Name : nrdE (MHP7448_0221) Accession : YP_287618.1 Strain : Mycoplasma hyopneumoniae 7448 Genome accession: NC_007332 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0209 EC number : 1.17.4.1 Position : 260738 - 262879 bp Length : 2142 bp Strand : - Note : Catalyzes the rate-limiting step in dNTP synthesis DNA sequence : CTGAATTTTGATAAAAATCAGGAAAAAAGTTATCTTAGCTTAAATGCAAATAGCAAAATTTTTGCAAATCATCCTGATTC ACATAAATTTGATTTATTAGCAGCAGAGAAATATATTAATGAAGAAATTAATCCAAAATTTAAATTTTTCAATTCTTTTA AAGAAAGAATTGAATTTTTAGTTCAAAATAATTATTATGATCCGAAAGTTTTAGGACAATATTCATTCCAAGAACTTGAG AAACTAAATACAAAAGCTTGAAGTTATAATCATTTTTTTTCTTCTTTTATGGGGGCTTTTAAATTTTATTCAACTTATGG ACTAAAATCTAATGATAATTTAGTATATTTTGAGCATTTTCCCGATCGAGTTTTACTAAATAGTTTATTTTTAGGAAAAG GAGATTTTCAAAAAGCTGAAAAAATTCTTGAACAAATTATGTTAGGTCGATTTCAACCCGCAACCCCGACATTTTTAAAT GCCGGAAAATTAAACAGAGGTGAATTTGTCTCTTGTTATTTAATCCGAGTTGAAGATAATATGGAATCAATTTCCAGGGC AATTACTACTTCACTCCAACTTTCAAAACGTGGCGGTGGTGTTAGTGTTTTACTTTCAAATTTGCGCGAACAAGGTGCCC CGATTAAAAACATTGAAAATCAAGCAACTGGTGTAATTCCGGTAATGAAAATTCTTGAAGATTCATTTTCTTATGCAAAC CAGTTAGGACAACGTCAAGGTGCTGGGGCTGTTTATTTAAATGTCCACCATCCGGATATTCTGGCTTTTTTAGATACCAA AAGGGAAAATGCTGATGAAAAAATCAGGATAAAATCGCTTTCTCTTGGGATAATAATTCCGAATATTACTTTTGAATTAG CAAAAAATAATGAAAAAATGGCGCTTTTTTCTGTCTATGATGTTGAAAAAGTATATCAAAAAGCTTTTAGTGATATTTCT ATTAGTGAAAATTATTATCAAATGCTAGCAAATCCAGAAATTAAAAAAACATTTATTTCGGCAAGAAAGTTATTTAAAAT TATTGCCGAGCTACATTTTGAAAGTGGTTATCCTTATATTTTATTTGAAGATATTGTCAATAAAGAAAATGCTCATCCTG ATCGCGTTGTGATGTCAAATTTATGTAGCGAAATCACACAGCCTTCAACTCCAAGCAGATTTTTACCCGATCTAAGTTTT AAAGAAATAGGCAAGGATATTTGTTGTAATTTAGGATCGCTAAATATTGATAAGGCGATGGAATCAGGCCCTGATTTTGA AGAAATGGTTTATTATTCAGTGTTAGCTCTTGATGTTGTCTCGCGAAATTCTGATCTTTCAGTAGCGCCTTCAATTCAAA AAGGAAATAATTTAAATCATGCAATTGGTCTTGGGGCGATGAATTTACACGGGTTTTTGGCTAAAAATGAAATTTTTTAT GACTCAGAGGAAGCGCTTGATTTTACTAACATTTTTTTCTATACTTTAGCTTTTTCAGCTTTTAAAGCTTCTGAAAAACT TGCAAAAAAATATGGTCCTTTTTCTGGATTTGAAAAAACCAAATTTGCATCAGGAGAATATTTTGATAAATATACAAAAG TTTCCCCGAATACTTTTTTACCAAAAACACATAAAATTAAAGAACTTTTTGCAAAATATCAAGTTGAAATTCCGACTCAA GAAGATTGAATTCATCTTGTTGAAAAAATTAAAAAAACAGGAATTGCCAACTCGCATCTAATGGCGATTGCTCCTACAGG CTCAATTTCCTATCTTAGTTCCTGCACACCTTCGCTTCAGCCAGTTGTTGCCCCAGTTGAGATAAGAAAAGAAGGAAAAT TAGGGAGAATTTATGTTCCTTCATATAAATTAAGTCCTAAAACATACAAATTTTATCAAAACGGAGCTTATGAATTAGGT CCAATTCCGATTATAAACATTGTCTCAGAAGCACAAAAACATGTTGATCAAGCAATCTCGATGACCTTATTTATGACCGA CAAGGCGACTACTCGAGACTTAAATCGAGCTTATATTTATGCTTTTAAAAAAAATTGTAAGTCAATTTACTATGTAAGAA TTCGTCAAGATGTCCTTGAGGATTCAGAAAATTATGAAACTTGTCAATCTTGCCAGATTTAA Protein sequence : MNFDKNQEKSYLSLNANSKIFANHPDSHKFDLLAAEKYINEEINPKFKFFNSFKERIEFLVQNNYYDPKVLGQYSFQELE KLNTKAWSYNHFFSSFMGAFKFYSTYGLKSNDNLVYFEHFPDRVLLNSLFLGKGDFQKAEKILEQIMLGRFQPATPTFLN AGKLNRGEFVSCYLIRVEDNMESISRAITTSLQLSKRGGGVSVLLSNLREQGAPIKNIENQATGVIPVMKILEDSFSYAN QLGQRQGAGAVYLNVHHPDILAFLDTKRENADEKIRIKSLSLGIIIPNITFELAKNNEKMALFSVYDVEKVYQKAFSDIS ISENYYQMLANPEIKKTFISARKLFKIIAELHFESGYPYILFEDIVNKENAHPDRVVMSNLCSEITQPSTPSRFLPDLSF KEIGKDICCNLGSLNIDKAMESGPDFEEMVYYSVLALDVVSRNSDLSVAPSIQKGNNLNHAIGLGAMNLHGFLAKNEIFY DSEEALDFTNIFFYTLAFSAFKASEKLAKKYGPFSGFEKTKFASGEYFDKYTKVSPNTFLPKTHKIKELFAKYQVEIPTQ EDWIHLVEKIKKTGIANSHLMAIAPTGSISYLSSCTPSLQPVVAPVEIRKEGKLGRIYVPSYKLSPKTYKFYQNGAYELG PIPIINIVSEAQKHVDQAISMTLFMTDKATTRDLNRAYIYAFKKNCKSIYYVRIRQDVLEDSENYETCQSCQI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 2e-178 | 53 |