Name : SSP0532 (SSP0532) Accession : YP_300622.1 Strain : Staphylococcus saprophyticus ATCC 15305 Genome accession: NC_007350 Putative virulence/resistance : Unknown Product : major facilitator superfamily permease Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG2814 EC number : - Position : 563171 - 564535 bp Length : 1365 bp Strand : - Note : similar to gi|27467165|ref|NP_763802.1| [Staphylococcus epidermidis ATCC 12228], percent identity 74 in 443 aa, BLASTP E(): 0.0 DNA sequence : ATGGGAATTAAAGTAGATAAAAAACTCATCTTTTTCCTTGGTGCATTGGGAGGTTTACTCTATGGTTACGACATGGGAGT AATATCGGGTGCTCTATTATTTATAAAAGATGATATACCATTGAATAGTGTTACAGAAGGATTGGTTGTTGCATCTATGC TTGTCGGTGCCATCTTTGGTTCTGGTGCAAGTGGGCCATTATCTGACAGACTTGGCCGTAGACGTGTGGTATTTGTGATA GCTATTGTTTATATTGTTGGTGCACTTATCTTAGCATTAGCACCTTCAATGCCCGTATTAGTTATAGGTCGTTTAGTTAT CGGATTGGCTGTTGGTGGCTCTACTGCCATTGTTCCAGTTTATTTATCTGAAATGGCACCTACGGAACAACGTGGTTCTT TAAGTTCTTTAAACCAATTAATGATTACGATTGGTATCTTATCTTCATATTTAATCAACTATGCTTTCACACCTATCGAA GGTTGGAGATGGATGTTAGGTCTTGCAGTTGTACCGTCACTTATTTTATTAATTGGTGTCGCATTTATGCCTGAAAGTCC TAGATGGTTACTTGAACATAGAAGTGAAAAAGCAGCACGTGATGTTATGAAATTAACATTTAAAGACAGCGAAATCGATA AAGAAATCGCAGATATGAAAGAAATTAATAGTATCTCTGAAAGTACATGGAATGTTTTAAAATCACCATGGTTACGTCCA ACACTGATTATTGGTTGTATATTTGCTTTGCTACAACAGATTATCGGTATTAACGCCATTATATATTATGCACCTTCTAT CTTTAGTAAAGCAGGATTAGGCGATGCTACTTCTATTTTAGGTACTGTTGGTATTGGTACTGTGAACGTTATCATTACGA TTGTTGCAATTATGATTATTGATAAAATTGATCGTAAACGCTTATTAGTCATTGGTAATATTGGCATGGTTGCTTCATTA CTTATTATGGCCGTATTAATTTGGACAATTGGTATTCAATCTTCTGCTTGGATTATCGTGGCTTGTTTAACGTTATTCAT TATATTCTTTGGTTTTACTTGGGGACCTGTATTATGGGTAATGTTACCAGAGTTATTCCCTATGCGTGCACGTGGTGCCG CAACGGGTGCCGCAGCATTAGTATTGTCAATCGGAAGTTTATTAGTTGCTCAATTCTTCCCAATATTGACTGAAGTCTTA CCTGTAGAACAAGTATTTTTAATTTTTGCAGTGATCGGGATTTGTGCACTAATATTTGTCATCAAATACTTACCTGAAAC ACGTGGTCGTAGTTTAGAAGAAATTGAAGCTGATTTACGTTCTAGAACAAATGCCACAGATGCAAATATTCATGAATCAA AATAA Protein sequence : MGIKVDKKLIFFLGALGGLLYGYDMGVISGALLFIKDDIPLNSVTEGLVVASMLVGAIFGSGASGPLSDRLGRRRVVFVI AIVYIVGALILALAPSMPVLVIGRLVIGLAVGGSTAIVPVYLSEMAPTEQRGSLSSLNQLMITIGILSSYLINYAFTPIE GWRWMLGLAVVPSLILLIGVAFMPESPRWLLEHRSEKAARDVMKLTFKDSEIDKEIADMKEINSISESTWNVLKSPWLRP TLIIGCIFALLQQIIGINAIIYYAPSIFSKAGLGDATSILGTVGIGTVNVIITIVAIMIIDKIDRKRLLVIGNIGMVASL LIMAVLIWTIGIQSSAWIIVACLTLFIIFFGFTWGPVLWVMLPELFPMRARGAATGAAALVLSIGSLLVAQFFPILTEVL PVEQVFLIFAVIGICALIFVIKYLPETRGRSLEEIEADLRSRTNATDANIHESK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
SH0071 | YP_251986.1 | hypothetical protein | Not tested | SCCmec | Protein | 3e-125 | 70 |