|
Name : SSP0052 (SSP0052) Accession : YP_300142.1 Strain : Staphylococcus saprophyticus ATCC 15305 Genome accession: NC_007350 Putative virulence/resistance : Unknown Product : restriction endonuclease S subunit Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG0732 EC number : - Position : 60680 - 61915 bp Length : 1236 bp Strand : - Note : similar to gi|7658152|gb|AAF66082.1| [Lactococcus lactis subsp. cremoris], percent identity 35 in 438 aa, BLASTP E(): 2e-60 DNA sequence : ATGACTAATGAAGTAAAGAATGTGCCTAAGTTAAGATTTCAAAGGTTTGAAGATGAGTGGAAAAAGAAGCGATTAAAAGA TATCGTTGAACCTTTGAAAGGTAATTCTGGCGAAAATAAAAATTTACCAGTTTTAACTATATCTGCTAAAAAGGGGTGGT TAAACCAAAAAGAGCGATTTTCTCAAGTTATAGCCGGTAATAGTTTAAGTAAATATAATGAGTTGAAAAAAGGTGATTTA TCCTATAATAAAGGAAATTCAAAGGTAGCTTTGTATGGTATTGTTTATAAATTAGGCTTTGATAATGCACTAGTACCTAA TGTTTATAAAAGTTTCAGACCAAAACCTAATAATGTATCTGATTTTTTAGAGAAGTATTTTCATACTAAAATTTTAGATA GACAATTAAGAAGAGTTATTACTTCCACTGCTAGAATGGATGGCTTATTAAATATAAGTGATTATGATTTCTATAATATG AGTTTAAATATTCCAGTTAATAATGAACAAAAAAAAATAGGTGACTTCTTCAGCAAACTCGACCAACAAATTGAACTTGA AGAAAAAAAACTGGCTAAATTAGAAGAACAAAAAAAGGGATATATGCAAAAGATTTTTTCACAAGAATTAAGATTTAAAG ATGAGAATGGTAATGATTATCCAGAATGGGAAGAAATCAATTTGGGGAGCCTTTATAAAAAGGGAAAAGCTGGGGGTACA CCTAAGTCAACAGAAAGTAAGTATTATAATGGTAAAGTTCCTTTTTTATCAATCAGTGATATAACTAAACAAGGTAAATT TTTAAATACCACTGAAAAAAAAATAACCCAAGAAGGTCTTGATAATAGTACAGCTTGGTTAGTCCCAGTTAATTCTATAA ACTATGCTATGTATGCTTCAGTAGGATATTTAAGTATTAATAAAATTGAAGTTGCCACAAGTCAAGCTATTTTTAATATG GTGTTTGAGGATTATAATTTAGTTGAATATTTATATTACTATTTGAATTATATTAGAGATAAGGGAGTACTTGAAAAATT AATGGGAACAGGTACTCAAAGTAATTTATCTGCTTCAATTATGAAAAATATAACTGTAAAAGTACCAAGTAAAAACGAAA TTATAAAAACAAGTAAGTTTTTAGGTAATGTTGATGAATTAATTGAAACTCAATCCAGTAAAGTTGAATTATTAAAAGAA CGTAAAGAAGGATTATTACAGAAAATGTTTGTGTAG Protein sequence : MTNEVKNVPKLRFQRFEDEWKKKRLKDIVEPLKGNSGENKNLPVLTISAKKGWLNQKERFSQVIAGNSLSKYNELKKGDL SYNKGNSKVALYGIVYKLGFDNALVPNVYKSFRPKPNNVSDFLEKYFHTKILDRQLRRVITSTARMDGLLNISDYDFYNM SLNIPVNNEQKKIGDFFSKLDQQIELEEKKLAKLEEQKKGYMQKIFSQELRFKDENGNDYPEWEEINLGSLYKKGKAGGT PKSTESKYYNGKVPFLSISDITKQGKFLNTTEKKITQEGLDNSTAWLVPVNSINYAMYASVGYLSINKIEVATSQAIFNM VFEDYNLVEYLYYYLNYIRDKGVLEKLMGTGTQSNLSASIMKNITVKVPSKNEIIKTSKFLGNVDELIETQSSKVELLKE RKEGLLQKMFV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SSP0052 | YP_300142.1 | restriction endonuclease S subunit | Not tested | SCC15305cap | Protein | 3e-167 | 100 |
