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Name : Tcr_0057 (Tcr_0057) Accession : YP_390328.1 Strain : Thiomicrospira crunogena XCL-2 Genome accession: NC_007520 Putative virulence/resistance : Resistance Product : acriflavin resistance protein Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG0841 EC number : - Position : 68140 - 71199 bp Length : 3060 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATATTGCTGAGTATGCTATTAAAAAACGAACGGTCACGTTAATTTTAACTTTGTTCGTGATAATCGGTGGTTTATT TTCCTATGAGAATATGGGCCGTTTGGAAGACCCTGAGTTCACCATTAAAGAAGCGGTCATTATCACTTACTATCCCGGTG CATCTGCAGAGCAAGTGGCGGAAGAAGTTTCTGATAAACTTGAAACCAAAATTCAAGAATTAGGGGAAGTCAAAAAAATC CGTTCTTTAAATAAGCGCGGTTCTTCGGTTATTACTGTAGAGATGAAGAATAAATATGGTAAAAATGATCTCCCTTTAAT TTGGCAAAAACTGCGTTCTAAAGTAAATGATATTACACCAAGTTTGCCGCCTGGAGCTTCAAAACCGATTGTTAAAGATG ATTTTGGGGATGTCTACGGTATCTTATTTGCCATCACTGGTGATGGATTTTCTTACGCTGAAATCAAAGAGTACGCTAAA TTTTTACGTAAAGAATTATTGTTGGTGCCTGATGTCGCAAAGGTCGATATGACAGGGGTCCAGAACGAAACCATCTATAT AGAATTAAATCGCAATCAAATCGTCTCTTTAGGAATAGGCATTGATGAAATCGTTGATACTTTAAATAACAAAAACACCA TTCTCCCTGCGGGTAGTGTAAAAGTTGGCCCAGAATATATTGCTATAAATCCTACCGGTAAAGTTGATGCCATTGAAGAT ATTCAAAATCTGATCATTCAATCTAAAAACGGTTATACAAATCAAAAATCCAACTTAATTTATCTTAAAGATATTGCCAA TATCTATCGTGGTTACAAAGAACCACCCAATAGTATGATTCGTTTTAATGGATTTCCTGCCATTGCTTTAGGGGTTTCAA CGGTTGAAGGCGGAAATGTCGTTAAAATGGGGAATGCCATTAAAGCACGGTTAAATGAATTACAAACACAAATTCCAATC GGAATTGAATTAAACCCTATTTCCTTACAATCTGAAAGAGTAACTCAATCCATTAATGCTTTTATCATTAATTTGATTGA AGCAGTGTTAATCGTTGTAGCTGTATTGGTAATCTTTATGGGATTCCGCAGTGCATTAATCATTGGAGTAGCTTTGTTCA TTACTGTTATGGCGACGTTTATTCTAATGAAAACTCAAGGCATTTTACTTGAACGGATTTCTTTGGGAGCCTTGATTATT GCTTTGGGGATGCTGGTCGATAACGCCATAGTGGTCATTGATGGCATGTTGATTCGAATTCAAAAAGGGATGGATCGGAT CAAAGCAGCATCTGAAGTGGTCAAACAGAGTTTATGGCCGCTATTAGGGGCAACCTCGGTTGCTATATTGGCATTTGGTG CCATTGGTTTATCTCAAGACAGTACAGGCGAATATACTCGTTCTCTTTTTTATGTCATTTTATATTCATTGTTATTGAGT TGGTTGGTCGCAATCACAGTAGTACCGTTATTAGGTGTGATGTTTATCAAAGTCTCTACAAACCAATCCGATCCATTTGC TACTCGCTTCTATCAAGGATTAAAGAAGACTTTAATCGTATTGCTTAACCATCGATGGTTAACTGTTTTAGTCATGTTGG GATTACTTTACAGTTCTTTCTTAGCCTTCGCACAATTGAAGGACAGTTTCTTCCCTTCTTCGACACGTGATCAGTTTATG TTTCATATGTATTTTCCGGAAGGCACTGATATTCGAGAAGTTAGTGAAGTTAGTCATGAATTTGAACAAATCGTTTTAAA AGATGAGAAGGTTAAAAATATTTCTACTTTTGTTGGAAGTGGTGCTCCAAGGTTTTTGCTGACCTATTCACCCGAAAAAG ATCCCTCTTCTTATGTTTATATGGTGGTTACTGTTGATAATTATCAAGACATACCAGATTTGATGAAAAAATATCATGAT TATGTTTTAGTACATTATCCTTCGGTTTTACCCAGACCAGAAGCCTTTGCACTTGGACCGACAAAACCTGCAGTGGAAGC AGTTATTTATGGAGAGGATGCGGATACATTACGAGATATTGGGAGTCAAATTGAAGCGATTATGCGTGATCAAGGCGCAA CGGCAATACGGTCTGAATGGCGTGAGCGTGTTAAAGAGGTGGTTCCGGTATTTGATGAGGTACGTGCTCGTGAAATCGGT GTGACCCGCGAGGATTTTAATCGATCGCTTGACGTCAATTTTACCGGTATTAGGGTAGGGTATTATCGGGAAAAAGACGA AATGATTCCTATGGTTACCAGAAATGCCGAAAAAGATCGTTTCGATGTGGATCAGATCAATAATATTCAAGTCTGGAGCA GTGGCGCCCGAAAATATGTGCCGATTAATCAAGTTGTAAAAGAGATCAAGGTTGATTTTGTCGATGCTGCTTCGCATCGT AAAAATCGTAACCGGGTCTATAAAGTGATGTGCGACCCGGCCATAGGTGCTTTAAAAAGTTCGATTTTTGCTAAAGTACG TGCGCCCATTGAAGCATTAACCTTGCCTGAAGGTTATAGGTTGGAATGGGAAGGTGAGTTTGAAGCCTCCAATGATGCTC AAGCTGGATTGATGGCTTCCATTCCAACTTTCTTGATTTTGATGATTTTGATTGTCATAGCGCTCTTTAATTCTATTAAA GAACCATTGATTATTTGGTTGACTGTGCCATTAGCTTTGGTTGGGGTTGGGTTCGGGTTATTTGTGACGAATCAGCCATT CGATTTTATGGCGTTATTGGGATTCTTAAGTTTAACGGGAATGTTGATTAAAAACTCGATTGTCTTGATTGATGAAATTA ATTTAGAATTATCAGGTGGGCAAGAGCGTTTTGATGCCATTATTCATTCAGTCTTGTCTAGAACACGTCCAGTCAGCATG GGTGCTCTGACAACGGTATTGGGAATGATTCCTTTATTATCGGATGCCTTTTTTGTGGCAATGGCGGTGACTATTATGGC TGGTTTGGCATTCGCTACAATTTTGACGTTATTGTTTGTTCCGGTTTTATATGCCATTTTCCATAATGTCAAAGTCCCAC GAGCAGTCAAAGTATCATAG Protein sequence : MNIAEYAIKKRTVTLILTLFVIIGGLFSYENMGRLEDPEFTIKEAVIITYYPGASAEQVAEEVSDKLETKIQELGEVKKI RSLNKRGSSVITVEMKNKYGKNDLPLIWQKLRSKVNDITPSLPPGASKPIVKDDFGDVYGILFAITGDGFSYAEIKEYAK FLRKELLLVPDVAKVDMTGVQNETIYIELNRNQIVSLGIGIDEIVDTLNNKNTILPAGSVKVGPEYIAINPTGKVDAIED IQNLIIQSKNGYTNQKSNLIYLKDIANIYRGYKEPPNSMIRFNGFPAIALGVSTVEGGNVVKMGNAIKARLNELQTQIPI GIELNPISLQSERVTQSINAFIINLIEAVLIVVAVLVIFMGFRSALIIGVALFITVMATFILMKTQGILLERISLGALII ALGMLVDNAIVVIDGMLIRIQKGMDRIKAASEVVKQSLWPLLGATSVAILAFGAIGLSQDSTGEYTRSLFYVILYSLLLS WLVAITVVPLLGVMFIKVSTNQSDPFATRFYQGLKKTLIVLLNHRWLTVLVMLGLLYSSFLAFAQLKDSFFPSSTRDQFM FHMYFPEGTDIREVSEVSHEFEQIVLKDEKVKNISTFVGSGAPRFLLTYSPEKDPSSYVYMVVTVDNYQDIPDLMKKYHD YVLVHYPSVLPRPEAFALGPTKPAVEAVIYGEDADTLRDIGSQIEAIMRDQGATAIRSEWRERVKEVVPVFDEVRAREIG VTREDFNRSLDVNFTGIRVGYYREKDEMIPMVTRNAEKDRFDVDQINNIQVWSSGARKYVPINQVVKEIKVDFVDAASHR KNRNRVYKVMCDPAIGALKSSIFAKVRAPIEALTLPEGYRLEWEGEFEASNDAQAGLMASIPTFLILMILIVIALFNSIK EPLIIWLTVPLALVGVGFGLFVTNQPFDFMALLGFLSLTGMLIKNSIVLIDEINLELSGGQERFDAIIHSVLSRTRPVSM GALTTVLGMIPLLSDAFFVAMAVTIMAGLAFATILTLLFVPVLYAIFHNVKVPRAVKVS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| VC0395_A1355 | YP_001217299.1 | AcrB/AcrD/AcrF family transporter | Not tested | VPI-2 | Protein | 0.0 | 43 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| Tcr_0057 | YP_390328.1 | acriflavin resistance protein | BAC0519 | Protein | 0.0 | 47 |
| Tcr_0057 | YP_390328.1 | acriflavin resistance protein | BAC0428 | Protein | 0.0 | 46 |
| Tcr_0057 | YP_390328.1 | acriflavin resistance protein | BAC0526 | Protein | 0.0 | 44 |
| Tcr_0057 | YP_390328.1 | acriflavin resistance protein | BAC0425 | Protein | 0.0 | 43 |
