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Name : ctaD (PSHAa2871) Accession : YP_341349.1 Strain : Genome accession: NC_007481 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase subunit I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.9.3.1 Position : 3043406 - 3044998 bp Length : 1593 bp Strand : - Note : Evidence 2a : Function of homologous gene experimentally demonstrated in an other organism; PubMedId : 9672683, 8117073; Product type m : membrane component DNA sequence : ATGAGTAGCATAGTAGAACAACCTGACATTAATGAAGCTCACCACGCTCATCATCCTGCTAAAGGCTTTAAGCGTTGGTT ATATACCACTAATCATAAAGATATAGGTAGCTTGTACTTAATTTTTTCGCTAACTATGTTTTTTATTGGTGGTGCTATGG CTATGGTGATCCGCGCTGAGTTATTTCAGCCAGGATTGCAATTAGTCGATCCTCACTTTTTTAATCAAATGACCACGGTT CATGGGTTGATTATGGTATTTGGTGCCGTTATGCCGGCCTTTACTGGCTTAGCTAACTGGATGGTGCCATTAATGATTGG CGCGCCTGATATGGCCTTACCCCGAATGAATAACTGGAGTTTTTGGATTTTACCATTCGCGTTTTTAATTTTATTATCAT CGCTATTAATGCCCGGTGGCGGTCCTGCGTTTGGTTGGACTTTTTATGCGCCGCTGTCCACAACCTACAGTAATGACAAT ACCGCCATGTTTGTATTTGCTGTGCATATTATGGGTATTAGCTCCATTATGGGGGCAATTAATGTAATTGTAACCATAGT TAACTTGCGTGCCCCAGGCATGACTTGGATGAAGGTCCCTATGTTTGTATGGACTTGGCTGATAACGGCATTTTTATTAA TTGCGGTTATGCCGGTACTCGCAGGTGCAGTGACCATGGTGCTCACCGATAAATACTTTGCAACCAGCTTTTTTGATGCA GCTGGTGGCGGTGATCCGGTGATGTTTCAGCACATATTTTGGTTTTTTGGCCACCCCGAAGTATACATAATGATTTTGCC GGCTTTTGGCATTATTTCTACTATAGTTCCTACCTTTTCGCGTAAAAAACTTTTTGGTTATTCCTCCATGGTATATGCCA CGGCGTCAATTGCGTTGTTGAGTTTTACAGTGTGGGCGCATCATATGTTTACTACCGGTATGCCGGTGGCTGGCGAGCTA TTTTTTATGTACGCGACTATGCTGATATCGGTGCCCACTGGAGTAAAAATATTTAATTGGGTAGCCACTATGTGGCGCGG TTCAATTACGTTTGAAGTCCCCATGCTGTTTAGTATTGCTTTTATTGTGTTGTTTACCTTAGGTGGTTTTTCGGGATTGA TGCTGGCCATTACACCGGCTGATTTTCAGTACCATGATACCTACTTTGTAGTGGCACATTTTCATTATGTACTGGTAACG GGAGCGGTGTTTTCTATTATGGCAGGCGCGTATTATTGGCTGCCTAAATGGACTGGCAATATGTATAACATAGCGCTGGC TAAATGGCATTTTTGGTTATCGCTGGTAAGCGTAAATGTATTGTTTTTTCCTATGCACTTTGTAGGGCTTGCAGGCATGC CACGCCGTATACCCGACTATGCGCTACAGTTTGCTGACTTTAACGCCATTATTAGTATTGGCGGCTTTGCCTTTGGATTA TCGCAGTTGTTGTTTGTAGCTGTAGTGATTAAATGCGCACGCGGCGGCGACAAGGTTCCTGCAAAAGTGTGGGAAGGCGC AGAAGGACTGGAGTGGGAGGTAGATTCACCTGCTCCGTACCATACATTTTCAACACCACCGGAAATTAAATAA Protein sequence : MSSIVEQPDINEAHHAHHPAKGFKRWLYTTNHKDIGSLYLIFSLTMFFIGGAMAMVIRAELFQPGLQLVDPHFFNQMTTV HGLIMVFGAVMPAFTGLANWMVPLMIGAPDMALPRMNNWSFWILPFAFLILLSSLLMPGGGPAFGWTFYAPLSTTYSNDN TAMFVFAVHIMGISSIMGAINVIVTIVNLRAPGMTWMKVPMFVWTWLITAFLLIAVMPVLAGAVTMVLTDKYFATSFFDA AGGGDPVMFQHIFWFFGHPEVYIMILPAFGIISTIVPTFSRKKLFGYSSMVYATASIALLSFTVWAHHMFTTGMPVAGEL FFMYATMLISVPTGVKIFNWVATMWRGSITFEVPMLFSIAFIVLFTLGGFSGLMLAITPADFQYHDTYFVVAHFHYVLVT GAVFSIMAGAYYWLPKWTGNMYNIALAKWHFWLSLVSVNVLFFPMHFVGLAGMPRRIPDYALQFADFNAIISIGGFAFGL SQLLFVAVVIKCARGGDKVPAKVWEGAEGLEWEVDSPAPYHTFSTPPEIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 2e-90 | 44 |
