Name : polA (SAB1549c) Accession : YP_417019.1 Strain : Staphylococcus aureus RF122 Genome accession: NC_007622 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : 2.7.7.7 Position : 1669718 - 1672348 bp Length : 2631 bp Strand : - Note : - DNA sequence : GTGAATAAATTAGTATTAATCGATGGTAATAGCTTAAGTTTTAGAGCTTTTTATGCATTACCTTTGTTATCAAACAAAGC AGGCATTCATACCAATGCAGTCTATGGTTTTGCAATGTTACTAGAGAAGATTTTAAAAGAAGAAAAGCCAAATCATTTTT TAGTTGCGTTTGATGCAGGTAAAACGACTTTCAGACATGAAAAATATAGTGAATATAAAGGTGGACGCCAGAAAACGCCG CCTGAACTAAGTGAGCAATTTCCTTATATACGCCAATTATTAGATGCTTATCATATTAAACGTTATGAATTAGATAACTA TGAGGCAGATGATATTATCGGAACTTTAAGTAAAGAAGCAGATAAAGCGGGCTTTCAGACAATTATTATTACGGGAGACC GAGATTTAACACAACTTGCAACGGATAATGTAACCATTTATTACACTAAAAAAGGTGTTACTGATGTTGATCATTATACA CCTGACTTTATTGCGGAAAAATACAACGGGCTAACACCTAATCAAATTATTGATATGAAAGGATTAATGGGAGATACTTC TGATAATATACCAGGTGTTGCAGGTGTTGGAGAGAAAACAGCAATAAAATTGCTGAATCAATTTGGCACAGTAGAAGGTG TCTATGAACATTTAGATGAAATTTCAGGTAAAAAGTTAAAAGAAAAACTTCAAAATAGCAAAGAAGATGCATTAATGAGT AAAGAATTAGCAACGATTAATGTAGATAGTCCGATTGAAGTAAAACTTGAAGATACGTTAATGACTCATCAAGATGAACA ACAAGAAAAAATCGAATTGTTTAAGAAGTTAGAATTCAAACAATTGTTGGCTGACATTGATCAATCAGCAAGCATTGAAG ATGCAATAGAAAAGACATTTGAAATTGAAACGTCTTTTGATAATGTTGATTTTACTTCATTGAAAGAAGCGGCCATCCAT TTCGAATTACACGGTGGTAACTATTTGCGAAATAATATTTTAAAATTCTCTTTATTTACAGGTGAGAAACATATTGTAAT TAATGCGGATGACATAAATAATTATGCCGAACTAGTTTCATGGTTAGAAAATCCGAATACGAAAAAAGTCGTATATGATG CTAAAAAAACATATGTAGCATCACATAGATTGGGAATTGATATTCAAAATATTTCATTCGATATTATGTTGGCCAGTTAT ATAATTGATCCATCTCGTACGATTAGTGATGTTCAATCAGTTGTTTCATTGTACGGTCAAAGTTTTGTGAAAGACGATGT GAGTATATATGGAAAAGGTAAGAAATTTAAGGTACCTGAAGATGATGTTTTAAATCCATATGTTGCTTCTATTACTGATG CAATTTACTTTGCGAAACCAAATATGGATAAACAATTAGAAGAATACAATCAGGTAGAACTCTTAGCTGATTTAGAGCTA CCGCTAGCTAAGATTTTAAGTGAAATGGAAGAAATTGGTATATATACAGATGTTCATGATTTAGAAGAAATGGAAAAAGA AATTCAAGAAAAATTAGATGTCTTGATTCGAAATATCCATGATGCAGCTGGTGAAGATTTTAATATAAATTCTCCTAAGC AATTAGGTGTTGTATTGTTTGAGACATTACAATTACCTGTTATTAAAAAGACGAAAACAGGATATTCTACTGCTGTAGAT GTCTTAGAGCAATTGCAAGGTGAACATCCTATCATTGATTATATTTTAGAATATCGTCAATTATCTAAGTTACAGTCTAC TTATGTTGAAGGATTGCAAAAGGTAATTAGTGATGATCAACGTATCCATACACGTTTTAACCAAACTTTAGCGCAAACTG GACGTTTATCAAGTGTAGATCCTAATTTACAAAATATTCCGGTTAGACTTGAAGAAGGGCGTAAAATAAGAAAAGCCTTT AAACCAACTTCAAAAGATAGCGTTATATTATCAGCAGATTATTCTCAAATTGAATTGCGTGTATTAGCACACATTACACA AGATGAGAGTATGAAAGAAGCATTTATCAACGGCGATGATATTCATACAGCAACTGCTATGAAAGTATTTGGTGTAGAAG CTGATCAAGTCGATATTTTAATGCGTCGTCAAGCAAAAGCGGTTAACTTTGGAATTGTTTATGGGATAAGTGATTATGGT TTAAGTCAAAGCTTAGGTATTACTCGTAAAAAAGCAAAAGCATTCATTGATGATTATTTAGCTAGTTTCCCAGGTGTAAA ACAATATATGTCTGATATTGTAAAAGATGCCAAAGCTTTAGGTTACGTGGAAACATTGCTACATCGTCGACGTTATATTC CTGATATTACGAGTCGTAACTTTAATTTACGCGGCTTTGCTGAACGTACTGCTATGAATACGCCAATACAAGGCAGTGCT GCAGATATCATTAAACTGGCAATGGTTAAATTTGCGCAAAAAATGAAAGAGACAACATATCAAGCTAAACTATTATTACA AGTGCACGATGAATTAATTTTTGAAGTACCTAAGTCAGAAGTAGATTCATTTAGTGAATTTGTAGAAGAGATAATGGAAA ATGCATTGCAATTAGATGTTCCATTAAAAGTAGACTCAAGTTATGGTGCAACTTGGTATGATGCAAAATAA Protein sequence : MNKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNKAGIHTNAVYGFAMLLEKILKEEKPNHFLVAFDAGKTTFRHEKYSEYKGGRQKTP PELSEQFPYIRQLLDAYHIKRYELDNYEADDIIGTLSKEADKAGFQTIIITGDRDLTQLATDNVTIYYTKKGVTDVDHYT PDFIAEKYNGLTPNQIIDMKGLMGDTSDNIPGVAGVGEKTAIKLLNQFGTVEGVYEHLDEISGKKLKEKLQNSKEDALMS KELATINVDSPIEVKLEDTLMTHQDEQQEKIELFKKLEFKQLLADIDQSASIEDAIEKTFEIETSFDNVDFTSLKEAAIH FELHGGNYLRNNILKFSLFTGEKHIVINADDINNYAELVSWLENPNTKKVVYDAKKTYVASHRLGIDIQNISFDIMLASY IIDPSRTISDVQSVVSLYGQSFVKDDVSIYGKGKKFKVPEDDVLNPYVASITDAIYFAKPNMDKQLEEYNQVELLADLEL PLAKILSEMEEIGIYTDVHDLEEMEKEIQEKLDVLIRNIHDAAGEDFNINSPKQLGVVLFETLQLPVIKKTKTGYSTAVD VLEQLQGEHPIIDYILEYRQLSKLQSTYVEGLQKVISDDQRIHTRFNQTLAQTGRLSSVDPNLQNIPVRLEEGRKIRKAF KPTSKDSVILSADYSQIELRVLAHITQDESMKEAFINGDDIHTATAMKVFGVEADQVDILMRRQAKAVNFGIVYGISDYG LSQSLGITRKKAKAFIDDYLASFPGVKQYMSDIVKDAKALGYVETLLHRRRYIPDITSRNFNLRGFAERTAMNTPIQGSA ADIIKLAMVKFAQKMKETTYQAKLLLQVHDELIFEVPKSEVDSFSEFVEEIMENALQLDVPLKVDSSYGATWYDAK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 49 |