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Name : recG (LSL_0622) Accession : YP_535515.1 Strain : Lactobacillus salivarius UCC118 Genome accession: NC_007929 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : 3.6.1.- Position : 665280 - 667310 bp Length : 2031 bp Strand : + Note : COG1200 [LK] RecG-like helicase DNA sequence : GTGAATTTGGGTGATTCAGTCGGAGTTTTACGAGGTGTTGGTCCTAAGAAAATACAGGCTCTTAATAAATTAGGAGTTAA TACGATTGAAGATTTATTGACATTCTATCCTTTTAGATATAATGATATTGCGGTCAAAAATTTAGAAGAGATAAATAGTC AAGAAAAAGTTACGCTGAAAGGAATAGTGGCATCTGAACCTGTTTTAGTAAGATTTGGTAGAAAAAAGAGTAGGTTAAAT TTTAAGTTATTAATCAATCATGATGTGATAGGTGTAACGTTTTTTAATCAACCATGGATATCAAAACAGGTAACTACAGG ACAAGAACTAGCTGTATATGGTAAATATGATGCTTTGAGGCAAAGTTTATCTGGCATAAAGATAATCTCTAGAAAGACTA ATGATTTTGTGGGAGTATATCGTTCGTCTAAAGATATCAAGGAAAGTATAATTAAGCAGTTAGTAAAACAAGCATATGAT GAATATAATTCTTATATTAAAGATGTTGTTCCTGAAAGCATTCGTATAAAATATCGTTTAGAGAATAGAAAGCAAATGAT TCATGATATACATTTTCCTTCGACGAAAAAAGAGGCAGATTTGGCTAGAAGAAGTGCAATATTTGATGAATTTTTTAGTT TTGAAGCTGGTCTTCAACTTTTAAAAAGGGATAATCATAAAAATATGGGGTTGAGGATTAAGTATAATAATGAGAAATTG AAAGAGTTCATTAAAGGATTGCCTTTTGAATTAACGAAAGCACAAAAAAGAGTAGTAAATGAAATTTGTGCAGATATGTT AAGTCCAAATCATATGAATAGATTGCTACAGGGTGATGTTGGATCCGGTAAGACTATTATTGCTGCAATTGCTATGTATG CTACAGTAACTGCAGGTTTTCAAGCAGTATTAATGGCTCCAACGGAAATATTAGCTCAGCAACATGCAGAAAAATTAGCT AATTTATTTGAGCAATATGGGATAAGTGTAGCTTTAATGACAAGTTCTTCATTGAGCAGAGTAAAAGTTAAGAGAGAATT ATTAAAGCATTTAAAAAATGGTGATATTGATATTGTCATTGGAACACATGCTGTTATCCAAGATAATATTGAATTTCACA ATTTAGGATTAGCTATAACTGATGAACAACACAGGTTTGGTGTTAATCAGAGAAGAATTTTAAGGAAAAAAGGAGTTAAT CCTGAAATTTTAGCTATGACTGCTACTCCTATCCCTCGTACATTAGCAATCACTACGTACGGTGAGATGGATGTGTCTAT AATAGATGAACTTCCAAAAGGGAGACAACCTGTTAAAACAAGCTGGGTTAAGAAGAAACAAGTAAAAAATGTATTTGAAT TCGTTAAAAGACAGCTCGAATTAGGAACACAAGCCTATATTATTTCCCCTTTGGTAGAAGAATCTGAATTATTAGATTTA CAAAATGCAGAAGAAGTTTTTGAGAAGGCAAAAGAATACTTTGGTTCTGAAAAAGTAGCATTATTACATGGGAAGATGGA TGCTAATGAAAAAGAGCAGGCCATGCAAGCTTTTAAAAATAAAGAGGTTTCCATCCTTGTTTCTACGACTGTTATTGAGG TAGGGGTAGATGTTCCTAACGCTACTGTAATGATCATTTTGGATGCAGATAGATTTGGTCTAGCTCAATTACACCAACTT CGCGGAAGGGTAGGACGTGGTAGTAAGGAATCATATTGTATTTTAGTGGCAGATCCTAAGAGTGAGTATGGTAAAGAACG TATGAAAATAATGACGGAAACTAATGATGGATTCTTAATTTCGCAAAAAGATTTAGAATTGCGAGGTCCTGGTGAAGTTC TAGGGAAAAAGCAGTCAGGTTTACCTGAATTTAAAGTGGGGGATCCAGTAGTAAATTTGAATATATTACAAGTTGCTCAA GAGGAAGCTCATAATGTTGTTTTTAGTCCTAATTTTGAAACAAAGGAAGAGAATTTTGAATTAATCAAGTATTTGAATAG ACAGTTTGCCCAAGAGGAAATTATTGATTAG Protein sequence : MNLGDSVGVLRGVGPKKIQALNKLGVNTIEDLLTFYPFRYNDIAVKNLEEINSQEKVTLKGIVASEPVLVRFGRKKSRLN FKLLINHDVIGVTFFNQPWISKQVTTGQELAVYGKYDALRQSLSGIKIISRKTNDFVGVYRSSKDIKESIIKQLVKQAYD EYNSYIKDVVPESIRIKYRLENRKQMIHDIHFPSTKKEADLARRSAIFDEFFSFEAGLQLLKRDNHKNMGLRIKYNNEKL KEFIKGLPFELTKAQKRVVNEICADMLSPNHMNRLLQGDVGSGKTIIAAIAMYATVTAGFQAVLMAPTEILAQQHAEKLA NLFEQYGISVALMTSSSLSRVKVKRELLKHLKNGDIDIVIGTHAVIQDNIEFHNLGLAITDEQHRFGVNQRRILRKKGVN PEILAMTATPIPRTLAITTYGEMDVSIIDELPKGRQPVKTSWVKKKQVKNVFEFVKRQLELGTQAYIISPLVEESELLDL QNAEEVFEKAKEYFGSEKVALLHGKMDANEKEQAMQAFKNKEVSILVSTTVIEVGVDVPNATVMIILDADRFGLAQLHQL RGRVGRGSKESYCILVADPKSEYGKERMKIMTETNDGFLISQKDLELRGPGEVLGKKQSGLPEFKVGDPVVNLNILQVAQ EEAHNVVFSPNFETKEENFELIKYLNRQFAQEEIID |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 6e-98 | 43 |
