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Name : SSP0066 (SSP0066) Accession : YP_300156.1 Strain : Staphylococcus saprophyticus ATCC 15305 Genome accession: NC_007350 Putative virulence/resistance : Unknown Product : capsular polysaccharide synthesis protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 76840 - 78051 bp Length : 1212 bp Strand : + Note : similar to gi|57285349|gb|AAW37443.1| [Staphylococcus aureus subsp. aureus COL], percent identity 29 in 404 aa, BLASTP E(): 5e-47 DNA sequence : ATGACAGGTAAAATTAAATCCAAAAATTACATTAAATTTTTACAAGATGTATTAATAAATGTTTTATCGAGTACTTTACT AGCAATGTCACTTCAATTAATAATATTTCCATTTCTTTCTAGTGGTATCAGTACTACAGAATTCGGGACTTTAATTGCAA TTTATGGAGTGAATAATCTTATAGTTAATTTTTTGGGAAATTCGTTAAATAATATTAGATTAATAAATAGACAAAGTGTA GAGGGATATAATTTAATTATATATATAATAAACACGCTTTCAGTTATTTTAGTACTAATAAGCATAAATATACTAAGTAT AAATATAGGTGCGATAAATTTAATTTTATTCTGTATATTTACATTTTTAGCTAACAATAGAAATTACTTTATGGTCAATT ATAGATTGAAGTTACAATATAATAAAATATTAAAATTAAACATTCTGATAATATTAGGTTATTTTCTGGGATTATTATTA TATATGCACACAGACTTGTGGAGTATTATATTTTTAAGTGGTGAAATTTTCGCTGTTATATATATGTTTATAACAAATGC ATTAATAATAAATGTATCAAAAGATGAGTTTAAATTTAATAAAGCAATAACTTTGGATTTTATAAAATTAAGTTTTTCCA ACTTTATTAATAATTTTTTGAATTACCTTGATAGATTCTTAATTATTCCTATTTTAGGAGCAGCAAGTATGGGGATTTAT TTTGCTGCTAGTGCAATCTCTAAAATAATAATTATGATCTTGACACCTATTAATAATGTATTGTTATCGCATATCACTAA CTTAGATATGAATATAAAGAGAAGGCGGTTAATTTTATTATATCTAATAACATTATTATTTATTTTTCCATTATATTTTA TAATAAATTCTTTTTCCAATTTTTTAGTAGATATACTTTATATAAATTTGGCAGATGAAGCAAAAAAGCTGATTCCCATT ATTACAATTGGTATTTTATTTAATATAGTAACAAATTTATTGAATAATTTTCTATTAAAAAAATATCCAATAACATATCA AACGATAATTCAATTTGTATATGGAACTGTATATTTAATGCTAGCAATATTATTAAGTACCAATTTTGGATTAAAAGGAT TTGCTTATAGTTTGGTAATAGCCAATATAACAAAATATTTGATGCATGTTCTAATTGTTTTATTTGTAAAACAAAATAAG GAGAAAAATTAA Protein sequence : MTGKIKSKNYIKFLQDVLINVLSSTLLAMSLQLIIFPFLSSGISTTEFGTLIAIYGVNNLIVNFLGNSLNNIRLINRQSV EGYNLIIYIINTLSVILVLISINILSINIGAINLILFCIFTFLANNRNYFMVNYRLKLQYNKILKLNILIILGYFLGLLL YMHTDLWSIIFLSGEIFAVIYMFITNALIINVSKDEFKFNKAITLDFIKLSFSNFINNFLNYLDRFLIIPILGAASMGIY FAASAISKIIIMILTPINNVLLSHITNLDMNIKRRRLILLYLITLLFIFPLYFIINSFSNFLVDILYINLADEAKKLIPI ITIGILFNIVTNLLNNFLLKKYPITYQTIIQFVYGTVYLMLAILLSTNFGLKGFAYSLVIANITKYLMHVLIVLFVKQNK EKN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SSP0066 | YP_300156.1 | capsular polysaccharide synthesis protein | Not tested | SCC15305cap | Protein | 9e-123 | 100 |
