Gene Information

Name : SSP0532 (SSP0532)
Accession : YP_300622.1
Strain : Staphylococcus saprophyticus ATCC 15305
Genome accession: NC_007350
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : major facilitator superfamily permease
Function : -
COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism
COG ID : COG2814
EC number : -
Position : 563171 - 564535 bp
Length : 1365 bp
Strand : -
Note : similar to gi|27467165|ref|NP_763802.1| [Staphylococcus epidermidis ATCC 12228], percent identity 74 in 443 aa, BLASTP E(): 0.0

DNA sequence :
ATGGGAATTAAAGTAGATAAAAAACTCATCTTTTTCCTTGGTGCATTGGGAGGTTTACTCTATGGTTACGACATGGGAGT
AATATCGGGTGCTCTATTATTTATAAAAGATGATATACCATTGAATAGTGTTACAGAAGGATTGGTTGTTGCATCTATGC
TTGTCGGTGCCATCTTTGGTTCTGGTGCAAGTGGGCCATTATCTGACAGACTTGGCCGTAGACGTGTGGTATTTGTGATA
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AAGAAATCGCAGATATGAAAGAAATTAATAGTATCTCTGAAAGTACATGGAATGTTTTAAAATCACCATGGTTACGTCCA
ACACTGATTATTGGTTGTATATTTGCTTTGCTACAACAGATTATCGGTATTAACGCCATTATATATTATGCACCTTCTAT
CTTTAGTAAAGCAGGATTAGGCGATGCTACTTCTATTTTAGGTACTGTTGGTATTGGTACTGTGAACGTTATCATTACGA
TTGTTGCAATTATGATTATTGATAAAATTGATCGTAAACGCTTATTAGTCATTGGTAATATTGGCATGGTTGCTTCATTA
CTTATTATGGCCGTATTAATTTGGACAATTGGTATTCAATCTTCTGCTTGGATTATCGTGGCTTGTTTAACGTTATTCAT
TATATTCTTTGGTTTTACTTGGGGACCTGTATTATGGGTAATGTTACCAGAGTTATTCCCTATGCGTGCACGTGGTGCCG
CAACGGGTGCCGCAGCATTAGTATTGTCAATCGGAAGTTTATTAGTTGCTCAATTCTTCCCAATATTGACTGAAGTCTTA
CCTGTAGAACAAGTATTTTTAATTTTTGCAGTGATCGGGATTTGTGCACTAATATTTGTCATCAAATACTTACCTGAAAC
ACGTGGTCGTAGTTTAGAAGAAATTGAAGCTGATTTACGTTCTAGAACAAATGCCACAGATGCAAATATTCATGAATCAA
AATAA

Protein sequence :
MGIKVDKKLIFFLGALGGLLYGYDMGVISGALLFIKDDIPLNSVTEGLVVASMLVGAIFGSGASGPLSDRLGRRRVVFVI
AIVYIVGALILALAPSMPVLVIGRLVIGLAVGGSTAIVPVYLSEMAPTEQRGSLSSLNQLMITIGILSSYLINYAFTPIE
GWRWMLGLAVVPSLILLIGVAFMPESPRWLLEHRSEKAARDVMKLTFKDSEIDKEIADMKEINSISESTWNVLKSPWLRP
TLIIGCIFALLQQIIGINAIIYYAPSIFSKAGLGDATSILGTVGIGTVNVIITIVAIMIIDKIDRKRLLVIGNIGMVASL
LIMAVLIWTIGIQSSAWIIVACLTLFIIFFGFTWGPVLWVMLPELFPMRARGAATGAAALVLSIGSLLVAQFFPILTEVL
PVEQVFLIFAVIGICALIFVIKYLPETRGRSLEEIEADLRSRTNATDANIHESK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SH0071 YP_251986.1 hypothetical protein Not tested SCCmec Protein 3e-125 70