Name : trxB (SAR11_0077) Accession : YP_265504.1 Strain : Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 Genome accession: NC_007205 Putative virulence/resistance : Unknown Product : thioredoxin reductase Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG0492 EC number : 1.8.1.9 Position : 91514 - 92458 bp Length : 945 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAGTGAAAATCCAATTAAACACACAAAAGTGTTAATAATAGGGTCAGGTCCAGCTGGCTATACAGCCGCTGTATATGC TGCCCGAGCAATGCTAAATCCTATTCTAGTTTATGGAGTTCAGCCTGGTGGGCAATTAACGACAACAACCGATGTAGAAA ATTATCCTGGGTTTTCAGATGTAATTCAGGGTCCATGGTTAATGGATCAAATGAGAGATCAAGCAAAAGCAGTTGGAACA GATCTAATTGAAGATCATATTTCTTCAGTTAATTTAAAATCTACACCCTTTGAAGCTATTGGAGATAGTGGACAAAAATA TACAGCTGACAGCATAATTATTTCAACTGGTGCTCAAGCAAGATGGTTAAACTTAGAATCAGAACAAGCTTATAGAGGCT TTGGAGTTTCAGCATGCGCAACATGTGATGGTTTTTTCTTTAAAGAAAAAGTTGTAGCAGTTGTTGGTGGTGGAAACGCT GCAGTTGAAGAGGCAATGTTTCTTACAAAATTTGCATCAAAAGTAAAATTAATTCATAGAAGAGATACTTTAAGAGCAGA AAAATTACTTCAGAAAAAATTAATGGAAAATAAAAAAATTGAAATAATTTGGGATAGTGCTGTTGAAGAGGTTATTGGGG ATAGCGAACCTAAAAATGTTAAAGCTATTAAGATTAAAAATTTAAAAACTAATAAAATTGAAGAAATGAAAATAGATGGC TTATTTATTGCAATTGGTCACGACCCAGCAACAGCTTTATTTAAAGAACAGTTAGAAATGGATAAAGAAGGTTATTTATT GACCAAACCAGATTCAACAGAGACGAATATCCCTGGAGTTTATGCTGCGGGTGATGTTAAAGACAAAACGTTTAGACAAG CAGTTACAGCTGCTGGAATGGGTTGTATGGCTGCGCTTGAAGCTGAAAAATTTTTATCTCACTGA Protein sequence : MSENPIKHTKVLIIGSGPAGYTAAVYAARAMLNPILVYGVQPGGQLTTTTDVENYPGFSDVIQGPWLMDQMRDQAKAVGT DLIEDHISSVNLKSTPFEAIGDSGQKYTADSIIISTGAQARWLNLESEQAYRGFGVSACATCDGFFFKEKVVAVVGGGNA AVEEAMFLTKFASKVKLIHRRDTLRAEKLLQKKLMENKKIEIIWDSAVEEVIGDSEPKNVKAIKIKNLKTNKIEEMKIDG LFIAIGHDPATALFKEQLEMDKEGYLLTKPDSTETNIPGVYAAGDVKDKTFRQAVTAAGMGCMAALEAEKFLSH |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
trxB | AFC76431.1 | TrxB | Not tested | AbaR5 | Protein | 2e-58 | 51 |
trxB | CAJ77014.1 | thioredoxin reductase | Not tested | AbaR1 | Protein | 2e-58 | 51 |