVFNVITGDSNIIGKAFCEDFRLRKLSFTGSTNVGKILYQA SANTVKRLSLELGGNAPFIITADNDLEKVADDLVISKTRNSGQSCTSPNRIFVEESIYEKFIEILTPKFNKLKAGDGFDN ASDVGPLINSAAIEKIQKLLADAQNRGAKLICGGKANNNFIEPTIIIDCLDNMDIFKTEIFGPVIACYKFKSLDEVIERA NNTEYGLQGYVYSQNLSVAKMMATKLDFGMISINDPLPANAKAPFAGRKASGFGVEGSFEGII |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf17 | AAO17183.1 | Orf17 | Not tested | tcd island | Protein | 3e-90 | 48 |
