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Name : recG (CHY_1468) Accession : YP_360300.1 Strain : Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 Genome accession: NC_007503 Putative virulence/resistance : Resistance Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : 3.6.1.- Position : 1309484 - 1311517 bp Length : 2034 bp Strand : - Note : catalyzes branch migration in Holliday junction intermediates DNA sequence : ATGGATATTCCGGTTCAGTACTTAAAAGGCGTAGGGCCACAAAAAGCCAAACTTTTGCAAAAGTTAAAAATTGAGACGGT AAAAGATTTAATTTACTACTTTCCGAAACGTTATGAGGATCGCAGTTCTTTAAAAAAAATAAGTGAATTAATTAATGATG AAGTGACAACGGTATTAGGAACTGTAGTTGAGGTGAAAGAAGTTATACCCAGGGACAAGTTAAAAATATTAAAAGTTGGG ATTAACGACGGTTCCGGTACTGCCTATGGTTGTTTTTTTAACCAGTCTTATCTAAAAAATGTTTTTATTAAAGGAAAAAA AGTTTATTTTTACGGAAAAGTTGAAAAGAGATTTTTCGAAACAAATATTTATGTTTATGAGTATGAATTTTGGGATAAAG AATTACTCCATACCAATCGCTTAGTACCAATTTATCCGTTAACGGAAAACCTTTCCCCCAAAACATTTCGCCAGTTAATT AAAAATGCTCTTGACAAATATCTTGAGGAAATCACCGAGCCTTTACCGGAGGAAATTTTAAGGAAATATAGTTTGCCAGA CCTTAAGCAAGCTTTAATGAATTTACATTTTCCGGAAAGCAGCGAACAGTCCGAATTAGCGCGACGTCGAATGGTTTTTG AAGAATTTCTCTTGTTTTTCCTGGCCATTGGATTATATAAAGAAAATTATCAGAAAAAGCCCGGGATTGTAATTGCAGGA AGTGGAGAGTTAGAGAAAAAATTTATTGATTCGCTCCCTTTTAAACTGACTTCAGCCCAGGAGAAGGTTTGGAGAGAAAT AAAAGAAGATTTAGCAGCTAAAAAACCAATGAATCGCTTGGTGCAGGGAGATGTGGGGAGCGGTAAAACCATTTTAGCTG CCCTTGCTCTGGTGAAAGCAGTGGAAGCGGGGTTTCAAGGGGCTTTAATGGCGCCCACTGAAATCTTAGCGGAACAGCAT TATTTGAACTTAAGCCGTCTTTTTGCTCCTCTCGGGATAAAGGTAGTTTTGCTTTCGGGGAGTTTATCATCGGGCAAGAA AGAAGCAGTTTATAAAGCCATTAAAAATGGGTACGCTGATGTAATAATTGGAACCCATGCTTTGATTCAGGAAGCTGTTA TTTTTGATAATTTAGGGCTGGCTGTGATCGATGAACAGCACCGGTTTGGAGTGGAACAACGAAGTAGTCTTGTGGAAAAA GGGTTATATGTTAACCAGTTAGTTATGTCGGCTACCCCAATTCCCCGTACGCTTGCTTTAACTTTATACGGTGATTTAGA TGTTTCTATTGTTGATGCTTTACCTGCGGGGAGAAAACCGATTAAAACATATTGGCTTTCTTCTCAGGATAAAGGTAAAG CTTACGCCTTTTTATTAAAGCAAGTTGCTGAAGGACGCCAGGGTTATGTGGTTTGCCCCCTGGTTGAAGAGTCGGAAAAG CTCCAAGTAGAGGCAGTTACTAAGCTTTACGAAAAGCTTTCTAAAAAATTTCCCCAGTTTAAGTGGGGTTTAATGCACGG ACGGTTAAAACCTGCGGAAAAAGAAGAGGTAATGGAAAACTTCCGTAAAAATAATATTCAAATCTTGGTTTCGACTACGG TAATTGAAGTGGGAGTTGATGTGCCCAATGCCAATGTTATTATTATAGAGGATGCCTGGCGTTTTGGTTTAGCCCAGCTT CATCAAATTCGCGGTCGGGTAGGCCGGGGTGAGCATCAATCCTACTGTTTTCTTTTAGGAAACCCCAGAAATCAGGAAGG TATTGTTAGGATGAAAATTATGGAAAAATACAATGATGGATTTAAAATTGCCGAGGAAGATTTGAAATTAAGAGGGCCAG GAGAACTTAGCGGAACCCGTCAGTCAGGGGCCTGGGAATTTAAACTTGCCGATATTGTGCGAGATCAAGCCATATTGTTT TTAGCTAAAAAGGAAGCAGATGAGATCTTAACCAATAAGGAAAATCATCGTGCGCTTATTACCCTTGCTTTGGAGAAATA TGGAGATAAAATTAATATGCTTCAAAAAAATTAA Protein sequence : MDIPVQYLKGVGPQKAKLLQKLKIETVKDLIYYFPKRYEDRSSLKKISELINDEVTTVLGTVVEVKEVIPRDKLKILKVG INDGSGTAYGCFFNQSYLKNVFIKGKKVYFYGKVEKRFFETNIYVYEYEFWDKELLHTNRLVPIYPLTENLSPKTFRQLI KNALDKYLEEITEPLPEEILRKYSLPDLKQALMNLHFPESSEQSELARRRMVFEEFLLFFLAIGLYKENYQKKPGIVIAG SGELEKKFIDSLPFKLTSAQEKVWREIKEDLAAKKPMNRLVQGDVGSGKTILAALALVKAVEAGFQGALMAPTEILAEQH YLNLSRLFAPLGIKVVLLSGSLSSGKKEAVYKAIKNGYADVIIGTHALIQEAVIFDNLGLAVIDEQHRFGVEQRSSLVEK GLYVNQLVMSATPIPRTLALTLYGDLDVSIVDALPAGRKPIKTYWLSSQDKGKAYAFLLKQVAEGRQGYVVCPLVEESEK LQVEAVTKLYEKLSKKFPQFKWGLMHGRLKPAEKEEVMENFRKNNIQILVSTTVIEVGVDVPNANVIIIEDAWRFGLAQL HQIRGRVGRGEHQSYCFLLGNPRNQEGIVRMKIMEKYNDGFKIAEEDLKLRGPGELSGTRQSGAWEFKLADIVRDQAILF LAKKEADEILTNKENHRALITLALEKYGDKINMLQKN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 3e-92 | 44 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| recG | YP_360300.1 | ATP-dependent DNA helicase RecG | BAC0356 | Protein | 2e-99 | 45 |
