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Name : Tcr_1509 (Tcr_1509) Accession : YP_391775.1 Strain : Thiomicrospira crunogena XCL-2 Genome accession: NC_007520 Putative virulence/resistance : Virulence Product : NAD-dependent epimerase/dehydratase Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG0451 EC number : - Position : 1644346 - 1645356 bp Length : 1011 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAAGATACTTGTAACAGGTTCTGCTGGTTTTATTGGTTTTTATGTAACGCAAGCGTTGCTTAAAAAGAATCATGATGT TATCGGAATAGATAACTTAAATGATTATTATGATGTTGATTTAAAAAAGGCTAGGTTGAGTACTTTAAACCAAGTATGTA AAGAATCCGGGCTGGAAAAAAACTACCAATTCATCGAAATGGATATTGCAAATCGTGCTCAAGTGCACGATTTTTTTAAA GAGCATCGCTTTGATCGTGTGATTCACCTTGCGGCTCAAGCGGGGGTTCGCTATTCGATTGAGAATCCTCATGCTTATGT TGATTCAAACTTGGTCGCTTTTGTAAATATATTGGAAGGATGTCGCCAGCAGAAAACGGCTCATCTTATATACGCTTCTT CCAGTTCAGTGTATGGAATGAATACGAAGATTCCATTTTCCACTGAAGATAGGGTTGATTTCCCTATTTCACTTTATGCG GCGACTAAAAAATCAAATGAATTAATGGCACATACGTATAGTCATTTATATGGTATTCCGACAACCGGGTTAAGATTTTT CACTGTTTATGGTCCGTGGGGTAGGCCAGATATGGCCTATTTTTCATTTACCAAGAAGATTTTAAAAGGTGAAAAAATTG ACGTGTTTAATCACGGAAACATGGAACGAGACTTTACGTATATAGATGATATTGTGGAAGGTGTTGTTCGAGTTATGGAT CATGTTCCTGAGATAACACATTCAGAAATCACAGCCGCAGAAGCGCCTTATAAGATTTATAATATTGGAAATAATCAGCC GATAAAACTGGAACGTTTTATTAAGGCGATTGAAATGGCGACCGGTAAACAGGCGGTAAAGAATAACCTGCCCATGCAAG CAGGAGATGTTCCTAGAACCTATGCGGATGTCGGTGATTTAATGAATGATGTCGGTTTTAAACCGGAAACCACCATAGAA GATGGGGTTAACGCTTTTGTTGATTGGTACCGAGATTTTTATAAAGTGTAA Protein sequence : MKILVTGSAGFIGFYVTQALLKKNHDVIGIDNLNDYYDVDLKKARLSTLNQVCKESGLEKNYQFIEMDIANRAQVHDFFK EHRFDRVIHLAAQAGVRYSIENPHAYVDSNLVAFVNILEGCRQQKTAHLIYASSSSVYGMNTKIPFSTEDRVDFPISLYA ATKKSNELMAHTYSHLYGIPTTGLRFFTVYGPWGRPDMAYFSFTKKILKGEKIDVFNHGNMERDFTYIDDIVEGVVRVMD HVPEITHSEITAAEAPYKIYNIGNNQPIKLERFIKAIEMATGKQAVKNNLPMQAGDVPRTYADVGDLMNDVGFKPETTIE DGVNAFVDWYRDFYKV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cap1I | AAA64648.1 | type 1 capsule synthesis gene | Virulence | SCCcap1 | Protein | 2e-89 | 58 |
