Gene Information

Name : SSP0084 (SSP0084)
Accession : YP_300174.1
Strain : Staphylococcus saprophyticus ATCC 15305
Genome accession: NC_007350
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : L-lactate permease 2
Function : -
COG functional category : C : Energy production and conversion
COG ID : COG1620
EC number : -
Position : 100592 - 102196 bp
Length : 1605 bp
Strand : +
Note : similar to gi|27468863|ref|NP_765500.1| [Staphylococcus epidermidis ATCC 12228], percent identity 70 in 533 aa, BLASTP E(): 0.0

DNA sequence :
ATGTTAGTTGAAAGTTTTAACCCTTTTAATAATCTGCTACTTTCAAGTATTGTAGCCGCAATACCAATTATATTATTTTT
ATTATGTTTGACTGTATTTAAAATGAAAGGTGTTTATGCAGCAATTACAACGTTAATCGTTACAATTATTGTTGCTATGG
CTTTCTTTAAATTACCAGGAAGTATTGCAGGCGGCGCTACTTTAGAGGGCTTTTATCAAGGGATTATCCCAATAGGCTTT
ATTGTAATCATGGCAGTTTGGTTATATAAAATTGCTACAAAAAGCGGCCAATTTGCTATTGTTCAAGATAGTATCGCGAG
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AACAACATCTCAAGTAGCGTTAATTGGTAATTTAACGTTAGGCTTTATTAGTTTCGTTGTGCCATTTTTATTAATGTATA
TTATGGATGGCTTTAAAGGTGTGAAAGAAACTTTCCCAGCCACTTTAGTTGTGGCAGTTACTTTCACAGTTTTACAAGTG
CTTATTGCAGCTTTTGCTGGACCAGAGTTGGCTGATATTATCCCTGGCCTTGTAGCAATGATTGCATTAGCATTGTTCTC
AAAAAAATGGCAACCTAAAAATATTTTCAGAATTAATAAAGATGAAAAAGCAGATGCCGTGCCTAAACATTCTATTGGAC
ACATCACTTATGCATGGAGCCCGTTTATCATTTTAACGATTGTTGTGATGATCTGGAGCTTACCAGCATTTAAAGGTTTA
TTTGAAAAAGGTGGTGCCCTAAGTGCACTTGTTGTGAACTTTAATGTGCCGGGTACGATGAATGCTGTGACTAATAAACC
GAATGAACTGACATTCAATTTCTTTGCTCAAACAGGTACAGCGATTTTAATTACAGCGATCATTACAATTATTATTGCGA
AAAATATGAGCTTTAAAACGGCTGGTCATTTACTGGGTCTCACAGTTAAAGAATTATGGATTTCAGTGTTAACCATTTGT
TTCATTTTAGCAGTATCTAAAATTACAACATATGGTGGATTAAGTAATGCTATGGGACAAGGCATATCTAAAACAGGCGC
TGCCTTCCCATTATTGTCACCACTACTTGGTTGGATTGGTGTATTTATGACGGGATCCGTCGTAAACAATAATTCATTGT
TTGCGCCAATTCAAGCCTCTGTTGCTGAACAAATTGGTACAAAAGGTTCATTACTTGTTGCAGCTAATGTCGCTGGTGGT
GTAACTGCTAAGATTGTATCACCACAATCTATAGCTATCGCTACAGCAGCAGTTAATAAAGTAGGTAAAGAATCAGAACT
GATGAAAATGGCAATGCGTTTCAGTATCGGATTGTTAATTCTCGTTTGTATTTGGACATTTATTTGTAGTTTATTTATTT
CATAA

Protein sequence :
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IVIMAVWLYKIATKSGQFAIVQDSIASVSRDQRVQLLLIGFVFNGFLEGAAGFGVPIAICAVLLTQLGFKPLQAAMYCLV
SNAAAGAYGAVGIPIAIVDTLNLPGGVTTSQVALIGNLTLGFISFVVPFLLMYIMDGFKGVKETFPATLVVAVTFTVLQV
LIAAFAGPELADIIPGLVAMIALALFSKKWQPKNIFRINKDEKADAVPKHSIGHITYAWSPFIILTIVVMIWSLPAFKGL
FEKGGALSALVVNFNVPGTMNAVTNKPNELTFNFFAQTGTAILITAIITIIIAKNMSFKTAGHLLGLTVKELWISVLTIC
FILAVSKITTYGGLSNAMGQGISKTGAAFPLLSPLLGWIGVFMTGSVVNNNSLFAPIQASVAEQIGTKGSLLVAANVAGG
VTAKIVSPQSIAIATAAVNKVGKESELMKMAMRFSIGLLILVCIWTFICSLFIS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
glcA CAE85240.1 GlcA protein, putative glycolate permease Not tested PAI V 536 Protein 3e-79 42