Name : SSP0537 (SSP0537) Accession : YP_300627.1 Strain : Staphylococcus saprophyticus ATCC 15305 Genome accession: NC_007350 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 569701 - 571302 bp Length : 1602 bp Strand : + Note : similar to gi|15925356|ref|NP_372890.1| [Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50], percent identity 74 in 531 aa, BLASTP E(): 0.0 DNA sequence : ATGTTTGTAGATACGTTTAACCCCTTTGATAACGTCCTGTTATCATCAATTGTTGCAGCAGTGCCGATTGTTTTATTTCT TTTATGTTTAACTATTTTTAAAATGAAAGGCATTTATGCATCAATCACAACTGTTGTTGTTACAGTTATTATTGCTATCG TCTTCTTTAAACTACCTGTAAATATTGCATCAGGTGCTGTTGTAGAAGGATTTTTCCAAGGGATTATACCCATTGGTTAT ATCGTTGTAATGGCAGTTTTACTTTATAAGATTACGAATGAAACTGGTCAATTCGATACGATTCAAGATAGTATATCGAG CATTTCTCAGGACCAACGTATTCAATTGCTATTAATTGGATTCGCATTTAATGGATTTTTAGAAGGTGCTGCTGGATTTG GTGTACCTATCGCTATTTGTGCTTTATTACTTACACAATTAGGATTTGCGCCATTGCAAGCTGCCATGTTGTGTTTGATT GCAAACGCTTCAGCAGGTGCTTTTGGTGCCATTGGTTTACCAGTTACAGTTATAGACACATTAGGTTTACACGATAGTGT GACAGGTATGGCAGTTTCTTCTATGTCTGCTTTAACACTTGTGCTTATGAATATGCTTATTCCATTTTTATTAATATGGA TTATAGACGGATTTAAAGGTATTAAAGAAACACTACCAGCGATACTTGTAGTTGCGATTACTTTCACTGTTTTACAAGCA ATCATTACGGTGTTTATAGGCCCAGAATTAGCAGATATCATACCACCATTAGGTGCAATGATGGCACTTGCAATATTTTC TAAAAAATTCCAGCCAAAACATATCTTTAGAATTAATAAAGATGAAGAACCTCCAAAAATCAGCAAACATCAACCTAAAG AGATTATTTATGCATGGAGTCCGTTCGTCATTTTAACAGTAGTTGTAATGATTTGGAGTGCATCTTTCTTTAAAGCGTTG TTTGTTCCAGGTGGTGCGCTAGAATCATTCGTGTTCAACATTGCACTACCAGGTACATATAGTGAAATCGCTAATAAGGC GATCACATTACCGTTAAACATCATAGGTCAAACAGGAACAGCTATTTTAATCGTTATTGTTATTACAATTTTGATGTCCA ATAAAGTACATTTTAAAGATGGTGTGCGTTTATTCAAGAACGCATTTAAAGAGTTATGGTTACCAATCATTACGATTTGT TTTATTTTAGTTATTTCTAAATTAATGACTTATGCAGGTTTGAGTAATGCAGTAGGTGAGGGAATTGCGAAAACAGGTAG TATTTTCCCATTATTATCACCAATTTTAGGTTGGATTGGTGTATTCTTAACTGGTTCAGTTACGAATAACAATACTTTAT TTGCGCCAATTCAAGCCGCGGTAGCAAGCAATATTGGTGCAAGTGGTGCGTTACTTGTTTCTGCAAATACCGTGGGTGGT GTTGCAGCAAAATTAATTTCACCTCAATCAATCGCTATTGCAACAGCCTCTGTACAACAAGTAGGTAAAGAATCAGAATT ACTTAAAATGACACTTCGTTATAGTGTGGCTTTACTGGTTTTCGTATGTATTTGGACTTTCTTATTAAATATATTTATAT AG Protein sequence : MFVDTFNPFDNVLLSSIVAAVPIVLFLLCLTIFKMKGIYASITTVVVTVIIAIVFFKLPVNIASGAVVEGFFQGIIPIGY IVVMAVLLYKITNETGQFDTIQDSISSISQDQRIQLLLIGFAFNGFLEGAAGFGVPIAICALLLTQLGFAPLQAAMLCLI ANASAGAFGAIGLPVTVIDTLGLHDSVTGMAVSSMSALTLVLMNMLIPFLLIWIIDGFKGIKETLPAILVVAITFTVLQA IITVFIGPELADIIPPLGAMMALAIFSKKFQPKHIFRINKDEEPPKISKHQPKEIIYAWSPFVILTVVVMIWSASFFKAL FVPGGALESFVFNIALPGTYSEIANKAITLPLNIIGQTGTAILIVIVITILMSNKVHFKDGVRLFKNAFKELWLPIITIC FILVISKLMTYAGLSNAVGEGIAKTGSIFPLLSPILGWIGVFLTGSVTNNNTLFAPIQAAVASNIGASGALLVSANTVGG VAAKLISPQSIAIATASVQQVGKESELLKMTLRYSVALLVFVCIWTFLLNIFI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 3e-71 | 41 |