Gene Information

Name : SH0042 (SH0042)
Accession : YP_251957.1
Strain : Staphylococcus haemolyticus JCSC1435
Genome accession: NC_007168
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 50695 - 52014 bp
Length : 1320 bp
Strand : +
Note : similar to unknown protein

DNA sequence :
ATGATTAATATATATGAAAAATTTGATGATAAGACAATACTACTATATAGATCATTTGAAAATTCATCAATTAATAATAT
TAATATAGTACTAGAAGATGACGGTTTCTTACCATTTAATATCTTTTCTCCATATAGATATTTTACGAAAGAAAAGAAAG
AACGTTTTAAGCCGCTTTATTTTAATGAAGTGCCTGTTCCAGAATATTGGGAGATAAAAGGTGACAATAAATCGGCAAAG
ATTATGGATAAAGGGAAAATTAGAGGTAAAATTATATACAAAAAAAATATAGGCCAATCACGAATTGTAGATAAAGTTGA
ATGGTTAAGTGAAGATGGTCAGTTGAAATATGTAGATTTTTATAATCAACAAGGTTTTCGCTTTGCTCAACTGTTATATG
ATGAATTTAAAATGAAAATTTTAAAACGTTATTTTGATAAAGAAAATAATGTAGTAATAGTAGAGAACTTTGTAACTAAA
GATATTATATTGAACTATAATGATAAAAACTTATTTTTTAATAACAAAAAAGAATTTTATTCTTATTATTTAAGTCAACT
TGAGGTGCCTAAAAATCACATTCTAATAAATTCTCTCTCATATCCTTTTTTAACTACTTACAGTTTTAAAGAGGAGATTG
TAAATTACAAGATAGTATGGCAAGAAAATATTAAAGATTCAATTCCAGATAATATGAAAGTTGCGTTAAAGCATATTAAA
AATGTTGAAATTCTAGTTCCAAATCAAGAAGAGTATCATAAAATCGTATCAGTAGTAGAAAATAACGATAAAGAAAAAAT
AACTAAGTCTGGATACGTTTATAATTTTAAAAAAGATAATCATTTTAAAAAAAATATCTTTATTCTTACCAATTCTGATG
ATATACCATTTTTGAGTGAAATCGTTGATCATAATCCAGAATTTAATTTTAAAGTAGCTGCTTTAACAGAAATGTCGTCT
AAGTTGATGGGGTTAGATACTAAAAAAAATATTAAATTGTACCCTAAAATATCTAATAGTGCTGTTAGTGACCTTCTTAA
AGAAAGCGACATATATTTAGATATAAACAAAGGTAATGAGGTCTTAAATATTATAGAAAGAGCTTTCAGCTATCAATTAT
TGATATTCGCTTTTAAAGAAACTGCTCATAATAGTGTTTGGATTGATGATTCAAATATATTTGAAATTAATAATTATAAG
GCTTTGATTAGTAAAATTAATAAATTAAATAATTTGAATGGCTTTAAATTATTATTAGAAAAGCAATTAAGTCATGCTGA
CATCATTGATAAAGAAGAATTTGTTAAATTACTAAACTAA

Protein sequence :
MINIYEKFDDKTILLYRSFENSSINNINIVLEDDGFLPFNIFSPYRYFTKEKKERFKPLYFNEVPVPEYWEIKGDNKSAK
IMDKGKIRGKIIYKKNIGQSRIVDKVEWLSEDGQLKYVDFYNQQGFRFAQLLYDEFKMKILKRYFDKENNVVIVENFVTK
DIILNYNDKNLFFNNKKEFYSYYLSQLEVPKNHILINSLSYPFLTTYSFKEEIVNYKIVWQENIKDSIPDNMKVALKHIK
NVEILVPNQEEYHKIVSVVENNDKEKITKSGYVYNFKKDNHFKKNIFILTNSDDIPFLSEIVDHNPEFNFKVAALTEMSS
KLMGLDTKKNIKLYPKISNSAVSDLLKESDIYLDINKGNEVLNIIERAFSYQLLIFAFKETAHNSVWIDDSNIFEINNYK
ALISKINKLNNLNGFKLLLEKQLSHADIIDKEEFVKLLN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SH0042 YP_251957.1 hypothetical protein Not tested SCCmec Protein 5e-172 100