Gene Information

Name : SSP2288 (SSP2288)
Accession : YP_302378.1
Strain : Staphylococcus saprophyticus ATCC 15305
Genome accession: NC_007350
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ammonium transporter
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0004
EC number : -
Position : 2373078 - 2374322 bp
Length : 1245 bp
Strand : -
Note : similar to gi|27468562|ref|NP_765199.1| [Staphylococcus epidermidis ATCC 12228], percent identity 71 in 412 aa, BLASTP E(): e-174

DNA sequence :
ATGAATATGAATGATACATTATTTTTGTTTCTTTGTACGTTACTAGTGTGGTTAATGACACCGGGGTTAAGTTTGTTTTA
TGGGGGATTGGTTCAATCTAAAAACGTATTGAATACAGTCATGCAAAGTATGTCGGCAATTGTTATAGTAACGTTTGCAT
GGATGTTATTTGGATTTAGCTTTAGTTTTGGATCTGGGAATTCATTTTTTGGAGATTTTACATATATAGGTTTAGCTCAT
GTTGGTTTTAGTACACAATCAGCAATTTCACCGCATATACCTTTAGCGCTGTTTATGCTATTTCAGTTGATGTTCTGTAC
CATTGCAGTTTCAATTTTATCAGGATCAATAGCTGAAAAAATGAAGTTTATACCTTATTTAATTTTTGTGTTTTTATGGG
TTATCTGTGTATACAGTCCTGTTGCACATTGGGTATGGGGTGGAGGTTGGATTGATCAATTAGGTGCGATTGATTATGCA
GGTGGAACAGTTGTGCATATAACGTCTGGTATATCTGGTTTGGTCTTAGCAATTATGATTGGTGCAGGGAAAAACTTTGA
TAAAAGACCGCCACATAACCTTATTATTACACTTATTGGCGCAATTTTCGTTTGGATTGGGTGGTATGGATTTAATGTAG
GGAGCGCATTGTCGTTTAATAAAATAGCGATGATTTCATTTGTGAATACGGTGCTCGCAGCGAGTGCAGGTGCCTTAGGT
TGGTCAATGATAGAGTATTGCATGAAGAAAACGACGAGTTTGATAGGTATGTTGTCGGGCATGCTTGCAGGATTAGTTGC
TATTACACCAGCTGCCGGTTTCGTAGGATATATGAGTGCTGTGGTGATTGCGCTTATAGGCGGTGTGTGTTGTTACTTCG
TCATTAATTACATTAAAGGGAAATTACATTATAATGATGCCTTAGATGCATTTGGCATACACGGTGTAGGGGGGGTGGTC
GGTGCACTTTTAACTGGTGTATTTCAGTCACATCATATTAATGGCGATGTGGTAAATGGGCTTTTATTAGGCGGAGGTAT
GATGCCCGTAATCAATCAGTTGATAGCTGTAGCTATTACCATTGTATTTAGTGGGATCATGACTTTTATTATTGCGAAAG
TGATTGCCCAATTTAGTGAACTAGGGACAGATACAGAAGAAGAGGCACAAGGCTTGGATTATGTTGTACATGGGGAGCGC
GCTTATTTTAGTGGCGAATTAAATAAATTAAATAGACGTAAATAA

Protein sequence :
MNMNDTLFLFLCTLLVWLMTPGLSLFYGGLVQSKNVLNTVMQSMSAIVIVTFAWMLFGFSFSFGSGNSFFGDFTYIGLAH
VGFSTQSAISPHIPLALFMLFQLMFCTIAVSILSGSIAEKMKFIPYLIFVFLWVICVYSPVAHWVWGGGWIDQLGAIDYA
GGTVVHITSGISGLVLAIMIGAGKNFDKRPPHNLIITLIGAIFVWIGWYGFNVGSALSFNKIAMISFVNTVLAASAGALG
WSMIEYCMKKTTSLIGMLSGMLAGLVAITPAAGFVGYMSAVVIALIGGVCCYFVINYIKGKLHYNDALDAFGIHGVGGVV
GALLTGVFQSHHINGDVVNGLLLGGGMMPVINQLIAVAITIVFSGIMTFIIAKVIAQFSELGTDTEEEAQGLDYVVHGER
AYFSGELNKLNRRK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00287 YP_008207752.1 Ammonia permease Not tested AbaR25 Protein 3e-62 48
BJAB0868_00291 YP_008211617.1 Ammonia permease Not tested AbaR26 Protein 3e-62 48