Name : SSP0084 (SSP0084) Accession : YP_300174.1 Strain : Staphylococcus saprophyticus ATCC 15305 Genome accession: NC_007350 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease 2 Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 100592 - 102196 bp Length : 1605 bp Strand : + Note : similar to gi|27468863|ref|NP_765500.1| [Staphylococcus epidermidis ATCC 12228], percent identity 70 in 533 aa, BLASTP E(): 0.0 DNA sequence : ATGTTAGTTGAAAGTTTTAACCCTTTTAATAATCTGCTACTTTCAAGTATTGTAGCCGCAATACCAATTATATTATTTTT ATTATGTTTGACTGTATTTAAAATGAAAGGTGTTTATGCAGCAATTACAACGTTAATCGTTACAATTATTGTTGCTATGG CTTTCTTTAAATTACCAGGAAGTATTGCAGGCGGCGCTACTTTAGAGGGCTTTTATCAAGGGATTATCCCAATAGGCTTT ATTGTAATCATGGCAGTTTGGTTATATAAAATTGCTACAAAAAGCGGCCAATTTGCTATTGTTCAAGATAGTATCGCGAG TGTCTCACGAGACCAACGTGTTCAATTATTATTGATTGGCTTTGTATTTAATGGATTTTTAGAAGGTGCTGCAGGCTTTG GCGTACCTATTGCCATTTGTGCGGTACTATTAACACAATTAGGTTTTAAACCTTTGCAAGCTGCGATGTATTGTTTAGTA AGTAATGCAGCAGCAGGTGCTTATGGTGCGGTAGGTATACCGATTGCTATCGTGGATACTTTGAATTTGCCAGGTGGTGT AACAACATCTCAAGTAGCGTTAATTGGTAATTTAACGTTAGGCTTTATTAGTTTCGTTGTGCCATTTTTATTAATGTATA TTATGGATGGCTTTAAAGGTGTGAAAGAAACTTTCCCAGCCACTTTAGTTGTGGCAGTTACTTTCACAGTTTTACAAGTG CTTATTGCAGCTTTTGCTGGACCAGAGTTGGCTGATATTATCCCTGGCCTTGTAGCAATGATTGCATTAGCATTGTTCTC AAAAAAATGGCAACCTAAAAATATTTTCAGAATTAATAAAGATGAAAAAGCAGATGCCGTGCCTAAACATTCTATTGGAC ACATCACTTATGCATGGAGCCCGTTTATCATTTTAACGATTGTTGTGATGATCTGGAGCTTACCAGCATTTAAAGGTTTA TTTGAAAAAGGTGGTGCCCTAAGTGCACTTGTTGTGAACTTTAATGTGCCGGGTACGATGAATGCTGTGACTAATAAACC GAATGAACTGACATTCAATTTCTTTGCTCAAACAGGTACAGCGATTTTAATTACAGCGATCATTACAATTATTATTGCGA AAAATATGAGCTTTAAAACGGCTGGTCATTTACTGGGTCTCACAGTTAAAGAATTATGGATTTCAGTGTTAACCATTTGT TTCATTTTAGCAGTATCTAAAATTACAACATATGGTGGATTAAGTAATGCTATGGGACAAGGCATATCTAAAACAGGCGC TGCCTTCCCATTATTGTCACCACTACTTGGTTGGATTGGTGTATTTATGACGGGATCCGTCGTAAACAATAATTCATTGT TTGCGCCAATTCAAGCCTCTGTTGCTGAACAAATTGGTACAAAAGGTTCATTACTTGTTGCAGCTAATGTCGCTGGTGGT GTAACTGCTAAGATTGTATCACCACAATCTATAGCTATCGCTACAGCAGCAGTTAATAAAGTAGGTAAAGAATCAGAACT GATGAAAATGGCAATGCGTTTCAGTATCGGATTGTTAATTCTCGTTTGTATTTGGACATTTATTTGTAGTTTATTTATTT CATAA Protein sequence : MLVESFNPFNNLLLSSIVAAIPIILFLLCLTVFKMKGVYAAITTLIVTIIVAMAFFKLPGSIAGGATLEGFYQGIIPIGF IVIMAVWLYKIATKSGQFAIVQDSIASVSRDQRVQLLLIGFVFNGFLEGAAGFGVPIAICAVLLTQLGFKPLQAAMYCLV SNAAAGAYGAVGIPIAIVDTLNLPGGVTTSQVALIGNLTLGFISFVVPFLLMYIMDGFKGVKETFPATLVVAVTFTVLQV LIAAFAGPELADIIPGLVAMIALALFSKKWQPKNIFRINKDEKADAVPKHSIGHITYAWSPFIILTIVVMIWSLPAFKGL FEKGGALSALVVNFNVPGTMNAVTNKPNELTFNFFAQTGTAILITAIITIIIAKNMSFKTAGHLLGLTVKELWISVLTIC FILAVSKITTYGGLSNAMGQGISKTGAAFPLLSPLLGWIGVFMTGSVVNNNSLFAPIQASVAEQIGTKGSLLVAANVAGG VTAKIVSPQSIAIATAAVNKVGKESELMKMAMRFSIGLLILVCIWTFICSLFIS |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 3e-79 | 42 |