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Name : proWX (SAK_1817) Accession : YP_330414.1 Strain : Streptococcus agalactiae A909 Genome accession: NC_007432 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycine betaine/proline ABC transporter permease/substrate-binding protein Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG4176 EC number : - Position : 1807342 - 1809069 bp Length : 1728 bp Strand : - Note : identified by similarity to GB:AAK05549.1; match to protein family HMM PF00528; match to protein family HMM PF04069 DNA sequence : TTGGAAAATTTATTACAACATAAGTTACCGGTCGCACCATTTGTAGAGTCAGCGACCAATTGGATTACGAAAACTTTTTC TGGTTTATTTGACTTTATCCAGACAATCGGTAATGCATTGATGGATTGGATGACAAAAACATTACTATTCATTAATCCTT TACTTTTTATTGTACTAATTACAGCTGCTGTATTTTTCTTAGCTAAGAAAAAATGGCAATTACCGACATTTACTTTCATT GGTTTGCTATTTATCTATAACCAAGGGCTGTGGGAGCAGTTGATTAACACTTTTAACTTGGTTTTAGTAGCAAGTTTAAT TTCTATTATTATTGGTGTACCACTAGGTATTTGGATGGCAAAAAGTGATAAAGTTAAACAAGTTGTTAATCCAATTCTTG ACTTTATGCAAACTATGCCAGCATTCGTTTACCTTATTCCTGCAGTAGCCTTCTTTGGTATCGGTATGGTACCAGGTGTC TTTGCCTCTGTTGTATTTGCTTTGCCTCCAACAGTGCGCTTTACTAACTTGGCTATTCGTGAAATCCCACTTGAGTTAAT AGAAGCATCTGATTCATTTGGTTCAACAGCTAAGCAAAAATTATTCAAAGTTGAACTACCACTTGCTAAGAACACTATTA TGGCAGGAATCAATCAAACTATGATGTTGGCTCTTTCTATGGTGGTTACAGGATCTATGATCGGTGCACCTGGACTTGGT CGTGAAGTGTTATCGGCGCTTCAACATGCTGACATTGGTACAGGGTTTGTTAGTGGTCTATCGCTAGTTATTTTAGCAAT CGTGTTAGACCGTGTTAGTCAATTCTTTAATTCTAAACCGGGTGAGAAGCAAGCTAAAACATCAAAAGTTAAAAAATGGG TAGGTTTAGGGGCCCTGGCTCTCTTCATTCTAGCAGCTCTTGGTCGCATTGTTGTCAATATGACTTCAGGAAATGAAGCC AAAGGTCAAAAAGTGAAAATAGCTTATGTCCAATGGGATTCAGAAGTTGCTTCAACCAACGTTATTGCTGAAGTTTTAAA ATCTAAAGGATATGATGTTGAATTGACACCACTTGATAATGCAGTCATGTGGCAAACAGTTGCCAATGGGAATGCTGATT TTACAACAAGCGCTTGGTTACCAAAGACCCACGGGCAATATTTTAATAAATACAAAAATAGTTTAGATGACTTAGGTCCT CACGTTGAGAACGTCAAAATAGGTTTAGTTGTTCCTAAATACATGAACGTAAATAGTATTGAAGAATTATCAAATCAAGC AGATAAACAAATTACAGGTATCGAACCAGGTGCAGGTATTATGAAGTCTGCTAAACAATCCCTTAAAGATTATCCAAATC TTTCAAGTTGGAAGTTGTTATCAGCATCAACAGGAGCTATGACAACAACCTTAGGGAAGGCTATCAAAAACAAAGATCAA GTGGTCATTACAGGTTGGTCACCTCACTGGATGTTTGCTAAGTATGATTTAAAATACCTTAAAGATCCTAAGAAATCATT TGGTGGTGAAGAACATATCAATACAATAGCACGCAAGAATTTGAAAAAAGATATGCCAAAAGTATATAAAATTATCGATA AGTTCAAGTGGACTAAAGAAGATATGGAATCTATCATGTTAGATATGGATAAAGGTATGGAGCCTGCTAAAGCAGCTCAA AAATGGATTAAAAACCACAAAAAAGAAGTTTCAGAGTGGACTAAATAG Protein sequence : MENLLQHKLPVAPFVESATNWITKTFSGLFDFIQTIGNALMDWMTKTLLFINPLLFIVLITAAVFFLAKKKWQLPTFTFI GLLFIYNQGLWEQLINTFNLVLVASLISIIIGVPLGIWMAKSDKVKQVVNPILDFMQTMPAFVYLIPAVAFFGIGMVPGV FASVVFALPPTVRFTNLAIREIPLELIEASDSFGSTAKQKLFKVELPLAKNTIMAGINQTMMLALSMVVTGSMIGAPGLG REVLSALQHADIGTGFVSGLSLVILAIVLDRVSQFFNSKPGEKQAKTSKVKKWVGLGALALFILAALGRIVVNMTSGNEA KGQKVKIAYVQWDSEVASTNVIAEVLKSKGYDVELTPLDNAVMWQTVANGNADFTTSAWLPKTHGQYFNKYKNSLDDLGP HVENVKIGLVVPKYMNVNSIEELSNQADKQITGIEPGAGIMKSAKQSLKDYPNLSSWKLLSASTGAMTTTLGKAIKNKDQ VVITGWSPHWMFAKYDLKYLKDPKKSFGGEEHINTIARKNLKKDMPKVYKIIDKFKWTKEDMESIMLDMDKGMEPAKAAQ KWIKNHKKEVSEWTK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 77 |
