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Name : leuS (AYWB_656) Accession : YP_456852.1 Strain : Aster yellows witches'-broom phytoplasma AYWB Genome accession: NC_007716 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0495 EC number : 6.1.1.4 Position : 685641 - 688106 bp Length : 2466 bp Strand : - Note : leucine--tRNA ligase; LeuRS; class-I aminoacyl-tRNA synthetase; charges leucine by linking carboxyl group to alpha-phosphate of ATP and then transfers aminoacyl-adenylate to its tRNA; due to the large number of codons that tRNA(Leu) recognizes, the leucyl DNA sequence : ATGACAAAATTAATTTATGATTTTAAACAAATAGAACATAAATGGCAACTTTATTGGCAACAAAATAATGTTTTCAAAAC TCAAGATAACTTTTCAAAAAAGAAATTTTATTGTCTTGACATGTTTCCTTATCCTTCTTCTGAAGGGCTTCATGTAGGCC ATATTGAAGGTTATACTGCAAGTGATATTATGAGTAGGTTCAAACGCATGCAAGGTTTTAATGTTTTGCATCCTTTTGGT TGGGATTCGTTTGGTCTGCCCGCCGAACAATATGCTTTGCAAACAGGCAAAAACCCCCGCAATTTTACTTATGAAAATAT CAATAATTTTAAAAAACAAATCCAAAGTATTGGTAAAAGTGTGGATTGGGACAGAGAACTTGCCACCTCAGATCCTTATT TTTATGCCTGGACTCAATGGATTTTTAAAAAACTTTACGAAAAAGGACTAGCAGTTCTCAAAAATATAGAAGTAAATTTT TGCCCTAATTTAGGAACAGCGCTTGCCAATGAAGAAGTAATTTCTAATGAAAAAGGGATGTTTTCTGAAAGAGGTAATCA TCCGGTTGTTAAAAAAAAGATGAAACAATGGGTTTTAAAAATAACTCAATATGCCGACAGACTTTTAGACGACCTTAATT TAGTTAATTGGCCTTTAAATGTGAAAGAAATGCAAGCTAATTGGATTGGCAAAAATCAAGGAGCAATTGTCTCCTTCCCA GTTTTCGATCAAAAAATGACTTTAAAAACTTTCACCAATCGCCCCGATACTCTTTTTGGTGTAACTTTTTTAGTAATAGC GCCCGAACACGAATTAGCCTTACAACTAACCAAAACCGAACACCAACAAGCAGTTAACAATTATTTGGAATTAACAAAAC AAAAAAAAGACTTAGAAAGAGACATCAACAAAGACAAAACAGGTGTTTTTACAGGCAGTTTTGCAATTAACCCTTGTAAC AACACCAAAATTCCTATCTGGATTGCTGATTATGTTCTTCCTCATTATGGTACAGGCGCTTTAATGTCTGTTCCTTGTCA TGATCAAAGAGATTTTGAGTTTGCTCAAAAACATGGTTTAAAAATGATTCAAGTCATAAATCCCCCCTCTTCTGATTTTG CAATGCCTACCACCAATCAAACTCAACCTCCCTTGACCGAGGCTTATACAGGGGAAGGGATTCACATCAATAGTGATTTT TTAAATGGTCTTAATAACGAACAAGCCAAAACTAAAATGTTGCAATTTTTAGAAAAAAAAAACCACGGTTATCCTCATTA TACTTATAAATTGCGTGATTGGGTCTTTTCGCGCCAACGATATTGGGCAGAACCCTTCCCCATTTATTATGATGATTCCA ATAATGAAATTTATACTGATAGCGATACAAACTTACCAATAGAACTTCCTGTTTTGGAACAAATCAAACCATCAGGCACA GGTGAATCACCCATATCCAAAGCCCATTTTTGGCTATATTTTGAAAAAGATGGCAAAAAATATCGCAGAGATTGTAACAC CATGCCACAACTTGCAGGTAGCTCTTGGTACTATATTGGCTATATTTTGAAAAACCATTTGGGTCTAATCCCGTTAAATA CCGCCAAAGCAAAAGAACTACTTGACTATTATTTGCCAGTAGACTTATACATTGGAGGGACAGAACACGCTGTTGGTCAT TTGCTTTATGCACGTTTTTGGCATAAGTTTTTATACGATCTGGGTTTGGTTTCTACCAAAGAACCTTTTCAAAAATTAGT TAATCAAGGTATTATTTTGGGACATGATCACACTAAAATGTCCAAATCCAAAGGCAACGGAGTAAGTGCTTCCTTAATGC TTGCGCGATATGGCGCCGATGTACTGCGAATTTATATCATGTTTATGGGTCCGTTAGAAGATATTAAAAATTGGTGTGAA AAAGGTTTCAAAGGAATACAACGTTTTTTAAATAGAGTTTATCAAATGTTTTCTTTTTCAATGCCAAATGATTTTGAAAC TTCTCTAAACGCTATTTATCATCAAACCATTTTTCAAACAACCCAAGATTATGAAAAATTGAAATTCAATAAAGTTATTA GTCAATTAATGATTTTTGTTAATCAAGTTTATAAACATCAAAAAATAGGAAAAAAACAAGCACAGATCTTTTTACAACTA TTAAATCCGATTGCTCCTCACTTGACAGAAGAAATTAATCAAACCATTTTAAAAAATAAAACCCAATTAGTTGCTTTAAC TTGGCCTTTTTATGATAAAAACCATTTGGAACAACTGCAAGTAAAAATTATTGTGCAAGTAAATAGTAAATTAAGAGCTG TTTTAGAACTTCCTTTTAATTTGTCTTCAGAACAAATTAAAATTCGAGCTTTGCAAGATTCAAAAGTTAATAAGTTTGTA TGCCATAAAAAAATTCAAAATATGATTTATATTCCCAACAAATTGTTAAATATTATTGTTAATTAA Protein sequence : MTKLIYDFKQIEHKWQLYWQQNNVFKTQDNFSKKKFYCLDMFPYPSSEGLHVGHIEGYTASDIMSRFKRMQGFNVLHPFG WDSFGLPAEQYALQTGKNPRNFTYENINNFKKQIQSIGKSVDWDRELATSDPYFYAWTQWIFKKLYEKGLAVLKNIEVNF CPNLGTALANEEVISNEKGMFSERGNHPVVKKKMKQWVLKITQYADRLLDDLNLVNWPLNVKEMQANWIGKNQGAIVSFP VFDQKMTLKTFTNRPDTLFGVTFLVIAPEHELALQLTKTEHQQAVNNYLELTKQKKDLERDINKDKTGVFTGSFAINPCN NTKIPIWIADYVLPHYGTGALMSVPCHDQRDFEFAQKHGLKMIQVINPPSSDFAMPTTNQTQPPLTEAYTGEGIHINSDF LNGLNNEQAKTKMLQFLEKKNHGYPHYTYKLRDWVFSRQRYWAEPFPIYYDDSNNEIYTDSDTNLPIELPVLEQIKPSGT GESPISKAHFWLYFEKDGKKYRRDCNTMPQLAGSSWYYIGYILKNHLGLIPLNTAKAKELLDYYLPVDLYIGGTEHAVGH LLYARFWHKFLYDLGLVSTKEPFQKLVNQGIILGHDHTKMSKSKGNGVSASLMLARYGADVLRIYIMFMGPLEDIKNWCE KGFKGIQRFLNRVYQMFSFSMPNDFETSLNAIYHQTIFQTTQDYEKLKFNKVISQLMIFVNQVYKHQKIGKKQAQIFLQL LNPIAPHLTEEINQTILKNKTQLVALTWPFYDKNHLEQLQVKIIVQVNSKLRAVLELPFNLSSEQIKIRALQDSKVNKFV CHKKIQNMIYIPNKLLNIIVN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 49 |
