Name : nrdE (MHJ_0215) Accession : YP_279017.1 Strain : Mycoplasma hyopneumoniae J Genome accession: NC_007295 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0209 EC number : 1.17.4.1 Position : 251268 - 253409 bp Length : 2142 bp Strand : - Note : Catalyzes the rate-limiting step in dNTP synthesis DNA sequence : CTGAATTTTGATAAAAATCAGGAAAAAAGTTATCTTAGCTTAAATGCAAATAGCAAAATTTTTGCAAATCATCCTGATTC ACATAAATTTGATTTATTAGCAGCAGAGAAATATATTAATGAAGAAATTAATCCAAAATTTAAATTTTTCAATTCTTTTA AGGAAAGAATTGAATTTTTAGTTCAAAATAATTATTATGATCCGAAAGTTTTAGGACAATATTCATTCCAAGAACTTGAG AAATTAAATACAAAAGCTTGAAGTTATAATCATTTTTTTTCTTCTTTTATGGGGGCTTTTAAATTTTATTCAACTTATGG ACTAAAATCTAATGATAATTTAGTATATTTTGAACATTTTCCCGATCGAGTTTTACTAAATAGTTTATTTTTAGGAAAAG GAGATTTTCAAAAAGCTGAAAAAATTCTTGAACAAATTATGTTAGGTCGATTTCAACCGGCAACCCCGACATTTTTAAAT GCCGGAAAATTAAACAGAGGTGAATTTGTCTCTTGTTATTTAATCCGAGTTGAAGATAATATGGAATCAATTTCCAGGGC AATTACTACCTCACTCCAACTTTCAAAACGTGGCGGTGGTGTTAGTGTTTTACTTTCAAATTTGCGCGAACAAGGTGCCC CGATTAAAAACATTGAAAATCAAGCAACTGGTGTAATTCCGGTAATGAAAATTCTTGAAGATTCATTTTCTTATGCAAAC CAGTTAGGACAACGTCAAGGTGCTGGGGCTGTTTATTTAAATGTCCACCATCCGGATATTCTGGCTTTTTTAGATACCAA AAGGGAAAATGCTGATGAAAAAATCAGGATAAAATCGCTTTCTCTTGGGATAATAATTCCGAATATTACTTTTGAATTAG CAAAAAATAATGAAAAAATGGCGCTTTTTTCTGTCTATGATGTTGAAAAAGTATATCAAAAAGCTTTTAGTGATATTTCT ATTAGTGAAAAATATTATCAAATGCTAGCAAATCCAGAAATTAAAAAAACATTTATTTCGGCAAGAAAGTTATTTAAAAT TATTGCCGAGCTACATTTTGAAAGTGGTTATCCTTATATTTTATTTGAAGATATTGTCAATAAAGAAAATGCTCATCCTG ATCGCGTTGTGATGTCAAATTTATGTAGCGAAATCACACAGCCTTCAACTCCAAGCACATTTTTACCCGATCTAAGTTTT AAAGAAATAGGCAAGGATATTTGTTGTAATTTAGGATCGCTAAATATTGATAAGGCGATGGAATCAGGCCCTGATTTTGA AGAAATGGTTTATTATTCAGTGTTAGCTCTTGATGTTGTCTCGCGAAATTCTGATCTCTCAGTAGCGCCTTCAATCCAAA AAGGAAATAATTTAAATCATGCAATTGGCCTTGGGGCGATGAATTTACACGGGTTTTTGGCTAAAAATGAAATTTTTTAT GACTCAGAGGAAGCGCTTGATTTTACTAACATTTTTTTCTATACTTTAGCTTTTTCAGCTTTTAAAGCCTCTGAAAAACT TGCAAAAAAATATGGTCCTTTTTCTGGATTTGAAAAAACCAAATTTGCATCAGGAGAATATTTTGATAAATATACAAAAG TTTCCCCGAATACTTTTGTACCAAAAACACATAAAATTAAAGAACTTTTTGCAAAATATCAAGTTGAAATTCCGACTCAA AAAGATTGAATTCATCTTGTTGAAAAAATTAAAAAAACAGGAATTGCCAACTCACATCTAATGGCGATTGCTCCTACAGG CTCAATTTCCTATCTTAGTTCCTGCACGCCTTCGCTTCAGCCCGTTGTTGCCCCAGTTGAGATAAGAAAAGAAGGAAAAT TAGGGAGAATTTATGTTCCTTCATATAAATTAAGTCCTAAAACATACAAATTTTATCAAAACGGAGCTTATGAATTAGGT CCAATTCCGATTATAAACATTGTCTCAGAAGCACAAAAACATGTTGATCAAGCAATCTCGATGACCTTATTTATGACCGA CAAGGCGACTACTCGAGACTTAAATCGAGCTTATATTTATGCTTTTAAAAAAAATTGTAAGTCAATTTACTATGTAAGAA TTCGTCAAGATGTCCTTGAGGATTCAGAAAATTATGAAACTTGTCAATCTTGCCAGATTTAA Protein sequence : MNFDKNQEKSYLSLNANSKIFANHPDSHKFDLLAAEKYINEEINPKFKFFNSFKERIEFLVQNNYYDPKVLGQYSFQELE KLNTKAWSYNHFFSSFMGAFKFYSTYGLKSNDNLVYFEHFPDRVLLNSLFLGKGDFQKAEKILEQIMLGRFQPATPTFLN AGKLNRGEFVSCYLIRVEDNMESISRAITTSLQLSKRGGGVSVLLSNLREQGAPIKNIENQATGVIPVMKILEDSFSYAN QLGQRQGAGAVYLNVHHPDILAFLDTKRENADEKIRIKSLSLGIIIPNITFELAKNNEKMALFSVYDVEKVYQKAFSDIS ISEKYYQMLANPEIKKTFISARKLFKIIAELHFESGYPYILFEDIVNKENAHPDRVVMSNLCSEITQPSTPSTFLPDLSF KEIGKDICCNLGSLNIDKAMESGPDFEEMVYYSVLALDVVSRNSDLSVAPSIQKGNNLNHAIGLGAMNLHGFLAKNEIFY DSEEALDFTNIFFYTLAFSAFKASEKLAKKYGPFSGFEKTKFASGEYFDKYTKVSPNTFVPKTHKIKELFAKYQVEIPTQ KDWIHLVEKIKKTGIANSHLMAIAPTGSISYLSSCTPSLQPVVAPVEIRKEGKLGRIYVPSYKLSPKTYKFYQNGAYELG PIPIINIVSEAQKHVDQAISMTLFMTDKATTRDLNRAYIYAFKKNCKSIYYVRIRQDVLEDSENYETCQSCQI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 1e-178 | 53 |