|
Name : leuS (FTL_1212) Accession : YP_513895.1 Strain : Francisella tularensis LVS Genome accession: NC_007880 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0495 EC number : 6.1.1.4 Position : 1159980 - 1162421 bp Length : 2442 bp Strand : - Note : leucine--tRNA ligase; LeuRS; class-I aminoacyl-tRNA synthetase; charges leucine by linking carboxyl group to alpha-phosphate of ATP and then transfers aminoacyl-adenylate to its tRNA; due to the large number of codons that tRNA(Leu) recognizes, the leucyl DNA sequence : ATGAATGAATATAATTTTAGTGATATAGAAAAATCGACACAAGAGTATTGGCGTAAAAATGATACTTTTAAAACAATAGA AGATAATACTAAAGAAAAATTTTATTGTCTTTCAATGTTACCCTACCCAAGTGGTACTCTACACATGGGACATGTAAGAA ATTACACGATAGGTGATGTCATAGCTAGATATCAAAAAATGCAAGGTAAAAACGTCCTTCATCCTATGGGTTGGGATGCC TTTGGTCTACCTGCAGAAAATGCAGCGATTAAGCACAAAAAATCACCATACGAATGGACAAAAAGTAATATTGCTTACAT GAGATCGCAGTTTGACTCTCTAGGCTTTAGTTTTGACTGGTCAAGAGAGATTGCAACTTGTGATGAAGATTACTATAAAT GGGAGCAATGGTTTTTTATTCAGCTATACAAAAAAGGTTTAGCATATCGTAAAAATTCAGTCGTTAACTGGGATCCGGTT GATCAAACAGTTTTAGCAAATGAACAAGTTGTTGATGGTAGAGGTTGGAGATCTGGTGCATTAGTTGAGAAAAAAGAAAT TCCTCAATGGTTTTTGAAAATTACCGATTATGCTGACGAGCTTTTGCAAGATATCAACAAATTAGATAATTGGCCAGAGG CTGTTAAAACTATGCAAATTAACTGGATTGGTAAATCCAAAGGTTTAACAGTTAAGTTTAAGGTTAAAGACTCTAATCAA GAAATAGAGGTTTTCACAACTCGTCCAGATACTCTTATGGGAGTGAATTATCTTGGAATAGCTCCTGAGCACCCTCTTGC TCTTAAAGAAGCTAAGTCTAATTCTCAATTGGCAGCATTTATCGAAGAGTGTAAAAAAACTTCAACCATGGAAGCTGATC TTGCTACTCAAGAAAAGAAAGGATTTAAGACATCTATTAAAGTGATTCATCCTATTTCTGCTGAAACTATAGATGTTTGG GTAGCTAATTTTGTGCTTATGGGATATGGTTCTGGTGCAGTTATGTCTGTGCCAGCTCACGATCAAAGAGATTGGGAATT TGCACAAAAATATAATATACCATTAAAACAAGTTATAGAGTCTAATGATAACAAGTTAAAAATTGATTTAGAAAAACAAG CTTTCACAGAAAAAGGTATTTTGATTAACTCAGGTGAATTTGATGGTCTAAACTTTAAAAATGCTTATCAGGCTATTAAG AAATATCTTACAAAGCAAAATAAAGGTTATGAGACTACTAATTTTAGAATTCATGATTGGGGTATTTCACGTCAAAGATA TTGGGGTTGCCCTATTCCTATGATTCATTGCGACGATTGTGGTGCTGTACCAGAAAAAGAAGAGAACTTACCAGTAAGGT TACCTACTGATGTAGCCTTAACAGAAGCAGGCTCACCACTTAAAGATATTCCAGAGTTTATAAATGTAGCTTGTCCAGAA TGTGGTAAACCAGCAAAGCGTGAAACTGATACATTTGATACATTTTTTGAGTCATCTTGGTATTATGCAAGATATACTTG CCCTACCTCTAATCAGATGCTTGACCAAGAAGCTAACTATTGGTTACCAGTTGATAAATATATTGGTGGTATTGAGCATG CTATTATGCATTTATTATATGCAAGATTCTTCCATAAATTAATGAGAGATCAAGGTTTAGTAAAGTCTGATGAACCTTTT AAGAACCTTCTTACGCAAGGGATGGTGTTAAAAGATGGTGCAAAAATGTCTAAGTCTAAAGGAAATATTGTAGATCCTCA AGAGCTTATTGATAAATATGGAGCAGATACTGTAAGATTATTTAGTATGTTTGCTGCATCGCCTGAACAATCACTTGAAT GGTCTGAAACAGGTGTCGAAGGAGCAAATAAATTTCTACGCAAAGTTTTTAATTATGCCGAACTAAATAAAGTTATATTT GCCAAAAATATAACGCTAGAGTCTCAGAAACTTACAAAAGAAGATAAAAAAGCACGTTTTGAAATACACTCTAACCTAAA GCAAGCTATTTTTGATTTTGATAAGAGTCAGTTTAATACTGTAGTATCTGCTTGTATGAAAATTTTAAATACTCTTAATA ACTATGATAACCTCTCTGAAAGTGTAAAGGTTGAGGGATTTAGCATTTTATTAAGAATTCTAGCGCCATTTACTCCTCAC TTATGTCATTATCTATGGCAACAATTAAATTTAGGAGAAGATATACTTCATACTAGCTTCCCAACAGTTGATAATAATGC TCTAGAAAAAGATGAGTTTCTTTTAGTAGTACAGATTAATGGTAAGTTAAAAGCTAAACTAGAATTAGATGCTTCATTAT CTTCAAATCAAGTTGAAGAAGTAGTGTTAGCTGATGAACATGTCAAATCATTTATAGATAATAAACAAGTTGTTAAAGTA ATTTATGTACCACAAAAACTTATTAATATTGTAATTAAATAA Protein sequence : MNEYNFSDIEKSTQEYWRKNDTFKTIEDNTKEKFYCLSMLPYPSGTLHMGHVRNYTIGDVIARYQKMQGKNVLHPMGWDA FGLPAENAAIKHKKSPYEWTKSNIAYMRSQFDSLGFSFDWSREIATCDEDYYKWEQWFFIQLYKKGLAYRKNSVVNWDPV DQTVLANEQVVDGRGWRSGALVEKKEIPQWFLKITDYADELLQDINKLDNWPEAVKTMQINWIGKSKGLTVKFKVKDSNQ EIEVFTTRPDTLMGVNYLGIAPEHPLALKEAKSNSQLAAFIEECKKTSTMEADLATQEKKGFKTSIKVIHPISAETIDVW VANFVLMGYGSGAVMSVPAHDQRDWEFAQKYNIPLKQVIESNDNKLKIDLEKQAFTEKGILINSGEFDGLNFKNAYQAIK KYLTKQNKGYETTNFRIHDWGISRQRYWGCPIPMIHCDDCGAVPEKEENLPVRLPTDVALTEAGSPLKDIPEFINVACPE CGKPAKRETDTFDTFFESSWYYARYTCPTSNQMLDQEANYWLPVDKYIGGIEHAIMHLLYARFFHKLMRDQGLVKSDEPF KNLLTQGMVLKDGAKMSKSKGNIVDPQELIDKYGADTVRLFSMFAASPEQSLEWSETGVEGANKFLRKVFNYAELNKVIF AKNITLESQKLTKEDKKARFEIHSNLKQAIFDFDKSQFNTVVSACMKILNTLNNYDNLSESVKVEGFSILLRILAPFTPH LCHYLWQQLNLGEDILHTSFPTVDNNALEKDEFLLVVQINGKLKAKLELDASLSSNQVEEVVLADEHVKSFIDNKQVVKV IYVPQKLINIVIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 2e-157 | 42 |
