Gene Information

Name : SH0071 (SH0071)
Accession : YP_251986.1
Strain : Staphylococcus haemolyticus JCSC1435
Genome accession: NC_007168
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism
COG ID : COG2814
EC number : -
Position : 79186 - 80511 bp
Length : 1326 bp
Strand : -
Note : hypothetical protein, similar to transporter proteins

DNA sequence :
ATGGAATTCAAAGTTAATAAAAAACTTATTTTTGTACTAGGTGCACTTGGCGGTTTACTCTATGGATATGATAATGGCGT
AATTTCAGGAGCTTTACTATTTATTAATAATGATATTCCACTTACTAGCTTTACCCAAGGATTAGTTGTATCTTCTATGC
TAATCGGTGCTATTATAGGCGCTGGCTTGAGTGGTCCGATTTCTGACAAATTGGGGCGCCGTAAAGTTGTATTTATTATT
GCTATCATTTACATTATTGGTTCTTTATTAATGGCAGTTGCAAATAGTGTCGATTTATTAGTGATAGGAAGACTTGTTAT
AGGTTTGGGTGTTGGTAGTTCAACAGCTATTATACCTGTATATCTTTCTGAAATGGCCCCTACAAAATTCAGAGGTTCCT
TAGCCGCATTAAACCCTTTAATGATAACTATTGGTATATTAGTAGCTTATTGTACAAACTTTTTATTGGCTGATGCAGAA
GCTTGGAGATGGATGATTGGCTTAGCAGTTGTACCAGCTATCATATTATTAATCGGCGTTATATTTATGCCTGAAAGTCC
GAGATGGCTATTAGAAAACAAATCTGAAACAGCAGCACGTCACGTCATGAGCTTAACATTTAAACAACATGAGATTGAAA
AAGAAATAAACGATATGAAAAATGTAATTCATAACTCAGAATCCGCATGGAAATTACTCAGAGCAAAATGGGTACGTCCA
GTACTTATCATTGGCTGTTTATTTGCATTTTTCCAACAAATCATAGGCATTAACGCAATTATATATTATACACCACTTAT
ACTAACTAAAGCTGGATTAGGAAGTTCAAGCTCTATACTTGGAACAGTTGGTTTAGGAATAGTCAATGTTTTGGTAACAA
TTCTCTCTATAGTTATCATCGATAAAATTGATAGAAAAAAATTACTTGTAATTGGGAATATTGGGATGATTATTTCACTT
TTGATAATGACAATTACAATTGCTACTATGGGTATTACTCAAGTTGCTTGGATTATTATCATTTGTTTATCGTTATTTAT
ACTATTCTTTGGCGCAACATGGGGGCCAATTATGTGGGTAATGTTGCCAGAAATGTTCCCTACACGCGCTCGAGGTGCAG
CTACTGGTATCGCTATTGTAGTATTACAAATAGGAACACTTATTATTTCTCAAGTATTTCCTATCCTTGTTAATATGTTA
GAAGTACAATATGTATTCTTGATTTTTGCAGTTATAGGGGCATTAGCACTCATTTTTGTAGTTAAATTCTTACCGGAAAC
GCGTGGTAAAAGTTTAGAAGAAATCGAATTACAATTACAAAACTAA

Protein sequence :
MEFKVNKKLIFVLGALGGLLYGYDNGVISGALLFINNDIPLTSFTQGLVVSSMLIGAIIGAGLSGPISDKLGRRKVVFII
AIIYIIGSLLMAVANSVDLLVIGRLVIGLGVGSSTAIIPVYLSEMAPTKFRGSLAALNPLMITIGILVAYCTNFLLADAE
AWRWMIGLAVVPAIILLIGVIFMPESPRWLLENKSETAARHVMSLTFKQHEIEKEINDMKNVIHNSESAWKLLRAKWVRP
VLIIGCLFAFFQQIIGINAIIYYTPLILTKAGLGSSSSILGTVGLGIVNVLVTILSIVIIDKIDRKKLLVIGNIGMIISL
LIMTITIATMGITQVAWIIIICLSLFILFFGATWGPIMWVMLPEMFPTRARGAATGIAIVVLQIGTLIISQVFPILVNML
EVQYVFLIFAVIGALALIFVVKFLPETRGKSLEEIELQLQN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SH0071 YP_251986.1 hypothetical protein Not tested SCCmec Protein 6e-153 100