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Name : treC (LSL_1514) Accession : YP_536401.1 Strain : Lactobacillus salivarius UCC118 Genome accession: NC_007929 Putative virulence/resistance : Unknown Product : trehalose-6-phosphate hydrolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.93 Position : 1570828 - 1572489 bp Length : 1662 bp Strand : + Note : COG0366 [G] Glycosidases DNA sequence : ATGACAAAACTTGGTCAAAAAGTAATTTATCAAATTTATCCTAAGTCATTTTACGATTCTAATAATGATGGTTTTGGAGA TTTGAAGGGAATTATTGCTAAGATTGACTATTTGAAGAAACTTAATATTGATATGATTTGGTTCAATCCTTTTTATGTTT CTCCGCAAAATGATAATGGATATGATATCGCTGATTACTATAAGATAGATGAACGTTTTGGTACTATGGAAGACTTTGAA GAAATGGTAGCTAAGCTAAAAGAAGCTAATATTGGTGTAATGTTGGATATGGTATTAAATCACTGTTCCACTGAACACGA ATGGTTCCAAAAAGCTTTGGCTGGCGATGAAAAGTACCAAAAATACTTCTACCTTCGTCCTGCTAAAGAAGATGGTTCAT TACCAACTAACTGGCAATCTAAATTCGGTGGCCCTGCATGGGAAAAATTTGGTGATACAGATTTATACTATCTTCATTTA TATGATAAGACTCAAGCTGATTTGGACTGGCATAATCCAGACGTACGTGCTGAAGCAGCTAAAATCGTCAACTTCTGGAA AGAAAAAGGTGTTGCTGGCTTTAGATTTGACGTGCTTAATGTAATTGGAAAAGATGAAGTATTGGTAGATTCTGTAGATC CAGATCATGAAAAACCGCTATATACTGATACTCCAGTTGTTCATAAGTATATTAAGGAACTCAACCGTAATACTTTTGGG ACAGATCCTGAAATCGTAACTGTTGGGGAAATGTCATCAACAACTATCCCTAACTCGATTGAATATACAAATCCAGATGA ACATGAATTATCTATGGTCTTCACTTTCCATCATTTGAAAGTTGATTACGATAACGGTGAAAAATGGAGCAAGGTTCCAT TTAACTTTATGGAATTAAAATCCCTATTATCTACTTGGCAAACAGAAATGGATAAAGGCAATGGCTGGAATGCATTATTC TGGAACAATCATGATCAACCTTGGGCATTAAATCGTTTTGGCGATCCCGTAAACTACCGTGAAAAATCAGCTGAAATGCT AGCAACTACCCTACACTTACTTCGTGGTACTCCTTATATCTACATGGGAGAAGAATTAGGTATGATGGATCCTCATTATA AGTCTATTGATGATTATGTTGACGTTGAAGCTTTAAACGGTTATCAAATGTTACTTGATAAGGGTGTAGACAAGGATCGC GCTTTTGAAATTGTTGTTTCTAAGTCACGTGATAATTCCCGTGTCCCTATGCATTGGGATGATAGTAAATATGCTGGCTT TAGTGAAGCAAAACCTTGGTTAATACCTACTGATCAAGATGAAATTAATGTAGAAAAAGAATTAACTAGTGGCGAAATCT TTAATCACTATCAAAAATTGATTAAATTAAGAAAAACAGAACCACTTATCTACGCTGGTCATTTCAAAGAATTATTGGCA GATAATAAACAAGTCTTTGCTCATGAACGTTATCTAGATAATTCTCCTGAAAAGTTAGTTGTCTTCAATAACTTCTATGG TACTGAAGTTACAGTTGATTTACCAGCTGAATATCAAGATAAGGACTGCACAACGCTTGTCGATAATTACCAAAATGAGA TTCAAAAGACTGCAAAACAAATTACACTACAGCCTTATGAATCTTTAGCAATTAAAATTTAA Protein sequence : MTKLGQKVIYQIYPKSFYDSNNDGFGDLKGIIAKIDYLKKLNIDMIWFNPFYVSPQNDNGYDIADYYKIDERFGTMEDFE EMVAKLKEANIGVMLDMVLNHCSTEHEWFQKALAGDEKYQKYFYLRPAKEDGSLPTNWQSKFGGPAWEKFGDTDLYYLHL YDKTQADLDWHNPDVRAEAAKIVNFWKEKGVAGFRFDVLNVIGKDEVLVDSVDPDHEKPLYTDTPVVHKYIKELNRNTFG TDPEIVTVGEMSSTTIPNSIEYTNPDEHELSMVFTFHHLKVDYDNGEKWSKVPFNFMELKSLLSTWQTEMDKGNGWNALF WNNHDQPWALNRFGDPVNYREKSAEMLATTLHLLRGTPYIYMGEELGMMDPHYKSIDDYVDVEALNGYQMLLDKGVDKDR AFEIVVSKSRDNSRVPMHWDDSKYAGFSEAKPWLIPTDQDEINVEKELTSGEIFNHYQKLIKLRKTEPLIYAGHFKELLA DNKQVFAHERYLDNSPEKLVVFNNFYGTEVTVDLPAEYQDKDCTTLVDNYQNEIQKTAKQITLQPYESLAIKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 1e-105 | 43 |
