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Name : SSP1603 (SSP1603) Accession : YP_301693.1 Strain : Staphylococcus saprophyticus ATCC 15305 Genome accession: NC_007350 Putative virulence/resistance : Resistance Product : cadmium resistance protein Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG2217 EC number : - Position : 1673688 - 1676219 bp Length : 2532 bp Strand : - Note : similar to gi|27466993|ref|NP_763630.1| [Staphylococcus epidermidis ATCC 12228], percent identity 42 in 791 aa, BLASTP E(): 0.0 DNA sequence : ATGAGTACTAATTGCTGTAATAATAAAGCTGAATCTAATACTTGTTGTACAAGTAACTCAGTTAACGAAAATAAGTGTTG TAGTAATGAGCCTAAGGTAGCAAATCAAAATGACGAATGCTGTACAAATAACGGTGAAAGCATCGATTCAACTCATAACA TTTCATGTAATGCTATGAGTAATAGTTCTGAAGAAGACGATGAAGTAGCCACCCCATTTTCAAATTATAATTTTAAAGTA ACAGGTATGGATTGTAGTTCATGTGCAATAACCATTGAAAAAGCGTTAAGACCTTTAGACGATGTAACTAATCCTAAAGT TAATTTTTCTACAAGTAAATTAAGCGTTGGACTAAAATCTCAAAGTAGTATTAATCAAGTGACTCAAACACTAAAAAAAT TGGGTTATGGTATCGAAGAAAATGATAGCAATCAAAACTATACAATATTTTCAATAGAAGGTATGGATTGTGGTAGTTGT GCTAAAAGTATTGAAAAACATTTGAACAATTTACCCTATGTAAATGACACACAAGTTAGTTTTTCAACTGGAAAAATGCA GATTGATTTTGAAGGCAATCAAACTAAAAATATTGAAAAAGAAGTTTCTAAAATCGGTTATTCTGCTACATTACAATCCA GTAATAAAAATAATAATACAAAGTGGCGTTTGTTTAGTAAGCCTATTATATCAACACTATTTCTTATCCTTGGTATTGTT TCATCTATGGTATCACTACCCATTTGGATAACTAATTTGATGTATATCATAGCTATTGTAGTCAGTGGTATAAAACCCTT AAAAAGTGCCTATTATGCTATTAAATCTAAGAGTTTAGATATGAATGTTTTAATGTCTGTAGCTGTTATTGGTGCCATAT TAATTGGTGAGTTTTTTGAAGGCGCAATCGTCGTTTTACTATTTACTATTGGCACTTTATTACAAACTATTTCTATAGAT AAAACAAGAAATTCTATTCAATCGTTAATGGATATTACACCAGCAGAAGCAAACGTTGTAACAGAGACGGGGATAATTTC AAAAAACTTAAAAGATATTAGTATTGGAGAAATTTTACTTGTAAAACCAGGCGATCGAGTACCACTAGATGGTACGATTA TAGAAGGATATTCAAGTTTAAATCAGGCACCTATAACTGGTGAATCTATTCCTGTAGACAAAACGATAAATGAAGAAGCT TATGCAGGTTCTATTAATGAAAACGGGACTTTAAAAATACGTGTTTCAAGATTAGTTAAAGATACCACACTGTCTAAAAT CATTCATATGGTTGAAGAAGCACAAGAAAACAAAGCACCTACACAAGCTTTTATCGACCGGTTTTCTGAAATTTATACAC CCATTGTATTCATATTAGCATTATTAGTAATGGTAATCCCTCCTATTTTTTCTTTAGGAACATGGGGAGAATGGTTTTAT AAAGGACTTGAACTACTTGTCATAGCATGTCCGTGTGCACTAGTTATTTCGACTCCTGTAGCTATTGTCACTGGGATTGG TAGCGCAGCAAAAAAAGGTGTACTTATCAAAGGTGGCAACCATTTGGAAGCTTTAGGTACACTTTCAGCTTTAGCTTTTG ATAAAACTGGAACGCTGACTGAAGGACGCCCAAAAGTTTCAGAAATTAAAACAATCGAATCTGACAAAGAAATGTTTTTG AATATTGCGCTAAGTTTAGAATCATACTCAACGCATCCAATTAGCAATGCAATTGTTGATTATGTCTCACAATTTAAATC TATAACATACGATGTTACTGATTTTGAAAATATTGTTGGACGAGGTATTAAAGGTAAAATTGACCATAATAATATTTATG CAGGAAACATAAAGTTAATCGAATCTATAAATGAAAATATTGTAAATTATAAAGAAGAAATATATTCATATGAGCAACAA GGATATACAGTTATTATTATTGCAACAGCAGATAAAATCCATGGTTTTATTACTGTTGAAGACCCATTAAGGTCGGATAT TAAGCAAACATTACAACAATTAAATGGAAGTAATATTAAAAATACTATAATGCTTACAGGTGATAATAAAGGAACTGCAC ATAAAATAGCGCAACTTTCAGGTATCAAAGAGGTTTATGCTGAGTTAATGCCTGAAGATAAATTATCAGCTATCAAAGAT TTACAAAGCAAAGGCTATCGTGTAGGAATGATTGGTGATGGTATCAATGATGCCCCTGCTTTAGCACAAAGCGAAGTTGG TATTGCAATGGGCGGTATTGGTTCAGATACTGCAATGGAAACAGCAGATGTTGTATTAATGTCAGATAATGTACATCAAC TAACAGACACTATCACTATTAGTAACAAAGCTAAGAATATAATTAAACAAAATATATATTTCTCTATTATTATTAAAATG ATTGCTTTTATCTTAGTATTCCCTGGGTTACTAACACTTTGGTTAGCCGTATTCAGCGACACTGGCGCAGCGATATTAGT TATACTAAATTCATTGCGCTTATTAAGAACTAAGAAAAACAATTTATTATAA Protein sequence : MSTNCCNNKAESNTCCTSNSVNENKCCSNEPKVANQNDECCTNNGESIDSTHNISCNAMSNSSEEDDEVATPFSNYNFKV TGMDCSSCAITIEKALRPLDDVTNPKVNFSTSKLSVGLKSQSSINQVTQTLKKLGYGIEENDSNQNYTIFSIEGMDCGSC AKSIEKHLNNLPYVNDTQVSFSTGKMQIDFEGNQTKNIEKEVSKIGYSATLQSSNKNNNTKWRLFSKPIISTLFLILGIV SSMVSLPIWITNLMYIIAIVVSGIKPLKSAYYAIKSKSLDMNVLMSVAVIGAILIGEFFEGAIVVLLFTIGTLLQTISID KTRNSIQSLMDITPAEANVVTETGIISKNLKDISIGEILLVKPGDRVPLDGTIIEGYSSLNQAPITGESIPVDKTINEEA YAGSINENGTLKIRVSRLVKDTTLSKIIHMVEEAQENKAPTQAFIDRFSEIYTPIVFILALLVMVIPPIFSLGTWGEWFY KGLELLVIACPCALVISTPVAIVTGIGSAAKKGVLIKGGNHLEALGTLSALAFDKTGTLTEGRPKVSEIKTIESDKEMFL NIALSLESYSTHPISNAIVDYVSQFKSITYDVTDFENIVGRGIKGKIDHNNIYAGNIKLIESINENIVNYKEEIYSYEQQ GYTVIIIATADKIHGFITVEDPLRSDIKQTLQQLNGSNIKNTIMLTGDNKGTAHKIAQLSGIKEVYAELMPEDKLSAIKD LQSKGYRVGMIGDGINDAPALAQSEVGIAMGGIGSDTAMETADVVLMSDNVHQLTDTITISNKAKNIIKQNIYFSIIIKM IAFILVFPGLLTLWLAVFSDTGAAILVILNSLRLLRTKKNNLL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SE0075 | NP_763630.1 | cadmium resistance protein B | Not tested | SCCpbp4 | Protein | 8e-148 | 42 |
| cadA | BAC57487.1 | Probable cadmium-transporting ATPase (Cadmium efflux ATPase) | Not tested | Type-IIIinv SCCmec | Protein | 3e-147 | 42 |
| unnamed | BAB47609.1 | cadmium resistance protein B | Not tested | Type-III SCCmec | Protein | 3e-147 | 42 |
