|
Name : tkt (MCAP_0610) Accession : YP_424578.1 Strain : Mycoplasma capricolum ATCC 27343 Genome accession: NC_007633 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0021 EC number : 2.2.1.1 Position : 724564 - 726534 bp Length : 1971 bp Strand : - Note : identified by similarity to SP:P45694; match to protein family HMM PF00456; match to protein family HMM PF02779; match to protein family HMM PF02780; match to protein family HMM TIGR00232 DNA sequence : ATGAAAAACAGTAAAAATGATAATTTAAATGCATTGCGTATATTAGGTGTAAGTGCAATTAATAAAGCAAAATCTGGTCA TCCTGGAATTGTTTTAGGAGCAGCTGGAATTATTTATGTTTTATTTAATAAAATTATGAATTTTAATCCTAAAAATCCAG AATGATTTAATAGAGATAGATTTATTTTATCTGCTGGTCATGGTAGTGCTTTATTATATTCAGCTTTACATTTATCTGGA TATGATTTATCTATTGAAGATTTAAAACAATTTAGACAATGAGAAAGTAAAACTCCAGGTCATCCTGAAAAAACTTTAAC TAGTGGAGTTGAAGTAACAACTGGTCCACTTGGTCAAGGTGTTGGAATGGCAGTTGGAATGGCTGTTGCTGAAGCTCATT TAGCTAGTGTTTATAATAGACCTAATTTTGATTTAATTGATCACTATACTTATGTTTTATGTGGTGATGGTGACTTACAA GAAGGAATTAGTCAAGAAGTAATTTCATTTGCTGGTAAAAACAAATTAAACAAATTAATTTTAATTCATGATTCAAATGA TGTGCAATTAGATTCTGATGTAGTTGATGTACAAATTGAAGATATGCGCAAACGTTTTAAAGCATGTAATTGAAATACAA TTAAAGTTAGTGATGGAGAAGATTTAAATTCTATTTACAATGCTATTAAAAAGGCTCAACTTTCAGATAAACCAACATAT ATTGAAGTTAAAACTATTATTGGATTAGGTTCAACTAAACAAGGAACTAAAGATGTTCATGGTGCACCTTTAAATGATGA TATCACTAAAGTTAAAGAATATTTTGATTGAAATTATGATGATTTTATTATTCCAAATAGTGTTTATGAACATTGATCAA TTAATGCTAAAAACGGTTTATTAAAAGAAGAAAAATGAAATGAATTAAAAGCTAAATATAGTTTAGATTATCCTGAATTA AATCAGTATTTAGATAATGCAATTGATAAAAAAATTAATTTTGATTTTAATAGTTTATTAGAAAATGTTCCAAGTAGTGA TGAAGCAACAAGACTAAGTTCAGGAAAAATTTTTGAACAAATTGCAAGTAAAGAAAAAATGTTAATTGGTGGAAGTGCTG ATTTATCAAGTTCAACTAGAATTAAAGGTGCTGATAATCAATTCACTAGTTCTAATAAAACTGGTAGAAATATAATGTAT GGAGTTAGAGAATTTGGAATGGGTGCAATTAATAATGGAATTGCAGCTCATAAAGGATTAATTCCAGTTGCTAGTGGATT TTTTGTGTTTGCTGATTATTTAAAACCAGCAATGAGATTAGCTTCTATTATGCAATTACAACAATTGTATGTTTTTACTC ACGATTCAATTGCAGTTGGTGAAGATGGACCTACTCATCAACCAATCGAACAACTAGCAATGCTTAGAACTATTCCAAAT CATATTGTTTTAAGACCTGCAGATTTTAGTGAAACTGTTGCTTGTTATAAAATTGCTTTAACAAAATTAGATAAAACCCC AGCTTCAATTGTTTTAACTAGACAAAATGTTAAACAATTAACTCATGATGATGTTTTAAATAAAGTTGAATGTGGAGCTT ATATAATTAGTGATCAAGTTGATGCAACTATTACTTTAATAGCTAGTGGTAGTGAAGTTAGTTTAGCAATTGATATAAAA GAAGAATTATTAAAACACAATCTAAAAGCAAAAGTAGTTTCAATGGTTTCAACTAATTTATTTGATAAACAAGATAAAAA ATATCAAGATCAAATTATAGATAAAAAAACAAAAAGAATTGCAATTGAAATGGGAGCGAGCGCAATTTGATATAAATATG TTGGTGATGATGGTTTAGTTTATGGAATTGATCGCTTTGGTGAATCAGCTCCAGCTAATAATGTAATTAAAGAATTTGGA TTTACTAAAGAAAATATTACAAATAAAATACTAGAGAGTTTAAAAAAATAG Protein sequence : MKNSKNDNLNALRILGVSAINKAKSGHPGIVLGAAGIIYVLFNKIMNFNPKNPEWFNRDRFILSAGHGSALLYSALHLSG YDLSIEDLKQFRQWESKTPGHPEKTLTSGVEVTTGPLGQGVGMAVGMAVAEAHLASVYNRPNFDLIDHYTYVLCGDGDLQ EGISQEVISFAGKNKLNKLILIHDSNDVQLDSDVVDVQIEDMRKRFKACNWNTIKVSDGEDLNSIYNAIKKAQLSDKPTY IEVKTIIGLGSTKQGTKDVHGAPLNDDITKVKEYFDWNYDDFIIPNSVYEHWSINAKNGLLKEEKWNELKAKYSLDYPEL NQYLDNAIDKKINFDFNSLLENVPSSDEATRLSSGKIFEQIASKEKMLIGGSADLSSSTRIKGADNQFTSSNKTGRNIMY GVREFGMGAINNGIAAHKGLIPVASGFFVFADYLKPAMRLASIMQLQQLYVFTHDSIAVGEDGPTHQPIEQLAMLRTIPN HIVLRPADFSETVACYKIALTKLDKTPASIVLTRQNVKQLTHDDVLNKVECGAYIISDQVDATITLIASGSEVSLAIDIK EELLKHNLKAKVVSMVSTNLFDKQDKKYQDQIIDKKTKRIAIEMGASAIWYKYVGDDGLVYGIDRFGESAPANNVIKEFG FTKENITNKILESLKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 3e-110 | 45 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 1e-107 | 43 |
