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Name : SAB0424 (SAB0424) Accession : YP_415923.1 Strain : Staphylococcus aureus RF122 Genome accession: NC_007622 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha-glucosidase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.28 Position : 465966 - 467606 bp Length : 1641 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGTCGAAAGAAATAGATTGGAGAAAATCCGTTGTATATCAAATTTATCCTAAGTCGTTTAATGATACGACGGGGAATGG TATAGGAGATATTAACGGAATTATAGAAAAATTGGATTATATCAAGTTATTGGGTGTTGATTATATTTGGTTAACACCAG TGTATGAATCACCGATGAATGATAATGGCTATGATATCAGCAATTATTTAGAAATCAATGAAGACTTTGGAACGATGGAT GATTTTGAAAAGTTAATCAAAGTTGCTCATCAAAAAGACTTGAAAGTGATGTTAGATATTGTCATTAATCATACGTCTAC GGAGCATGAATGGTTTAAAGAAGCCCGTAAATCTAAAGACAACTCTTATAGAGATTATTACTTTTTCAGATCATCTGAAG ACGGACCGCCAACAAATTGGTATTCTAAATTTGGTGGTAATGCATGGAAGTATGATTCTGAGACAGATGAATATTATTTA CATTTATTTGATGTCAGTCAAGCTGATTTAAATTGGGATAATCCGGAAGTACGTCAATCGTTATATCGCATTGTCAATCA TTGGATAGACTTCGGCGTTGATGGTTTTCGATTTGATGTCATTAACTTAATTTCTAAAGGTGAATTTAAGGACTCTGACA AAATAGGTAAAGAATTTTATACGGATGGTCCTAGAGTGCATGAGTTTCTGCATGAATTAAATCGTCAAACGTTTGGTAAC ACTGACATGATGACTGTAGGAGAAATGTCTTCGACGACGATTGAAAATTGTATTAAGTATACACAGCCAGAACGCCAAGA ATTGAATAGTGTTTTTAATTTTCATCATCTAAAGGTTGATTATGTTGATGGTGAAAAGTGGACAAATGCGAAGCTTGATT TTCATAAGTTAAAGGAAATTCTGATGCAATGGCAACGAGGTATTTATGACGGTGGCGGATGGAACGCGATTTTCTGGTGT AATCATGATCAGCCACGGGTAGTGTCTAGATTTGGTGATGATACGTCGGAAGAGATGAGGATACAAAGTGCTAAAATGTT AGCTATCGCACTGCATATGTTGCAAGGGACGCCATATATTTACCAAGGTGAAGAAATTGGTATGACGGACCCACATTTTA CATCAATAGCACAATATCGTGATGTTGAATCGATTAATGCCTACCATCAGTTGTTAAGTGAAGGGCATGCTGAAGCGGAT GTGTTAGCGATTTTAGGACAGAAGTCACGAGACAATTCGAGAACGCCTATGCAATGGAGTGATGATGTTAATGCTGGATT TACAGCTGGTAAGCCTTGGATTGATATTTCGGAAAATTATCATCAGGTCAACGTTAGACAAGCACTTCAGAATAAAGATT CTATTTTCTATACGTATCAAAAATTAATACAATTAAGACATACGCATGATATTATTACGTATGGAGACATTGTGCCACGT TTTATGGATTATGATCATTTATTTGTTTATGAACGTCATTATAAGAATCAACAATGGCTAGTAATTGCGAATTTCTCAGC ATCGGCTGTTGATTTGCCAGAAGGATTGGCTAGCGAAGGTCGTGTTGTGATTCAAACAGGCACGGTGGAAAATAATACGA TAAGCGGGTTTGGTGCAATTGTAATCGAAACAAACGCGTAA Protein sequence : MSKEIDWRKSVVYQIYPKSFNDTTGNGIGDINGIIEKLDYIKLLGVDYIWLTPVYESPMNDNGYDISNYLEINEDFGTMD DFEKLIKVAHQKDLKVMLDIVINHTSTEHEWFKEARKSKDNSYRDYYFFRSSEDGPPTNWYSKFGGNAWKYDSETDEYYL HLFDVSQADLNWDNPEVRQSLYRIVNHWIDFGVDGFRFDVINLISKGEFKDSDKIGKEFYTDGPRVHEFLHELNRQTFGN TDMMTVGEMSSTTIENCIKYTQPERQELNSVFNFHHLKVDYVDGEKWTNAKLDFHKLKEILMQWQRGIYDGGGWNAIFWC NHDQPRVVSRFGDDTSEEMRIQSAKMLAIALHMLQGTPYIYQGEEIGMTDPHFTSIAQYRDVESINAYHQLLSEGHAEAD VLAILGQKSRDNSRTPMQWSDDVNAGFTAGKPWIDISENYHQVNVRQALQNKDSIFYTYQKLIQLRHTHDIITYGDIVPR FMDYDHLFVYERHYKNQQWLVIANFSASAVDLPEGLASEGRVVIQTGTVENNTISGFGAIVIETNA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-118 | 49 |
