Gene Information

Name : SAOUHSC_02182 (SAOUHSC_02182)
Accession : YP_500668.1
Strain : Staphylococcus aureus NCTC 8325
Genome accession: NC_007795
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : tail length tape measure protein
Function : -
COG functional category : S : Function unknown
COG ID : COG5412
EC number : -
Position : 2044037 - 2048689 bp
Length : 4653 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGCCTAATCCTATAGGTAATATGGTCATAAAGGTTGATTTAGATGGTTCTGGATTCAATAGAGGTGTGACAGGTTTAAA
TAGGCAAATGAAAATGGTTTCGCGTGAGCTTTCGGCTAATTTATCACAATTTTCTAGATATGATAATTCATTAGAAAAGT
CGAAGATAAAAGTCGAAGGTTTGAGTAAAAAACAAAAAGTTCAAGCCCAGATTACTAAAGAGCTGAAAGATAGTTATGAC
AAACTTAGTAAAGAAACTGGTGAAAACAGTGCAAAGACACAAGCTGCGGCTGCTAAATACAATGAAGCTTACGCTAAATT
AAACCAATATGAGCGAGAGTTAAATCAAGCCACACAAGAATTAAAAGACATGCAAAGAGAGCAGAAAGCATTAAATACTG
CAATGGGAAAACTTGGTACCAACTTTAATAATTTTGGTCCTAAACTTCAAGAAATTGGTAACAGTATGAAAAATGTAGGC
CGTAACATGACTATGTATGTAACTGCGCCGGTGGTTGCTGGGTTTGCTGTAGCAGCTAAAAAAGGTATTGAATTCGATGA
CAGTATGAGAAAAGTTAAAGCAACTTCAGGTGCTACTGGGGAAGAGTTTGAAGCTTTGAAGAAAAAGGCTCGCGAAATGG
GTGCAACAACAAAATTTAGTGCATCAGATTCGGCTGAAGCATTAAATTACATGGCACTTGCTGGTTGGGATTCTAAGCAA
ATGATGGAAGGTTTAAGCGGAGTTATGGATTTAGCGGCAGCATCTGGCGAAGAACTGGAAGCAGTAAGTGACATTGTTAC
AGATGGACTAACGGCATTCGGTTTAAAAGCAAAGGATAGTGGTCATTTTGCGGACATTTTAGCACAAACTAGCTCGAAGG
CAAATACGGATGTTAGAGGGCTCGGAGAAGCTTTTAAATATGTCGCTCCTGTAGCAGGTGCGTTAGGTTACACGATTGAA
GATACATCTATTGCGATAGGTTTAATGAGTAATGCTGGTATCAAAGGTGAAAAAGCAGGTACAGCGTTACGAACAATGTT
CACCAATCTTTCAAGTCCAACTAGAGCTATGGGGAATGAAATGGAACGCTTAGGAATATCTATTACAGATAGTAATGGGA
AAATGATTCCTATGCGAAAGCTTTTAGACCAACTGAGGGAAAAATTTAAACATCTTTCAAAAGACCAACAAGCTAGTTCT
GCAGCTACAATATTTGGTAAAGAAGCGATGTCAGGAGCATTAGCGATTATAAATGCTTCTGATGAAGACTATCAAAAGTT
AACCAAATCTATAGATTCATCTACCGGCGCATCTAAAAGAATGGCCGATACAATGGAATCTGGTTTAGGTGGGAAATTAA
GAACTTTAAGGTCGCAATTAGAAGAACTAGCCTTAACGATTTATGACAGAATAGAACCAGCACTAAAGATTATAGTAAGT
GCTTTTAGCAAAGTAGTGACATGGGTTACTAAATTACCAACGTCAATTCAATTAGCGGTTGTTGGGTTTGGATTATTTGC
AGCAGTTTTAGGTCCTTTAGTTTTTATGTTCGGTTTATTTATCAGCGTGATGGGGAATGCAATGACAGTTTTAGGACCCT
TGTTAATAAACGTTAATAAAGCTGGTGGTTTATTCGCGTTTTTAAGAACTAAAATCGCATCACTTGTTAAACTATTTCCG
ATTTTAGGTGTGTCGATATCAAGTTTAACGTTACCTATAACATTAATTGTAGGTGCATTAGTTGGTATTGGCATAGCTTT
CTATCAAGCTTATAAACGTTCAGAAACTTTTAGAAATATTGTAAATCAGGCAATCTCTGGTGTAGCAAACGCATTTAAAG
CAGCTAAACTAGCGTTACAAGGTTTCTTTGATTTATTCAAAGGTGATAGTAAAGGCGCGGTTACCCTAGAGAAGATATTT
CCACCCGAAACTGTAGCAGGAATACAAAATGTAGTTAATACGATTAGAACAACTTTCTTTAAAGTAGTTGATGCAATCGT
TGGTTTCGCCAAAGAGATAGGCGCTCAATTAGCCTCTTTCTGGAAAGAGAACGGCTCAGAAATAACACAAGCTTTGCAAA
ATATAGCTGGTTTCATTAAAGCAACCTTTGAATTTATTTTTAACTTTATTATTAAACCAATCATGTTTGCGATTTGGCAA
GTGATGCAATTTATTTGGCCGGCGGTTAAAGCTTTGATTGTCAGCACTTGGGAAAATATCAAAGGTGTAATACAAGGGGC
TATTAATATTATTTTGGGTATTATCAAAGTGTTCTCTAGTCTTTTCACAGGAAACTGGCGAGGCGTTTGGGACGGCATTG
TAATGATACTGAAAGGTACTGTGCAGTTAATTTGGAATTTAATACAACTGTGGTTTGTAGGTAAGATTCTAGGTGTTGTT
AGATACTTTGGTGGATTGCTTAAAGGTTTAATATCCGGTATCTGGGGTGTTATCAAAGGTATTTTCACAAAATCATTATC
TGCAATTTGGAATGCAACGAAAAGTATTTTTGGTTTCTTATACAATAGTGTTAAATCTATTTTCACTAATATGAAAAACT
GGTTATCTAGTACGTGGAATAATATCAAAAGCAATACCGTCGGCAAGGCTCATTCGTTATTTACGGGTGTAAGGTCTAAA
TTCACAAGTTTATGGAATGCGACGAAAGATATATTTACTAAATTAAGAAATTGGATGTCAAACATCTGGAACTCTATTAA
AGATAACACGGTAGGTATAGCTGGTCGTTTGTGGGATAAAGTACGTAATATCTTCGGAAACATGCGTGACGGTTTAAAAT
CTATCATTGGTAAAATTAAAGATCATATCGGCGGTATGGTAGATGCTATTAAAAAAGGACTTAATAAATTAATTGAAGGC
TTAAACTGGGTCGGTGGTAAGTTAGGTATGGATGAAATACCTAGGTTACACACTGGTACAGAGCACACACATACTACTAC
AAGATTAGTTAAGAACGGTAAGATTGCACGTGATACATTCGCTACAGTTGGGGATAAAGGACGTGGAAATGGTCCAAATG
GTTTTAGAAATGAAATGATTGAATTCCCTAATGGTAAACGTGTAATCACACCTAGTACAGACACTACTGCTTATTTACCT
AAAGGCTCAAAAGTATACAACGGTGCACAAACTTATTCAATGTTAAACGGAACGCTTCCGAGATTTCATTTCGGTACTAC
TATGTGGAAAGATATTAAATCTAGTGCATCATCGGCATTTAACTGGACAAAAGATCAAATAGGTAAAGGCACAAAGTGGC
TTGGCGATAAAGTTGGTGATGTCATGGACTTTATCGATAATCCAGGCAAACTTTTAAATTATGTACTTCAAGCGTTTGGA
GTTGATTTCAGTTCTCTAACTAAAGGTATGGGTATTGCTGGCGATATAACAAAAGCTGCATGGTCTAAGATTAAGAAAAG
TGCAATCAAGTGGCTTGAGGATGCTTTCGCAGAGTCGGGTGATGGCGGTGTATTAGATATGAGTAAATTACGTTACTTAT
ACGGTCACACTGCTGCTTATACACGAGAAACCGGACGCCCATTCCATGAAGGTCTGGATTTTGATTACATTTACGAACCT
GTTCCATCAACCATTAATGGTAGAGCACAAGTTATGCCTGTTCATAATGGTGGTTATGGAAAATGGGTGAAAATTGTAAA
GGGCGCCTTAGAAGTTATTTATGCACATTTATCTAAATATAAAGTTAAAACTGGTCAACAAGTTAGGGTCGGACAGACTG
TTGGTATATCGGGGAATACGGGGTTTAGTACAGGACCTCACTTACATTATGAGATGCGTTGGAATGGAAGACATAGAGAC
CCGTTACCGTGGTTAAGAAAGAATAATGGGGGCGGCAAAAGTACACCCGGTGGTAATGGTGCAGCTAATGCTAGACGAGC
TATTAAGGCTGCTCAAAATATTTTAGGAGGAAGGTATAAGGCGAGTTGGATTACTAACGAGATGATGCGTGTTGCGAGTC
GTGAATCCAATTATACAGCTAATGCAGTCAATAATTGGGATAGCAACGCAAGAGCTGGTATACCTTCAAGAGGTATGTTC
CAAATGATAGATCCTTCATTTAGAGCGTACGCAAAGTCGGGTTACAATAATCCTCTCAACCCAACTCATCAAGCTATATC
GGCTATGAGATATATTGTGGGTAAATGGGTACCAAGAACAGGCTCATGGAGAGCTGCGTTCAAACGCGCTGGTGATTACG
CATATGCTACTGGTGGCAAAGTCTATAACGGATTGTATCACTTAGGGGAAGAAGGATATCCAGAGTGGATAATACCTACT
GATCCAAGTAGAGCGAACGAAGCACACAAATTATTAGCTTTAGCTGCTAACGATATTGATAACCGCTCTAAAAATAAGCG
ACCAAACAACTTACCAAATCCAAGTATAAGTAATAGTGATACAAACTATATTCATACATTGGAGAATAAACTGGATGCGG
TTATTAATTGTTTGGTTAGTTTGGTTGAGTCTAATCAAGTTATTGCAGATAAGGATTACGAACCAGTTATTAATAAGTAT
GTGTTTGAAGATGAGGTAAATAATTCTATCGATAAACGAGAGCGTCACGAATCTACAAGAGTTAGATTTAGAAGAGGAGG
CACGATAATCTAA

Protein sequence :
MPNPIGNMVIKVDLDGSGFNRGVTGLNRQMKMVSRELSANLSQFSRYDNSLEKSKIKVEGLSKKQKVQAQITKELKDSYD
KLSKETGENSAKTQAAAAKYNEAYAKLNQYERELNQATQELKDMQREQKALNTAMGKLGTNFNNFGPKLQEIGNSMKNVG
RNMTMYVTAPVVAGFAVAAKKGIEFDDSMRKVKATSGATGEEFEALKKKAREMGATTKFSASDSAEALNYMALAGWDSKQ
MMEGLSGVMDLAAASGEELEAVSDIVTDGLTAFGLKAKDSGHFADILAQTSSKANTDVRGLGEAFKYVAPVAGALGYTIE
DTSIAIGLMSNAGIKGEKAGTALRTMFTNLSSPTRAMGNEMERLGISITDSNGKMIPMRKLLDQLREKFKHLSKDQQASS
AATIFGKEAMSGALAIINASDEDYQKLTKSIDSSTGASKRMADTMESGLGGKLRTLRSQLEELALTIYDRIEPALKIIVS
AFSKVVTWVTKLPTSIQLAVVGFGLFAAVLGPLVFMFGLFISVMGNAMTVLGPLLINVNKAGGLFAFLRTKIASLVKLFP
ILGVSISSLTLPITLIVGALVGIGIAFYQAYKRSETFRNIVNQAISGVANAFKAAKLALQGFFDLFKGDSKGAVTLEKIF
PPETVAGIQNVVNTIRTTFFKVVDAIVGFAKEIGAQLASFWKENGSEITQALQNIAGFIKATFEFIFNFIIKPIMFAIWQ
VMQFIWPAVKALIVSTWENIKGVIQGAINIILGIIKVFSSLFTGNWRGVWDGIVMILKGTVQLIWNLIQLWFVGKILGVV
RYFGGLLKGLISGIWGVIKGIFTKSLSAIWNATKSIFGFLYNSVKSIFTNMKNWLSSTWNNIKSNTVGKAHSLFTGVRSK
FTSLWNATKDIFTKLRNWMSNIWNSIKDNTVGIAGRLWDKVRNIFGNMRDGLKSIIGKIKDHIGGMVDAIKKGLNKLIEG
LNWVGGKLGMDEIPRLHTGTEHTHTTTRLVKNGKIARDTFATVGDKGRGNGPNGFRNEMIEFPNGKRVITPSTDTTAYLP
KGSKVYNGAQTYSMLNGTLPRFHFGTTMWKDIKSSASSAFNWTKDQIGKGTKWLGDKVGDVMDFIDNPGKLLNYVLQAFG
VDFSSLTKGMGIAGDITKAAWSKIKKSAIKWLEDAFAESGDGGVLDMSKLRYLYGHTAAYTRETGRPFHEGLDFDYIYEP
VPSTINGRAQVMPVHNGGYGKWVKIVKGALEVIYAHLSKYKVKTGQQVRVGQTVGISGNTGFSTGPHLHYEMRWNGRHRD
PLPWLRKNNGGGKSTPGGNGAANARRAIKAAQNILGGRYKASWITNEMMRVASRESNYTANAVNNWDSNARAGIPSRGMF
QMIDPSFRAYAKSGYNNPLNPTHQAISAMRYIVGKWVPRTGSWRAAFKRAGDYAYATGGKVYNGLYHLGEEGYPEWIIPT
DPSRANEAHKLLALAANDIDNRSKNKRPNNLPNPSISNSDTNYIHTLENKLDAVINCLVSLVESNQVIADKDYEPVINKY
VFEDEVNNSIDKRERHESTRVRFRRGGTII

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
MW1895 NP_646712.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 99
SA1766 NP_375064.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 53
SAUSA300_1930 YP_494581.1 phi77 ORF001-like protein, phage tail tape measure protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 52
SAUSA300_1930 YP_494581.1 phi77 ORF001-like protein, phage tail tape measure protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 52
SAKOR_01932 YP_008492120.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 52
SAV1955 NP_372479.1 phi PVL ORF 15 and 16-like protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 52
SAOV_1114 YP_005736609.1 Phage tail length tape-measure protein Not tested ¥ÕSa2 Protein 0.0 50