|
Name : nrdE (MCAP_0101) Accession : YP_424095.1 Strain : Mycoplasma capricolum ATCC 27343 Genome accession: NC_007633 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0209 EC number : 1.17.4.1 Position : 120262 - 122424 bp Length : 2163 bp Strand : + Note : Catalyzes the rate-limiting step in dNTP synthesis DNA sequence : ATGAACGAAAATAAAAACACAATCGTTTTAGATGATGTTGATGATGAATATATTAAATTAAATGCTAGATCTAAGATCTT TTCAAAAGATCAAGATAATTTTCAATTAGATATTAAAGCAGCTGAATTATATTTAAAAAACTATATTGAACCTAGAATGA AAAAGTTTTCTAGTCTAAAAGAAAGATTAGATTATTTATTAGAAAATCAGTATTATGATTCAGAAATTTTAAATAAATAT AGTTTTGATCAGATTAGTCAATTAAATGATTATGCTTATTCATTTAACCATCATTTTCCAAGTTTTATGGGAGCTTTAAA ATTCTTTAATGCTTATGGATTAAAAACTTTTGATACTACAATGTATTTAGAAACTTATACAGATAGAGTATTAATGAATG CTCTATTTTTAGGTAATGGTAATTTTACTAAAGCAAAAAACTTATTAAAAGATATGATGTTAGGTAGATTTCAACCAGCA ACTCCTACTTTTTTAAATGCAGCTAAAAAACATAGAGGAGAGTATGTTTCATGTTATTTATTAAGAACAGAAGATAACAT GGAATCAATTTGTAGAACAATTTCAACTTCACTACAACTTTCAAAAAGAGGTGGAGGAGTTGCGATTTGTTTAACAAATT TACGAGAAACAGGTTCTCCTATTAAAAATATTTCAGGCCTAAGTTCAGGACCAATTCCAGTAATGAAGATTTTAGAAGAT TCATTTACTTATGCTGATCAATTAGGTCAACGTCAAGGAGCTGGGGCTGTTTATATTTCAGCTCATCATCCAGATATTAT TTCAGTTTTAGATACTAAAAGAGAAAATGCTGATGAAAAGATTAGAATTAAATCTTTATCATTAGGATTAGTAATTCCAG ATATTACTTTTGAATTAGCTAGAGATAATAAAGATATGGCTCTATTTAGTCCTTATGATGTTCAAAAAGTATATGGTAAG CCATTATCAGATATTTCAATTACTGAAAAATATTATGAAATGTTAGAAAATCCTAATATTAAAAAAACATATATTAGTGC TAGAAAATTCTTTTTAACTGTTGCTGAATTACATTTTGAAAGTGGATATCCATATATTTTATTTGAAGATACTGTTAATA GAAGAAATGCTCATGATAAAAAAGGAAGAATTATTATGAGTAATTTATGTAGTGAAATTGTTCAAGTAAGTACAGCAAGC GAATATAGTTCTGATTTATCATTTATAAAAACTGGAGAAGATATTTGCTGTAATTTAGGTAGTTTAAATATTGATAAGAT GATGAAATCAGGAAAAGAATTTTCAGATTCTATTTATAATGCAATTTCTGCTTTAGATATTGTGTCAAGAAATTCAGATT TGAGTGCGTCTCCTTCAATTAAAAAAGGAAATGCTGAAAATCATGCTGTTGGATTAGGAGCTATGAATTTACATGGATTT TTAGCAACTAATAAAATTATGTATGATTCACCTGAAGCTGTTGATTTTACTAATATGTTTTTTTATACAGTTGCTTATAA TGCTTTTAAAGCTTCAAATAAATTAGCTCAAGAATTTGAAAAATTTGCTTCATTTGATCAATCAAGATTTGCTGATGGTT CTTGATTTGATAAATACACTAAATGTGAATTTGATAAATGAACACCACAAACAAATAGAGTAAAAGAATTATTCAAAGAT TATGATGTTCAAATTCCAAGTCAAACTGATTGAATTGAATTGGTTGAAGAAATTAAAAAAACAGGTTTAGCAAACTCACA TTTAATGGCAGTTGCTCCAACTGGATCAATTAGTTATTTATCATCATGTACTCCTTCACTACAACCAGTAGTTTCAACTG TTGAAGTTAGAAAAGAAGGAAAATTAGGAAGAGTTTATGTTCCAGCATATCAAATTAATTTTGATAATATGGGATATTAT GCAATGGGTGCTTATGAACTAGGACCAGATCCAATTATTAATATTGTTGCAGCAGCTCAACAGCATGTTGATCAAGCAAT TTCACTAACTTTATTTATGACTGATAAAGCAACAACTAGAGATTTAAACAGAGCATATGTTAATGCCTTTAAACAAGGCT GTTCTTCAATTTATTATGTAAGAATTCGTCAAGATGTTTTAGAAGATAGTGAAAACTATGAATGTGATGCATGTAAAATT TAA Protein sequence : MNENKNTIVLDDVDDEYIKLNARSKIFSKDQDNFQLDIKAAELYLKNYIEPRMKKFSSLKERLDYLLENQYYDSEILNKY SFDQISQLNDYAYSFNHHFPSFMGALKFFNAYGLKTFDTTMYLETYTDRVLMNALFLGNGNFTKAKNLLKDMMLGRFQPA TPTFLNAAKKHRGEYVSCYLLRTEDNMESICRTISTSLQLSKRGGGVAICLTNLRETGSPIKNISGLSSGPIPVMKILED SFTYADQLGQRQGAGAVYISAHHPDIISVLDTKRENADEKIRIKSLSLGLVIPDITFELARDNKDMALFSPYDVQKVYGK PLSDISITEKYYEMLENPNIKKTYISARKFFLTVAELHFESGYPYILFEDTVNRRNAHDKKGRIIMSNLCSEIVQVSTAS EYSSDLSFIKTGEDICCNLGSLNIDKMMKSGKEFSDSIYNAISALDIVSRNSDLSASPSIKKGNAENHAVGLGAMNLHGF LATNKIMYDSPEAVDFTNMFFYTVAYNAFKASNKLAQEFEKFASFDQSRFADGSWFDKYTKCEFDKWTPQTNRVKELFKD YDVQIPSQTDWIELVEEIKKTGLANSHLMAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVSTVEVRKEGKLGRVYVPAYQINFDNMGYY AMGAYELGPDPIINIVAAAQQHVDQAISLTLFMTDKATTRDLNRAYVNAFKQGCSSIYYVRIRQDVLEDSENYECDACKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 4e-179 | 55 |
