|
Name : MCAP_0191 (MCAP_0191) Accession : YP_424179.1 Strain : Mycoplasma capricolum ATCC 27343 Genome accession: NC_007633 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycosyl hydrolase family protein Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.70 Position : 232248 - 233852 bp Length : 1605 bp Strand : + Note : identified by similarity to SP:P39795; match to protein family HMM PF00128 DNA sequence : ATGGCAAATTACTGATGGAAAAATACTGTAGTTTATGAAATGTATCTTCAATCATTTAAAGATTCAAATAATGATGGAAT TGGTGATTTAGATGGTGCTATAGAAAAATTAGAGTATTTAAAAGAACTGGGAATTGGTGCTATTTGATTAACTCCAATTT ATGATTCTCCACTTGTTGATAATGGGTATGATATTTCAAATTATCAATCTATTAATCAAATTTATGGTGGATTAGAAAAG TTTAAAAAATTTGTTGATAAAGCTAATGAGTTAAATATTGGTATAATTATGGATTTAGTTTTAAACCATACTTCAGATCA ACATGAATGATTTAAACAATCAAGATCATCAAAAACTAATCCATATCGTGATTATTATATTTGAAGAGATCAACCTAATG ATATTACTTCAGCTTTTGGTGGGTCTGCTTGAACTTATGATAAAACTACAAATCAATATTATTTTCATATGTTTGCAAAA GAACAACCTGATTTAAATTGGCAAAATCCTAAAGTTAGAGAAGAAATTGCAAAAATGGTTAAATGATGATGTGATTTTGG AATAATGGGATTTAGATTAGATGTGATTGAACTACTTGGTAAAAGAATTGATCAAAAGGTTTTATCTAATGGTCCAATGT TACATAAATATATTCAAGATTTAAGAAAAAATAGTTGAGATTCAAATGAATTTTTAACAGTTGGTGAATGTTGGTCAGCA GATATTGATCACGCAATTCAATATTCAAATGAAAAAAATGAAGAATTTTCAATGATTTTTAATTTTGAACCAGTTACTTC TTTTTTTAATAAAGATAATAAGTATAAGAAAAAAGCTGTCGATTTTTTAGAACTTAAACAAATTTATAAAAAATGACAAC AAGGATTACATAATAAAGGTTGATCTGGATTATTTTTATCAAATCATGATTTACCTAGAATGGTTTCAAGATATGGAAAT GATCAAAAATATAGAATTCAATCAGCAAAAACTTTATTAACTACTATTTTTTTAATGCAAGGAACTCCTTTTATTCATCA AGGTGATGAAATTGGAATGACTAATGTTAATTGAACAGATTTAAATAAATATAAAGATGTTGAAATTAAAAATACTTATC AATCAGAAGTTTTAAAAAAGAAGACTTTAACTTATGAACAATTTATAGAAGGAATATTAGAAAATAGTAGAGATCATGCA AGAACACCATATCAATGAGATGATAGTAAATATGCAGGATTTAGTAATCATCAACCTTGAATTGATGTAAATGATAATTA CAAAGAAATTAATGCTAAAAATGAGTTAAATAATCCAAATGGTATTTATCATTATTTAAAAAAATTAATTAAGTTTAGAG AAGAAAGTGATTATTCTCAATTAATTATTGATGCAAAATTTGAATTATTAGATCCAAATAATACTAAATTATTTGCTTAT AGCAGAATTGATCAAAATAGATCAATTAAAATAATTGCTAATTGAAGCGATGAACAAGTCAATATTAGCCATTTAATCAG TCAAGATAATAAGGTTGTTCTAAATACTGAAATTGATTTTGATCAAAATACTTTAAAACCTTGACAAACAATTATTGTTG AATAA Protein sequence : MANYWWKNTVVYEMYLQSFKDSNNDGIGDLDGAIEKLEYLKELGIGAIWLTPIYDSPLVDNGYDISNYQSINQIYGGLEK FKKFVDKANELNIGIIMDLVLNHTSDQHEWFKQSRSSKTNPYRDYYIWRDQPNDITSAFGGSAWTYDKTTNQYYFHMFAK EQPDLNWQNPKVREEIAKMVKWWCDFGIMGFRLDVIELLGKRIDQKVLSNGPMLHKYIQDLRKNSWDSNEFLTVGECWSA DIDHAIQYSNEKNEEFSMIFNFEPVTSFFNKDNKYKKKAVDFLELKQIYKKWQQGLHNKGWSGLFLSNHDLPRMVSRYGN DQKYRIQSAKTLLTTIFLMQGTPFIHQGDEIGMTNVNWTDLNKYKDVEIKNTYQSEVLKKKTLTYEQFIEGILENSRDHA RTPYQWDDSKYAGFSNHQPWIDVNDNYKEINAKNELNNPNGIYHYLKKLIKFREESDYSQLIIDAKFELLDPNNTKLFAY SRIDQNRSIKIIANWSDEQVNISHLISQDNKVVLNTEIDFDQNTLKPWQTIIVE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 7e-104 | 44 |
