Name : recG (M28_Spy1509) Accession : YP_280974.1 Strain : Streptococcus pyogenes MGAS6180 Genome accession: NC_007296 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : 3.6.1.- Position : 1501345 - 1503360 bp Length : 2016 bp Strand : - Note : catalyzes branch migration in Holliday junction intermediates DNA sequence : ATGATATTAACAGCTCCTATGTCCAACTTAAAGGGATTTGGACCAAAATCAGCAGAAAAATTTCAGAAATTAGATATTTA TACAGTAGAAGATTTACTGCTTTATTATCCGTTTCGCTATGAAGATTTTAAATCAAAATCTGTTTTTGATTTAGTGGATG GTGAAAAAGCAGTCATTACAGGCTTAGTCGTTACTCCAGCTAATGTACAATATTATGGTTTTAAACGTAACCGTTTAAGT TTCAAATTGCGTCAAGGGGAAGCTGTCTTAAATGTTAGTTTTTTTAATCAACCCTATTTAGCTGATAAAATAGAACTTGG TCAAGAGGTAGCTGTTTTTGGTAAATGGGATGCCACTAAATCGGCTATTACTGGGATGAAGGTTTTAGCTCAAGTTGAAG ATGACATGCAACCTGTTTATCGCGTAGCTCAGGGAATTTCACAGTCTACTTTGATTAAAGCTATTAAGTCAGCTTTTGAA ATCGATGCGCATTTGGAATTGAAGGAAAATTTACCAGCTACTTTATTGGAAAAATACCGATTGATGGGTCGTAGTCAGGC TTGTTTAGCTATGCATTTCCCAAAAGATATCACAGAGTATAAGCAAGCGCTCCGTCGGATTAAATTTGAAGAATTATTTT ACTTTCAAATGAACCTTCAAGTTTTGAAAGCCGAAAATAGATCTGAAACAAATGGTTTGCCTATTCTTTATAGTAAACAT GCTATGGAGACAAAGATTTCCTCTTTACCCTTTATTCTAACAAATGCTCAAAAGCGCTCTTTAGATGACATATTATCTGA TATGTCATCGGGAGCTCATATGAATCGTTTATTGCAAGGAGATGTAGGATCAGGAAAGACAGTCATTGCTGGTCTATCAA TGTATGCAGCTTATACAGCAGGTTTTCAATCGGCTTTGATGGTTCCAACGGAAATCCTAGCTGAACAACACTACATTAGT CTGCAAGAGTTATTTCCAGATTTATCAATCGCTATATTAACTTCGGGTATGAAAGCAGCTGTCAAGCGTACGGTTTTAGC AGCTATTGCAAATGGCTCGGTTGATATGATTGTAGGAACTCATGCTCTTATCCAAGACTCGGTACAGTACCATAAACTGG GGCTTGTCATTACAGACGAGCAACATCGTTTTGGTGTTAAACAGCGTAGAATTTTCCGTGAAAAGGGAGAAAATCCTGAT GTTTTAATGATGACAGCCACCCCAATTCCCCGAACTCTAGCAATCACAGCTTTTGGAGAAATGGATGTTTCTATTATTGA TGAATTACCTGCCGGTCGTAAACCTATTATGACACGCTGGGTGAAACACGAGCAGCTAGGTACTGTGTTGGAATGGGTAA AAGGTGAATTGCAAAAAGATGCTCAAGTGTATGTCATTTCACCGTTGATTGAAGAATCAGAAGCTTTAGATTTAAAGAAT GCAGTAGCATTGCATGCTGAATTATCTACTTATTTTGAAGGAATTGCTAAGGTTGCTCTTGTACATGGACGTATGAAAAA TGATGAAAAAGATGCTATAATGCAAGATTTCAAGGATAAAAAAAGTCATATTTTAGTATCCACAACAGTTATTGAAGTAG GGGTAAATGTCCCAAATGCAACGATCATGATTATTATGGATGCCGATCGTTTTGGATTAAGTCAGTTACATCAACTTCGT GGGCGTGTTGGTCGTGGATATAAACAATCATACGCTGTTTTAGTGGCTAATCCCAAAACTGATTCGGGGAAAAAACGAAT GACAATCATGACAGAAACGACAGATGGTTTCGTTTTAGCTGAGTCGGATTTAAAAATGCGTGGTTCTGGTGAAATCTTTG GTACTCGTCAGTCTGGAATTCCAGAATTTCAAGTAGCTGATATCGTTGAGGATTATCCTATTTTAGAAGAAGCACGCAAA GTTTCTGCAGCGATTGTTTCTGATCCTAACTGGATATATGAAAAACAGTGGCAATTAGTGGCACAAAATATTAGAAAAAA AGAAGTTTATGATTAA Protein sequence : MILTAPMSNLKGFGPKSAEKFQKLDIYTVEDLLLYYPFRYEDFKSKSVFDLVDGEKAVITGLVVTPANVQYYGFKRNRLS FKLRQGEAVLNVSFFNQPYLADKIELGQEVAVFGKWDATKSAITGMKVLAQVEDDMQPVYRVAQGISQSTLIKAIKSAFE IDAHLELKENLPATLLEKYRLMGRSQACLAMHFPKDITEYKQALRRIKFEELFYFQMNLQVLKAENRSETNGLPILYSKH AMETKISSLPFILTNAQKRSLDDILSDMSSGAHMNRLLQGDVGSGKTVIAGLSMYAAYTAGFQSALMVPTEILAEQHYIS LQELFPDLSIAILTSGMKAAVKRTVLAAIANGSVDMIVGTHALIQDSVQYHKLGLVITDEQHRFGVKQRRIFREKGENPD VLMMTATPIPRTLAITAFGEMDVSIIDELPAGRKPIMTRWVKHEQLGTVLEWVKGELQKDAQVYVISPLIEESEALDLKN AVALHAELSTYFEGIAKVALVHGRMKNDEKDAIMQDFKDKKSHILVSTTVIEVGVNVPNATIMIIMDADRFGLSQLHQLR GRVGRGYKQSYAVLVANPKTDSGKKRMTIMTETTDGFVLAESDLKMRGSGEIFGTRQSGIPEFQVADIVEDYPILEEARK VSAAIVSDPNWIYEKQWQLVAQNIRKKEVYD |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 2e-94 | 44 |