|
Name : SSP0041 (SSP0041) Accession : YP_300131.1 Strain : Staphylococcus saprophyticus ATCC 15305 Genome accession: NC_007350 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 50166 - 51905 bp Length : 1740 bp Strand : + Note : similar to gi|16802510|ref|NP_463995.1| [Listeria monocytogenes EGD-e], percent identity 22 in 599 aa, BLASTP E(): 6e-22 DNA sequence : ATGGAAATGAATAGTTATATGATAGAGAACTTTGCTACTGATGCTGTTAAAAATTATTGCCTTCATACTTCTAAAATTAA AAGCTATATTGCTAATGAAGATAAGGAACCAGGTTATGATGGACATCTAAAAATTTATGATTCAATCAGTCAGACTAAAG ATGATTATTTAGGTAATATACCTGTTCAAATAAAAGGGAAGAAAGCAAAAAAGAAGCACCCTAGTTTATTTAAACAAAAT AAAGTTAATAAGAGAGATTTGGAAATGTATTTAAAAGATGGAGGATGCTACTATTTTGTAGTTTTAATTAATGAAAATGG TGAGAGTCAAGTTTATGGTCGTCAATTACTTCCTATGTATCTAAAATATAAACTAAAATCGAAATCAAAATCAGTGACAA TTGAAATGTATGAAATTACTTCTTATAAAGATTTTTATGATAATTGTATTCAATATTTAAAACAAAGCAAGAAGCAAGCT AACCCTATTGAGTTTTCTATTAATAAAAAAAGAAATCAAAAAATGACAATTACATCACCCGAAAATATAGTGACAGATAA AAATGGATTTCCTTTAAATGACTTTTATAGTTTTATCCATATTAATGATTCAGATATTAAAGTTACAGTACCGGATGAGA TATTACGGCCAGAGAAATTTTCTAAATTACAAAAAGGAAGTATTTATTCAGAGGGAAAAGTGATATATGAAGGTAATATA AGATTTGATGTTACGTCAACATATACATCAATAATTATAGATGAAAGCTTCTATTTGACTAAATACAATGAAAGTAAAAA GGCAAAATACTCTTTATTACCAATAAAAAATATTGACAGATATTTAGAGGTTTTAAATTTAGTCAAGTCACTTAGTAATG GAGGAGAATTTATATTTGAAGATGTTCAAGTTATATTAGATAAGTTTAAATTAGATAAAAGTATTGATAGGCTCACAAGT ATATTAACACAATTTAAGCAAGTAACAGTGGAAACTGATAATCTAATTAAAAAAAGCACAATCATTAATGATGATAATAT TGAAAAACAACTCGGGGAAATGGTTGGAATTATAAAAATTATTAAAAACAAAGAATTCAATGCATATAATATGAAAAAAG ATAAATTCTACAAAATTTTATTTGGTAATAACAATTTTATTTTATGGAAATATAATAATGTAATATATAATGTCTTCTCT GATAATTTTCTTAAACGAGTAGAATTAGTCGTTGATAATGAAACAATGTTAGCAATTTATTCTTTTAATACGAGTTTTAT GATTAATACAATAAATTTTGATTTTCAATTAATTGAGAAATATTTAAAAACTGAAGATTTTTCAAATATTTCAATTCAAA AATGGAATTATATCAATAATTTTTGTTTAGAGTTAATAAAATCATATGATATAACGAAAGAACTAGGTTTTTTAAATATT GCAGAATTTATATTAAGTAATATTGATATAAAAGATATTGATAGCACATTTATAACAAAGATAAACTTAGCACAAGTAAA AATAAGAAAAGACGAAAGGTTAGAAAGTGATCTTAAAAAATTGCTTGTAGAGTTAAAGTCAAAATTAAAATCAATAAACA GTGATGACGCTTCACTACATTTAAGTATAATATTTGGCAGTAAAACAGAAGCAATGATATATTTTGAAAATCTAAGTGAA GAAGAACTAGGAGTTTTTAAAAACTATCCAATTTATTATCTGTATCAAAAATTATTATAA Protein sequence : MEMNSYMIENFATDAVKNYCLHTSKIKSYIANEDKEPGYDGHLKIYDSISQTKDDYLGNIPVQIKGKKAKKKHPSLFKQN KVNKRDLEMYLKDGGCYYFVVLINENGESQVYGRQLLPMYLKYKLKSKSKSVTIEMYEITSYKDFYDNCIQYLKQSKKQA NPIEFSINKKRNQKMTITSPENIVTDKNGFPLNDFYSFIHINDSDIKVTVPDEILRPEKFSKLQKGSIYSEGKVIYEGNI RFDVTSTYTSIIIDESFYLTKYNESKKAKYSLLPIKNIDRYLEVLNLVKSLSNGGEFIFEDVQVILDKFKLDKSIDRLTS ILTQFKQVTVETDNLIKKSTIINDDNIEKQLGEMVGIIKIIKNKEFNAYNMKKDKFYKILFGNNNFILWKYNNVIYNVFS DNFLKRVELVVDNETMLAIYSFNTSFMINTINFDFQLIEKYLKTEDFSNISIQKWNYINNFCLELIKSYDITKELGFLNI AEFILSNIDIKDIDSTFITKINLAQVKIRKDERLESDLKKLLVELKSKLKSINSDDASLHLSIIFGSKTEAMIYFENLSE EELGVFKNYPIYYLYQKLL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SSP0041 | YP_300131.1 | hypothetical protein | Not tested | SCC15305cap | Protein | 0.0 | 100 |
