|
Name : MCAP_0590 (MCAP_0590) Accession : YP_424558.1 Strain : Mycoplasma capricolum ATCC 27343 Genome accession: NC_007633 Putative virulence/resistance : Virulence Product : PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB Function : - COG functional category : S : Function unknown COG ID : COG3037 EC number : 2.7.1.69 Position : 702133 - 703941 bp Length : 1809 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF02302; match to protein family HMM PF04215 DNA sequence : ATGGATTTTGGAAAATATGTTTTAAATTTCTTTACTGAATTTATTGGAACTCCAGCAATACTAGTAGCGTTATTTGCTTT TATTGGTTCTTTATTACAAAAAAAGAAATTTACAGAAAGTTTGACTTCAACAATTAAAACAGCTATTGGCTTTTTAATTA TTGGTGGTGGAGCTGGTATTATTGCTGGGTCTATTCAAAAATTAGGTTTTGCTTTTAACTTGTTATTTCAAAGATCTGGA GCTATTGCAAATAATGATGTTTTACCAGGTCTATTTTTAAATACTTCAAAAATAGTTTTAACTGGGTCATTAATTATGAT TTGTGCTATGTTTTTAAATATAGTTTTAGCTAGAATTAGTAAATTTAAATATATTTATTTAACAGGTCATGTTTTATTTT ATTTTTCAACAATGTTTGCAAGTGTAATGCATGTTGCTGGTTTAAATTTAGATGAAGTAAAAAACTTAACAACTGTAGTA ATTTCTGGAGCTTTATTAGTTTCTATTTATATGGTGTTAACTCCAGCTTTATTAAATAATCATGTTATTAGAATTACTAA AAATGATAATTTAGCACTAGGACATACTGGTTCACTTGGTTATTGACTATCAGCAATTATTGGATTAGGAATAGCAAAAA TTAGTAAAAAACCATCACGTTCTACTGAAGATGTTAATTTTCCAAAAGGACTAGCATTTTTAAGAAATACTAATGTAGCT ATTGGTATAACTATGTTATTGCTTTATTTGATAATTTACTTTACTACTTTTATAGTTCATGGATATGAGCAAATGGTAGC TCATAAAATTATTGACAATGGAAAAGATGTTTTTGTACAAGGGTTATTACAATCTTTAACATTTGCAGCAGGAGTTGAAA TTGTTTTAATTGGAGTAAGAATGTTTATTGCTGAAATTATTCCATCATTTCAAGGGATTTCACAAAAAGTAGTTCCAGAT GCAAAACCAGCTTTAGATTGTCCAATTGTATTTCCTTATGCACCAAATGCAGTTCTAATTGGGTTTATTTCATCATTTAT TGGTGGAATTATAGCAATGGGGATAACAATTTTAATTGTTAATTTAAAGGGAATTAATGTAGATATTTGAATTATTATTA TTCCAAGTATTGTTCCACACTTTTTTGTTGGTGCTACTTGTGGGGTTTTTGGAAATTCAACAGGTGGTATTAAAGGAGCT ATTATTGGTTCTTTTGTTAATGGATTAATTATTTCATTTGTTCCATTCTTATTTATTGGTTTACAATTAATTCCAAACAT TTCTAATAACAATCAACATATTGCTTGAGGAGATGGAGACTTTTTATTAGGATTACCAATTGGAGCTTTATTAAGATTAA TTGGAGCTAAAAGTGCTATTTGAGTTTTACTACTAATTAGTATAATAAGTTGATTAATTTTACCAATTTATAGTTTTTTA ACTAAAAAAATTAATTTAGTTAAAAAACTAGATAATAACAATAGAGTTAAAGTTATTAATAAAGATCAAAAGCTTATATC AAAATACGATCTTAAAAAACAATACAAAATAGTTGCTGTTTGTGGTCAAGGTTTAGGTTCATCATTACTAATTGAAATGA GTTTAAAAAATGTTATTAAAGAATTAGATTTACCAATACAAATAACACATACTAATTTAAATTCATTTGATCCAACTGAT GAAACTATATTAGCTGTAGTTTGTGGAATAGATTTGCAAAATAGTATTAATTTTGAACGTAAAATTGTTTTAGAAAATCT TTTAGATCAAGATCAAGCTAAACAAAAGATTAAGGAATTTTTAAGTTAA Protein sequence : MDFGKYVLNFFTEFIGTPAILVALFAFIGSLLQKKKFTESLTSTIKTAIGFLIIGGGAGIIAGSIQKLGFAFNLLFQRSG AIANNDVLPGLFLNTSKIVLTGSLIMICAMFLNIVLARISKFKYIYLTGHVLFYFSTMFASVMHVAGLNLDEVKNLTTVV ISGALLVSIYMVLTPALLNNHVIRITKNDNLALGHTGSLGYWLSAIIGLGIAKISKKPSRSTEDVNFPKGLAFLRNTNVA IGITMLLLYLIIYFTTFIVHGYEQMVAHKIIDNGKDVFVQGLLQSLTFAAGVEIVLIGVRMFIAEIIPSFQGISQKVVPD AKPALDCPIVFPYAPNAVLIGFISSFIGGIIAMGITILIVNLKGINVDIWIIIIPSIVPHFFVGATCGVFGNSTGGIKGA IIGSFVNGLIISFVPFLFIGLQLIPNISNNNQHIAWGDGDFLLGLPIGALLRLIGAKSAIWVLLLISIISWLILPIYSFL TKKINLVKKLDNNNRVKVINKDQKLISKYDLKKQYKIVAVCGQGLGSSLLIEMSLKNVIKELDLPIQITHTNLNSFDPTD ETILAVVCGIDLQNSINFERKIVLENLLDQDQAKQKIKEFLS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ORF8 | AAK27335.1 | unknown | Not tested | PAI-I AL862 | Protein | 2e-51 | 42 |
| unnamed | CAC39291.1 | hypothetical protein | Not tested | LPA | Protein | 1e-51 | 42 |
| vpeC | ADD91725.1 | putative PTS system-specific IIC component VpeC | Virulence | PAI-I AL862 | Protein | 1e-51 | 42 |
