Gene Information

Name : gpmI (AYWB_436)
Accession : YP_456632.1
Strain : Aster yellows witches'-broom phytoplasma AYWB
Genome accession: NC_007716
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : phosphoglyceromutase
Function : -
COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism
COG ID : COG0696
EC number : 5.4.2.1
Position : 445826 - 447364 bp
Length : 1539 bp
Strand : -
Note : catalyzes the interconversion of 2-phosphoglycerate and 3-phosphoglycerate

DNA sequence :
ATGACTAAAAAATTTGTAGGATTAATTATTTTAGATGGCTTAGGCTTAACCGACCAAAAAGAAAATAACGCTTTTCATTT
GGCAAAAACTCCCTATCTAGATTATCTTTTAAAAAACTTTCCCAACACCACTCTTAAAGCCTCAGGTGAAGAAGTGGGCC
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AAAAAACTATGCAAAATTTTTATAATCAAGGAATTACAGATGAATTTATTACTCCTTTCATTACTGATCCAAATGGTTTA
ATTGATGATAATGATGCAGTTATTTTTGTTAATTTTCGTCCTGACCGCGCTATGCGTCTTGCAACTGCTCTATCTAATCC
TTGTGCCACTAATGCTTTTTGTTCTGAGGGCAAAACCAATTTTTGCGGTAATAAATTAGTAAATAATCTTTTTTTGGTAA
CAATGACTCAATACAACGTTCAAGTTAAAAGTGTAGTTGCTTTTGAAAAAAAAACTTTAAAAAATATTTATGGTGAAGTA
ATTGCCAATTTAGGAATGCACCAACTAAGAATTTCGGAAACTGAAAAATATCCTCATGTAACTTTTTTCTTTGATGGTGG
CAAGGAACTACAATTAAAAAATGCAGATAGAATCTTAATTCCTTCTCCCAAAGTAAAAACTTATGATCTTAAACCCGAAA
TGAGTGCTTTAGAAATTACCAACGCTGCTAAAACTGCTATTTTTTCTCGTAAATACGATACTTTAATTCTTAATTTTGCA
AATCCTGATATGGTAGGACATACTGGTTTTTTAGATGCTACTATTAAAGCGGTTCAAACAGTAGACAGTTGTCTTAAAGA
AGTTCTAAACGCTATTTTTGCAGTTAAAGGCAAAGCTTGTATTGTAGCAGATCATGGAAATGCCGAAAAAATGAAAGATA
ACCAAGGGAATCCACACACAGCTCATACTACTAATTTAGTTCCTTTCATTGTTACAGATAAAAATGTTGTCTTAAAACCA
GGGTCTTTATGTGATGTTGCGCCCACAATGCTAGATTTATTGGAAATTAAAAAACCTCAAGAAATGACAGGAAATAGTTT
AATTAAAAAACTAGTTTGA

Protein sequence :
MTKKFVGLIILDGLGLTDQKENNAFHLAKTPYLDYLLKNFPNTTLKASGEEVGLPQGQMGNSEVGHLNLGAGRVVYQSLT
QINKAIRDKTFFTNKQFLQAIEHVKKNNSKIHLLGLISDGGIHSHLDHFKALFDLLKENNLANNTFLHAFTDGRDTGTHS
GINYIKNLLDYGFNIASVAGRYYALDRDNNWDRINLVYNMLTSKQAPVITLSLEKTMQNFYNQGITDEFITPFITDPNGL
IDDNDAVIFVNFRPDRAMRLATALSNPCATNAFCSEGKTNFCGNKLVNNLFLVTMTQYNVQVKSVVAFEKKTLKNIYGEV
IANLGMHQLRISETEKYPHVTFFFDGGKELQLKNADRILIPSPKVKTYDLKPEMSALEITNAAKTAIFSRKYDTLILNFA
NPDMVGHTGFLDATIKAVQTVDSCLKEVLNAIFAVKGKACIVADHGNAEKMKDNQGNPHTAHTTNLVPFIVTDKNVVLKP
GSLCDVAPTMLDLLEIKKPQEMTGNSLIKKLV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00298 YP_008207763.1 Phosphoglyceromutase Not tested AbaR25 Protein 9e-96 46
BJAB0868_00302 YP_008211628.1 Phosphoglyceromutase Not tested AbaR26 Protein 9e-96 46