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Name : PSHAb0486 (PSHAb0486) Accession : YP_341969.1 Strain : Genome accession: NC_007482 Putative virulence/resistance : Resistance Product : AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG0841 EC number : - Position : 548667 - 551732 bp Length : 3066 bp Strand : - Note : Evidence 2b : Function of strongly homologous gene; PubMedId : 15155734; Product type t : transporter DNA sequence : ATGGATTTAGCAAAGTGGACTATTAATAACAAACTAATTAGTACCATAATTATTATACTGACGTTAGGCTTTGGCTTCTC TTCATATAAAAACATGGCACGATTTGAAGACCCTGAATTTATAATTCGTACCGCACAAGTGTTTGTTCCTTACTCTGGTG CGAGCCCTTTAGAGGTAGCCCGAGAAGTAACTGAGCCTTTAGAACGTGCTATTCAAGAATTGCAGGAAATTGATACCATA TCGTCTACCTCTTCATCGGGTATGTCTGAGATAAAAGTTGAGATTAAATCGGAGTTTTCGCCGACAAAGTCTGAGCTACA GATTATATGGACCAAACTAAGAAATAAAATTAATGATGCTCGCCCTTCCCTTCCACCAGGTACAGGTACGCCACAAATAT TTGACGATTTTGGTGATGTATATGGTTTAAGCTATTTAATTACAGCCGAGGGTTACTCTCCTGATGAGCTGCATGCCTAC GCTAAAAACTTACAAAGTGATATTTTACAGGTTAAAGGCGTTGCTAAAGTAGCTATGACCGGTGTTCAGCAAGAAGGTAT TTTTGTTGAAATAGCCCGTGAAGATTTGGCCACTTTAGGTAGCTCAATCAGTAATATTTATTCAATTTTAGATAAGCAAA ATACAGTAATAAGTGCCGGTAATACGCAAATTGGTGATCAACGTATTTTTATAGATCCCACCGGCTCTATTAATTCTATT GAAACAATACAAAACCTATTAGTGAGCGCCACCAATGACGGTAAAGCTATATATTTAAAAGATATTGCTAATGTATATCG TGGTTTTCAAAGCCCAGCAACTAAACTTGTACGTTACAACGGGCAACCGGCAATTTCTTTAGGGGTTGCCAGTGTGCTTG GTACTAACGTTGTTAAAGTGTTTGAGCGCGTAGATGAGCGCGTTAAACAAGCTGAAAACGTGAGACCCATTGGTATAACA GTGCATGAATATTATCATCAAGGTAAGGTTGTTCAGGCATCGGTAGATAACTTTGTAGTAAATGTAATTGTGGCATTAAT TATTGTTGTTGTTACTTTACTTGTGTTTATGGGGCTGCGCTCTGGGCTTGTTATTGGCGCAGTATTACTACTGACTATTT TTGCCACACTAGCAACCATGGATTTTAGCGGCATACCCATGCACCGAATTTCACTTGGGGCATTAATTATTGCTTTAGGG ATGATGGTTGATAATGCCATTGTTGTCACCGAGGGAATACTGGTTGGTACTAAACAAGGGCGCAAAAAGCTAGAAATAGC ATCTGAAGTTGTAAAGCAAACAAGGTGGCCCTTATTAGGCGGCACTTTGGTAGGTATTGTGGCCTTTGCACCTATAGGTT TAGCACCGGGTGATACTGCCGAATTTACTGGGCATTTATTTTGGGTTATTTTAATTTCTTTACTTTACAGTTGGTTATTT GCAATTACCCTAACGCCACTATTTTGTTTTTGCTTGTTTAAAGAACAAGATAAAGACACCTCTACAACAGCTAAGCCTAA TATGATTATGGCGGCTTATCAATCCATTGTTGTTAGCTCGCTTAATCATCGCTGGTTAACAGTTGCTGTAGTGATATTTA CTTTTAGTGCATCAATGTGGGGATTTCAGTTTGTAAAATCTGGGTTTTTCCCAGCCTCTACAACACCACAAATGGTAGTA GATTTTTGGTTACCGCAAGGAACTGATATCGAAAAAACCAAAAAAGATATGATCAAGCTTGAATCCTTTATTCAACAGCA AGAGAGTATTGAGGGCGTACAAACCTTAATTGGTGGTGGCGGTTTACGATTTATGCTTATTTATGGAGCAGAATCACCAA ACAGTTCTTACGGCCAAATATTAGCTAAAGTAGATGACTATAAAGTGCTTGATACTATGATCCCTAAAGTACAAGCGTAT ATAGATGACACCTTCCCAGAAGCGCAAGGCAAAGTATGGCGCTTTGTAATGGGACCCGGAGGTGGTTCTAAAATTGAGGC AACATTTAAAGGGCCAGAACCCGCAGTAATTCGTGAATTAGCCGATAAAGCGAAAGCAATCATGATTGATGACGGCGGTG CACTCTCAATTAAAGATACTTGGCGCCAGCAAGTTAGGGTTATTGAACCGCAATACTCGCCAATTAATGCCCAGCGTGCA GGTGTAACACGCAAAGCAATTGCTGAAGCGTTACAACAAAACTTTTCTGGTAAAACGGTTGGCCAATATAGAGAAGGTGA AGAGTTAATTCCTATTATTGTTAGAGCTCCCCTAAAAGAGCGCTCGAATGTTAATGATATAGGCAACATTCAAATTCCTA GCCAAATCACAGGTAAAACAATCCCATTAGAGCAAGTTACTAATGGATTTAAAACCGTATGGCGTGATGGTATTTTAAAG CGCGAAGATAGAATGTGGACAATTAAGGCTCAAGCCGATCCACTTCCTGGGCAGCTTGCATCTGAATTATTTAATCGAGT AAGGCCACAAATAGAAGCGATTGACTTACCTGCCGGTTACACATTGGAATGGGATGGTGAGTATGGGCAATCAAAAGAGT CAAATGAAATGCTTGCATCAACACTACCACTTGGCCTTTTAGCTATGGTGCTAATTGTAGTGGTGTTATTCAATGCTTTA AAACAACCTATTATTATTTGGCTTGTGGTACCGCTGGCTCTTATAGGCGTGGTATTTGGCTTAGTAACAACACAAACTCC ACTTGAGTTTATGGGGATATTAGGATTGCTCTCTTTATCTGGTCTACTCATTAAAAATGCCATTGTATTGGTTGATCAAA TGGATATGGAAATTAAGCAAGGTAAACCACGTTATGATGCCATTGTCGATTCGGCTAATAGCCGAGTAAGACCAGTAATG ATGGGAACACTAACAACAGTACTTGGGGTAATACCGCTTTATTTTGATGCGTTTTTCCAATCAATGGCGGTTGTATTAGT ATTTGGCCTACTCTTTGCTACATTACTAACCTTAATTGTTATACCTGTGCTTTACGCTATTTTTATGGGCGTTAAAAAAG ATGAACGCACACCAGTTAATGCCTAA Protein sequence : MDLAKWTINNKLISTIIIILTLGFGFSSYKNMARFEDPEFIIRTAQVFVPYSGASPLEVAREVTEPLERAIQELQEIDTI SSTSSSGMSEIKVEIKSEFSPTKSELQIIWTKLRNKINDARPSLPPGTGTPQIFDDFGDVYGLSYLITAEGYSPDELHAY AKNLQSDILQVKGVAKVAMTGVQQEGIFVEIAREDLATLGSSISNIYSILDKQNTVISAGNTQIGDQRIFIDPTGSINSI ETIQNLLVSATNDGKAIYLKDIANVYRGFQSPATKLVRYNGQPAISLGVASVLGTNVVKVFERVDERVKQAENVRPIGIT VHEYYHQGKVVQASVDNFVVNVIVALIIVVVTLLVFMGLRSGLVIGAVLLLTIFATLATMDFSGIPMHRISLGALIIALG MMVDNAIVVTEGILVGTKQGRKKLEIASEVVKQTRWPLLGGTLVGIVAFAPIGLAPGDTAEFTGHLFWVILISLLYSWLF AITLTPLFCFCLFKEQDKDTSTTAKPNMIMAAYQSIVVSSLNHRWLTVAVVIFTFSASMWGFQFVKSGFFPASTTPQMVV DFWLPQGTDIEKTKKDMIKLESFIQQQESIEGVQTLIGGGGLRFMLIYGAESPNSSYGQILAKVDDYKVLDTMIPKVQAY IDDTFPEAQGKVWRFVMGPGGGSKIEATFKGPEPAVIRELADKAKAIMIDDGGALSIKDTWRQQVRVIEPQYSPINAQRA GVTRKAIAEALQQNFSGKTVGQYREGEELIPIIVRAPLKERSNVNDIGNIQIPSQITGKTIPLEQVTNGFKTVWRDGILK REDRMWTIKAQADPLPGQLASELFNRVRPQIEAIDLPAGYTLEWDGEYGQSKESNEMLASTLPLGLLAMVLIVVVLFNAL KQPIIIWLVVPLALIGVVFGLVTTQTPLEFMGILGLLSLSGLLIKNAIVLVDQMDMEIKQGKPRYDAIVDSANSRVRPVM MGTLTTVLGVIPLYFDAFFQSMAVVLVFGLLFATLLTLIVIPVLYAIFMGVKKDERTPVNA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| VC0395_A1355 | YP_001217299.1 | AcrB/AcrD/AcrF family transporter | Not tested | VPI-2 | Protein | 0.0 | 49 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| PSHAb0486 | YP_341969.1 | AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter | BAC0425 | Protein | 0.0 | 49 |
| PSHAb0486 | YP_341969.1 | AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter | BAC0428 | Protein | 0.0 | 46 |
| PSHAb0486 | YP_341969.1 | AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter | BAC0519 | Protein | 0.0 | 45 |
| PSHAb0486 | YP_341969.1 | AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter | BAC0526 | Protein | 0.0 | 44 |
