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Name : cox1 (SAR11_0134) Accession : YP_265561.1 Strain : Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 Genome accession: NC_007205 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome-c oxidase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.9.3.1 Position : 141011 - 142645 bp Length : 1635 bp Strand : - Note : chain I DNA sequence : ATGTACACAAAAACAGCATCACACGACGATCATCACACACCAACAGGTTGGAAACGTTGGGCTTACTCAACTAACCACAA AGACATTGGTACAATGTATTTAATTTTTGCAATTGTTGCAGGAATTATTGGTACAGCTTTTTCAGTATTAATGAGAATTG AATTGATGCATCCTGGTGATGGAATTTTAGGTGGCAACTATCACTTATATAATGTTTTGGTTACAGGCCATGGATTAATA ATGATTTTCTTTATGGTAATGCCCGCAATGATTGGTGGATTTGGTAATTGGTTTGTCCCAATTATGATCGGTGCACCTGA TATGGCTTTTCCAAGAATGAATAATATTTCATTTTGGTTATTACCAGCTTCATTTATTTTACTATTACTTTCAATATTTG TAGATGGCCCTCCAGGTCAGCAAGGTGTTGGTGGAGGATGGACTTTATATCCACCTTTATCGTCAAAAGCTGGACAACCA GGACCTGCTATGGATTTTGCTATTTTAAGCTTACACTTAGCTGGAGCTTCTTCAATTTTAGGAGCAGTTAACTTTATTAC AACAATTTTAAATATGAGAACGCCAGGCATGACTTTGCATAAAATGCCTTTATTTGCTTGGTCTGTTTTAGTTACAGCAT TTTTATTATTACTATCACTACCTGTTTTAGCTGGTGCTATCACAATGCTTTTAACAGATAGAAATTTTGGAACAGCATTT TTTGATGCTCAAACTGGAGGAGATCCAGTTTTATACCAACACTTATTTTGGTTCTTTGGTCACCCTGAAGTTTATATTTT AATTTTACCTGGCTTTGGAATGATCAGTCATATCGTTTCAACATTTTCTAAGAAACCTGTATTTGGATATTTAGGAATGG CTTATGCGATGGTTTCAATTGGGGTTGTTGGGTTTGTTGTTTGGGCTCACCACATGTATACGGTAGGTTTAAGTACAGAC ACTAAAGCATATTTTTTAGCTGCAACAATGATTATTGCGGTCCCAACAGGGATTAAAATATTTTCATGGATTGCAACAAT GTGGGGTGGATCAATTTCATTTAAAACTCCCATGATGTGGGCATTAGGTTTTATATTTTTATTTACAGTAGGTGGTGTAA CAGGTGTTGTTCTTGCAAATGCAGGTGTTGATACTGCAATGCATGATACTTATTATGTAGTTGCTCACTTTCATTATGTA TTATCTTTAGGTGCAGTATTTGCAATCTTTGCAGGATTTTATTATTGGTTTGGTAAAATGTCTGGGTATGAGTATTCAGA ATGGATGGGACAATTACATTTTTGGTTAACATTTATTGGAGTGAACTTAGTATTTTTCCCTCAACATTTTTTAGGTTTAG CTGGAATGCCAAGAAGATATGCTGATTACCCTGATGCATTTGCTGGATGGAATTATGTTTCGTCAATCGGCTCATACATA GCGGTTGCTGGCTTACTAGTATTTTTTGCTAACTTAATTTATTCTTTTTCTAAGAAAAAAGCTGCAGCTCAGAACCCTTG GGGAGAAGGAGCTACAACTCTAGAATGGACTGTACCATCACCACCAAATTTTCATACTTTTGAGGAATTACCAAAATTTG AAGATCCAGATGGTGCTGAAAAAGTATCTAGTTAA Protein sequence : MYTKTASHDDHHTPTGWKRWAYSTNHKDIGTMYLIFAIVAGIIGTAFSVLMRIELMHPGDGILGGNYHLYNVLVTGHGLI MIFFMVMPAMIGGFGNWFVPIMIGAPDMAFPRMNNISFWLLPASFILLLLSIFVDGPPGQQGVGGGWTLYPPLSSKAGQP GPAMDFAILSLHLAGASSILGAVNFITTILNMRTPGMTLHKMPLFAWSVLVTAFLLLLSLPVLAGAITMLLTDRNFGTAF FDAQTGGDPVLYQHLFWFFGHPEVYILILPGFGMISHIVSTFSKKPVFGYLGMAYAMVSIGVVGFVVWAHHMYTVGLSTD TKAYFLAATMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSISFKTPMMWALGFIFLFTVGGVTGVVLANAGVDTAMHDTYYVVAHFHYV LSLGAVFAIFAGFYYWFGKMSGYEYSEWMGQLHFWLTFIGVNLVFFPQHFLGLAGMPRRYADYPDAFAGWNYVSSIGSYI AVAGLLVFFANLIYSFSKKKAAAQNPWGEGATTLEWTVPSPPNFHTFEELPKFEDPDGAEKVSS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 1e-78 | 44 |
