Name : recG (ECH_0062) Accession : YP_506893.1 Strain : Ehrlichia chaffeensis Arkansas Genome accession: NC_007799 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : 3.6.1.- Position : 55011 - 57050 bp Length : 2040 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00270; match to protein family HMM PF00271; match to protein family HMM PF01336; match to protein family HMM PF04851 DNA sequence : ATGCACAACTTAAGCATATTTTCTAGCATGTATATGTTGCCAGGAGTTAATAATGTAGTAGGGAGTTTATTAAAAAAGTT ATGTGGTGGTGATAAAATTATAGATTTGTTATTTCATATACCACAAAGTTATGTGGATAGAAGAACTGCGTTATCTGAAG ATTCTGTAGGTAAAATTGTAACTTTTATTGGTACTGTGAAGTGTCATGGTTTTATTGGTAGGAAAAGAAAATCCCAGTAT AAAATTGTGCTTGATACATGTATTGGTGAAGTATCATTAATTTTTTTTAATTACTCGTTGAAATATCTGAGAAGTGTTTT AAAGGTAGGTTCAACATGTGTAGTAAGTGGTACTCTGATAAGATTTTTGGGATGTTTGCAAATTACACATCCGGATTATA TTGTAACAGATATTAAAAAGTTCCAGGATATTAGTATCATAGAACCTATTTATCCACTAATTAGAGGATTAACTTCTAAG AGAATTTCAAAGTTAGTAAAGTTAAGTGTAAGGTTGTTACCTGATTTTCCTGAATGGATAGATGAAAAATTGTTAAGAGA TAATAGATGGAATAGTTGGAAGGAAAGTTTAATAAAAATACATCACCCAGATACACTTGAAGCTGTGCATTTACATAGGG CAAGGTTAGCGTATGATGAATTATTAAGTCATCAAATCTCTGTAAAAATGGTCAGGAAATTTGATTACCAACAAGGTGTC TCTATTGTAAGTAAGCAGCTATACTATAATGATATTTTAAATAAACTGCCTTTTAAGTTAACAGAAGGACAGAAAGAAGT AATATCTCAGATTACAAAGAGTCAAGCATCAGAAAATAGGATGGTAAAACTATTAATAGGAGATGTAGGTAGTGGGAAAA CAGTGGTAGCTTTGTTTGCTATTTTAAATGTTATAGAGAATGGAGGTCAAGTAGCTTTTATGGCTCCTACTGAGATATTA GCAGAACAACATTATCGTTGGATACGGGCGATACTATCTGATATTTCAGTTGATGTTGAGTTGTTAACAAGTAAGGTAAG GAAGAAACAGAATATTAAAAAGAAATTGCAACTTGGTGAATGTAATGTAGTTATTGGAACTCATGCTTTATTTCAGGATG GTGTTGATTTTAATAATCTTAATTTGATTATCATTGATGAACAACAAAGATTTGGAGTATTACAGAGGATGAGGCTAATT AATAAAAGTAATATGGCTGATGTGCTTTTTATGACAGCTACGCCTATTCCTAGAACATTAGAGCAAGTAGTATATGGGGA TATAGATTGTTTAAGACTTAAGGATAAGCCTCACAATCGATTGCCTATACAAACTAGTATTGTGAATATTGAGCGCTTGT TTGAAGTTATAGCAAAATTACAATTGGCTTTGCAAGAAGGTAATAAGGCATATTGGATTTGTCCTTATATTGAAGATTCG GAATTATTAGATATAGCAGCAGCAGAAAAACGTTTTTTTACTCTACAAGAAGTGTTTGGTAAGGATGTAGGTTTGATACA CAGTCGTTTGCCTAAGATTGAAAAAGATGAAGTCATGATGTCTTTTTATAATGGAAATATTAAGTTACTAGTTGCAACTA CTGTAATAGAAGTAGGAGTTGATATACCTGATGCTACTATAATTATTATAGAAAATGCTGAACAATTTGGTCTATCACAG CTTCATCAATTACGTGGTAGAGTTGGCCGTAGTGATAAATCTTCTTTTTGTATTTTACTTCATGGGAATATGTTAAGTAA GATTGCATATAAAAAGCTATGTATATTGCGTAAATTTCAAGATGGCTTTTACATAGCTGAGCAGGATTTGTTGTTGCGTG GTAGTGGAGATGTTTTAGGGATAAAACAATCAGGATTATCAAATTTTAAGTTTGCAGATATTTATAAGGATCAAGGCCTT ATTTCTATTGCTGTTGAACAGGCAGGAGCAATTCTGGATGCGAATAAGACAGAATTAGGTGATCATTTTAATCAATTGTT ACACATGTTTGGTTATGATGTTTCTACTATAAATTATTAG Protein sequence : MHNLSIFSSMYMLPGVNNVVGSLLKKLCGGDKIIDLLFHIPQSYVDRRTALSEDSVGKIVTFIGTVKCHGFIGRKRKSQY KIVLDTCIGEVSLIFFNYSLKYLRSVLKVGSTCVVSGTLIRFLGCLQITHPDYIVTDIKKFQDISIIEPIYPLIRGLTSK RISKLVKLSVRLLPDFPEWIDEKLLRDNRWNSWKESLIKIHHPDTLEAVHLHRARLAYDELLSHQISVKMVRKFDYQQGV SIVSKQLYYNDILNKLPFKLTEGQKEVISQITKSQASENRMVKLLIGDVGSGKTVVALFAILNVIENGGQVAFMAPTEIL AEQHYRWIRAILSDISVDVELLTSKVRKKQNIKKKLQLGECNVVIGTHALFQDGVDFNNLNLIIIDEQQRFGVLQRMRLI NKSNMADVLFMTATPIPRTLEQVVYGDIDCLRLKDKPHNRLPIQTSIVNIERLFEVIAKLQLALQEGNKAYWICPYIEDS ELLDIAAAEKRFFTLQEVFGKDVGLIHSRLPKIEKDEVMMSFYNGNIKLLVATTVIEVGVDIPDATIIIIENAEQFGLSQ LHQLRGRVGRSDKSSFCILLHGNMLSKIAYKKLCILRKFQDGFYIAEQDLLLRGSGDVLGIKQSGLSNFKFADIYKDQGL ISIAVEQAGAILDANKTELGDHFNQLLHMFGYDVSTINY |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 5e-119 | 45 |