|
Name : tktB (SAR11_0587) Accession : YP_266011.1 Strain : Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 Genome accession: NC_007205 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0021 EC number : 2.2.1.1 Position : 574732 - 576690 bp Length : 1959 bp Strand : - Note : thiamine diphosphate binding domain DNA sequence : TTGAACAAATTACATAAAGATTTATCAAACGCAATAAGGTTTTTATCTATAGATGCTGTGCAAAAGGCAAATTCGGGTCA TCCTGGAATGCCAATGGGTATGGCAGACGTAGCAACAGTTTTGTTTAAAAATTTTCTTAGATTTAATCCAAAAAATCCTA ACTGGATAAATAGAGACAGATTTGTTTTATCTGCTGGTCATGGATCTATGCTTCTTTACTCTTTATTACATCTAACTGGG TACAAAAGTATTTCTTTGAATGATGTTAAAAATTTTAGACAATTAAAATCTATTTGTGCAGGTCATCCTGAATATCACCC TGGTACTGGTATTGAAACTACGACAGGTCCTCTTGGACAAGGAATTGCTAATTCAGTTGGTTTTGCTATTGCAGAGGAAA TTTTGAAGAAAAAACTTGGTAAAGAAATAATAAACCATAAAACTTATGTTTTAGCTGGAGATGGATGTTTAATGGAAGGC ATTAGCCATGAAGCAATGAGTTTAGCGGGACACTTAAAGTTAAAAAATCTAGTTATGCTTTTTGACAATAACTCGATATC AATTGATGGACCAACCAGTTTGGCAGTTTCAGATAATTTCAAAAAAAGATTTGAAAGTTATGGTTGGGATTACATACTAA TCAATGGTCATAACGAAAGAGAAATTTTTTCTGCATTAAAAAAAGTTCAAAATGCTAAAAGACCAACAGTTATTTCATGC AAAACAAAAATTGGTTATGGTTCACCTAATAAATCTGGTAAAGCCTCTTCGCACGGTAGTCCAATTGGTTTAGATGAAAT CAAATTAGTTAGAAAAGTATTAGATTGGAAACACAAACCTTTTGAAATTCCCAAAAGTATTTTGAATGAATGGAGAAAAA TTGGTAATAAGGGTGCAAAACTTGATTCTGCATGGAGTAAAATTTATAAAAGAAAAAAAAATTTAGTAGATAAAGTCTTT AAAAATAATTTCTCTAAAGCTTTAAAAAGTGAAAAACAAAATTCTCTTAGAGAAAACAAAAGTCTAGCCTCAAGAAAAGC TTCTGAGTTAACTCTTAATGCTCTTACGAGAGAAAATAATACGTTAATTGGTGGTTCAGCTGACTTAGCGGGATCTAATA ACACTAAAACCAAATATCATAACGCTATTAATTCTGTTAATTTTAATGGTGATTATATTCACTATGGTGTTAGGGAGCAC GCCATGGCAGGAATAATGAATGGTTTAGCACTTCATAGTAAATTTATTCCATATGGGGGAACTTTTTTAATATTTTCTGA TTATTGTAAACCTTCCATTCGTTTATCTGCTTTGATGCAACAGCGAGTTATTTATGTGATGACCCACGACTCAATTGGTT TAGGGGAAGATGGACCAACACACCAACCTATAGAACAACTCTCTGGATTAAGATCTATTCCTAATTTAAATGTTTTTAGA CCAGCAGACAGAATGGAAACTATCGAGTGTTGGGAGCTAGCATTAAAAAACTCGAAGACACCAAGTGTGTTATCTTTAAC TAGACAAAATCTTGAACCTATTAGAAAAAAATATTCAAATATGAACAAATGCTCTTTAGGTGCTTATGAGGTTTCAAGAA CAAATAAAAAAATTAATTTAACGATATTTGCTAGTGGTTCTGAGGTTAATTTAGCAATTGAAACTAGCCATAAATTAGCC AAAGATAAAATATATTCTAAAGTTATATCAGTACCATGCCAGGATATTTTTGATTTGCAGTCAAAAGCATATAAGAAAAA AATTCTTAATGAAGCAAAATTTAAAATATCTATTGAAGCAGCTTCAACTGATTGCTGGAAAAAATATATTGGAACTGAGG GTTTAGCTTTTGGAATTGATACATTCGGCAAAAGTGCACCCTATAAAGAAATTTATAAATATTTTGGATTAACAGTTCAA AATATTTCACAAAAAGCAAAAAAACTAATAAAGAGTTAA Protein sequence : MNKLHKDLSNAIRFLSIDAVQKANSGHPGMPMGMADVATVLFKNFLRFNPKNPNWINRDRFVLSAGHGSMLLYSLLHLTG YKSISLNDVKNFRQLKSICAGHPEYHPGTGIETTTGPLGQGIANSVGFAIAEEILKKKLGKEIINHKTYVLAGDGCLMEG ISHEAMSLAGHLKLKNLVMLFDNNSISIDGPTSLAVSDNFKKRFESYGWDYILINGHNEREIFSALKKVQNAKRPTVISC KTKIGYGSPNKSGKASSHGSPIGLDEIKLVRKVLDWKHKPFEIPKSILNEWRKIGNKGAKLDSAWSKIYKRKKNLVDKVF KNNFSKALKSEKQNSLRENKSLASRKASELTLNALTRENNTLIGGSADLAGSNNTKTKYHNAINSVNFNGDYIHYGVREH AMAGIMNGLALHSKFIPYGGTFLIFSDYCKPSIRLSALMQQRVIYVMTHDSIGLGEDGPTHQPIEQLSGLRSIPNLNVFR PADRMETIECWELALKNSKTPSVLSLTRQNLEPIRKKYSNMNKCSLGAYEVSRTNKKINLTIFASGSEVNLAIETSHKLA KDKIYSKVISVPCQDIFDLQSKAYKKKILNEAKFKISIEAASTDCWKKYIGTEGLAFGIDTFGKSAPYKEIYKYFGLTVQ NISQKAKKLIKS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 6e-140 | 48 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 2e-133 | 44 |
