Gene Information

Name : Noc_1245 (Noc_1245)
Accession : YP_343276.1
Strain : Nitrosococcus oceani ATCC 19707
Genome accession: NC_007484
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cytochrome c oxidase
Function : -
COG functional category : C : Energy production and conversion
COG ID : COG0843
EC number : 1.9.3.1
Position : 1364437 - 1366044 bp
Length : 1608 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGAGTGCTAATGCTGCTGCAGAATACACGAGCTATCTTGGTGGGGGAGATACCCTAAAATCCTGGTTAACAACACTTGA
TCATAAGCGTATAGCTGTACTCTATCTCATCTCTATTACGCTGTTCTTTCTTATTGGGGGAGTAGCTGCTGCCGTGATAC
GCCTAGAATTAGTAACCTACGCGGGGGATTTTGTTACGGCCGAAACCTATAACAAAACTTTCTCTCTCCATGGTATTGTC
ATGGTCTGGTTTTTCCTAATTCCTTCCATTCCAGCGACACTAGGTAATTTCCTTATTCCGCTGATGGTTGGCGCTCGGGA
TCTTGCTTTTCCCCGCTTGAACTTGGCGAGCTGGTATTTATATACGGTAGGGGGGATATTTACTATTGGTATGGTGATTG
CCGGTGGCGTAGATACAGGATGGACCTTTTACACGCCATTTAGCACCATGTTCTCCAACACGTATGTTGTCGCGGCTGTT
ATTGGGGTGTTTATCGTTGGTTTTTCTACTATATTCACTGGCATAAATTTTATTGTAACCATTCATAAAATGCGAGCGCC
AGGTTTAACCTGGTTTCGTTTGCCCATGTTCGTGTGGGCCAATTATGCTACCAGTGCCATCATGGTGCTGGCGACTCCCG
TGCTGGCAATGACTCTTACCTTGGTGGCAGTTGAACGGATATTCCAGATAGGCATCTTTGATCCTGCGTTGGGGGGAGAT
CCTTTGTTATTTCAGCACCTGTTCTGGTTTTATTCCCATCCTGCTGTGTATATTATGGTTTTGCCTGCCATGGGAGTAGC
GAGCGAGCTTATTGCTTGCTTTTCTAGAAACCCTATTTTTGGTTATCGCTTTATGGCTTACTCCGTAATGGCCATTGCGG
TCCTTGGTTTTTTGGTTTGGGGTCATCACATGTTTGTGAGTGGCCAATCTGTTTATGCGGGCATGATGTTCTCGCTATTT
AGTTTTGTGGTTGCTATTCCCTCGGCTATCAAAGTTTTTAATTGGACTGCTACCCTATACAAAGGATCTATCTCTTTTGA
AGCGCCCATGCTTTATGCGCTAGGATTTGTATTCCTGTTTATGATTGGCGGTCTAACTGGAATCGTTGTGGCGGCTCTGG
CCCTGGACGTTCACTTGACGGATACTTACTTCGTGATTGCCCACTTTCACTATATTATGGTGGGGGGATCGGTGATGGCG
TATTTGGGAGGTATTCACTTCTGGTGGCCTAAAATGACCGGGAAAATGTATTCTGAAATGTGGGGTAGGGTTGCCGCTGT
ATTAATTTTCGTGGGCTTTAATGTAACATTCTTCCCGCAGTTTTTGCTGGGTTATTTAGGTATGCCAAGGCGTTATCATG
AGTATCCGGAGGCACTAGAAGTGCTCAATGTAATCTCTTCAGGGGGAGCCGTAATTCTAACATTGGGTTACCTTCTACCC
CTCGTGTATTTATTATGGTCATTGCGCTATGGGCGTATTGCCGGTGGGAATCCTTGGGAGGCAAAAGGATTAGAGTGGCA
AACCTCCTCGCCACCTGCTAAACATAATTTTAAGGAAACCCCCGTCGTGACGGAGGAAGCCTATGCTTATTCGCCATATA
AGGTTTAA

Protein sequence :
MSANAAAEYTSYLGGGDTLKSWLTTLDHKRIAVLYLISITLFFLIGGVAAAVIRLELVTYAGDFVTAETYNKTFSLHGIV
MVWFFLIPSIPATLGNFLIPLMVGARDLAFPRLNLASWYLYTVGGIFTIGMVIAGGVDTGWTFYTPFSTMFSNTYVVAAV
IGVFIVGFSTIFTGINFIVTIHKMRAPGLTWFRLPMFVWANYATSAIMVLATPVLAMTLTLVAVERIFQIGIFDPALGGD
PLLFQHLFWFYSHPAVYIMVLPAMGVASELIACFSRNPIFGYRFMAYSVMAIAVLGFLVWGHHMFVSGQSVYAGMMFSLF
SFVVAIPSAIKVFNWTATLYKGSISFEAPMLYALGFVFLFMIGGLTGIVVAALALDVHLTDTYFVIAHFHYIMVGGSVMA
YLGGIHFWWPKMTGKMYSEMWGRVAAVLIFVGFNVTFFPQFLLGYLGMPRRYHEYPEALEVLNVISSGGAVILTLGYLLP
LVYLLWSLRYGRIAGGNPWEAKGLEWQTSSPPAKHNFKETPVVTEEAYAYSPYKV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1478 YP_001800872.1 cytochrome c oxidase subunit I Not tested Not named Protein 1e-77 41