Gene Information

Name : trxB (SAR11_0077)
Accession : YP_265504.1
Strain : Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062
Genome accession: NC_007205
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : thioredoxin reductase
Function : -
COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones
COG ID : COG0492
EC number : 1.8.1.9
Position : 91514 - 92458 bp
Length : 945 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGAGTGAAAATCCAATTAAACACACAAAAGTGTTAATAATAGGGTCAGGTCCAGCTGGCTATACAGCCGCTGTATATGC
TGCCCGAGCAATGCTAAATCCTATTCTAGTTTATGGAGTTCAGCCTGGTGGGCAATTAACGACAACAACCGATGTAGAAA
ATTATCCTGGGTTTTCAGATGTAATTCAGGGTCCATGGTTAATGGATCAAATGAGAGATCAAGCAAAAGCAGTTGGAACA
GATCTAATTGAAGATCATATTTCTTCAGTTAATTTAAAATCTACACCCTTTGAAGCTATTGGAGATAGTGGACAAAAATA
TACAGCTGACAGCATAATTATTTCAACTGGTGCTCAAGCAAGATGGTTAAACTTAGAATCAGAACAAGCTTATAGAGGCT
TTGGAGTTTCAGCATGCGCAACATGTGATGGTTTTTTCTTTAAAGAAAAAGTTGTAGCAGTTGTTGGTGGTGGAAACGCT
GCAGTTGAAGAGGCAATGTTTCTTACAAAATTTGCATCAAAAGTAAAATTAATTCATAGAAGAGATACTTTAAGAGCAGA
AAAATTACTTCAGAAAAAATTAATGGAAAATAAAAAAATTGAAATAATTTGGGATAGTGCTGTTGAAGAGGTTATTGGGG
ATAGCGAACCTAAAAATGTTAAAGCTATTAAGATTAAAAATTTAAAAACTAATAAAATTGAAGAAATGAAAATAGATGGC
TTATTTATTGCAATTGGTCACGACCCAGCAACAGCTTTATTTAAAGAACAGTTAGAAATGGATAAAGAAGGTTATTTATT
GACCAAACCAGATTCAACAGAGACGAATATCCCTGGAGTTTATGCTGCGGGTGATGTTAAAGACAAAACGTTTAGACAAG
CAGTTACAGCTGCTGGAATGGGTTGTATGGCTGCGCTTGAAGCTGAAAAATTTTTATCTCACTGA

Protein sequence :
MSENPIKHTKVLIIGSGPAGYTAAVYAARAMLNPILVYGVQPGGQLTTTTDVENYPGFSDVIQGPWLMDQMRDQAKAVGT
DLIEDHISSVNLKSTPFEAIGDSGQKYTADSIIISTGAQARWLNLESEQAYRGFGVSACATCDGFFFKEKVVAVVGGGNA
AVEEAMFLTKFASKVKLIHRRDTLRAEKLLQKKLMENKKIEIIWDSAVEEVIGDSEPKNVKAIKIKNLKTNKIEEMKIDG
LFIAIGHDPATALFKEQLEMDKEGYLLTKPDSTETNIPGVYAAGDVKDKTFRQAVTAAGMGCMAALEAEKFLSH

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
trxB AFC76431.1 TrxB Not tested AbaR5 Protein 2e-58 51
trxB CAJ77014.1 thioredoxin reductase Not tested AbaR1 Protein 2e-58 51