Name : malA (SH1408) Accession : YP_253323.1 Strain : Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 Genome accession: NC_007168 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha-D-1,4-glucosidase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 1435988 - 1437634 bp Length : 1647 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATAAAAATTGGTGGAAAGAAGTAGTAGCGTATCAAGTTTATCCAAGAAGTTTTAATGATAGTAATAATGATGGTAT TGGTGATTTACCAGGTGTAATCGAAAAATTAGACTATTTTAAAGACTTAGGTATTGATGTTATTTGGCTAAGTCCAATGT ATAAATCACCTAATGATGATAATGGATATGATATCAGTGATTATCAAGATATTATGGATGAATTTGGTACAATGGAAGAT TTTGATTGTCTATTAAAAGGTGTACATGACCGTGGTATGAAACTAATATTAGATTTAGTCGTTAACCATACATCTGATGA GCATCCCTGGTTTATTGAATCAAAATCTAGTAAAGATAACCCAAAAAGAGACTGGTACATATGGGCAGACCCTAAGGATG ATGGTTCTGAACCAAATAATTGGGAGAGCATTTTTAATGGTTCAACATGGCAATTTGATGAAACCACTAATCAATATTAC TTCCATTTATTTAGTAAAAAACAACCAGATTTAAATTGGGATAATCCTGAAGTACGTGAATCAGTATTTAACATGATGAA TTGGTGGTTTGAAAAGGGTATTGATGGATTCCGTGTCGATGCTATAACCCATATTAAGAAAACATTTGAAGCTGGTGACC TACCTGCACCAGAAGGAAAAAAATATGCTCCAGCCTTTGATGTAGATATGAATCAACCTGGTATTCAGAATTGGCTACAA GAAATGAAAGATGAGTCACTAAGCCAATATGATATTATGACTGTTGGAGAAGCGAATGGTGTAAATCCAGATAATGCAGA AGAGTGGGTTGGAGAAGATAAAGGTAAATTCAATATGATCTTCCAATTTGAACATTTAGGTTTATGGAGTACAGGTGATT CTCAATTTGACGTTAAATCATATAAAGAGGTGTTAAACCGCTGGCAAAAGAGACTAGAAGGAATTGGTTGGAATGCACTT TTCATAGAAAACCATGATCAACCTCGTCGTGTATCAACTTGGGGTAACGATAAAGATTACTGGTTTGAATCTGCTACAAG CCACGCCGTTGTGTATTTCTTACAGCAAGGTACACCGTTTATCTATCAAGGACAAGAAATTGGTATGACCAATTATCCTT TTGAAAGTATTGAAACGTTTAATGATGTTGCGGTTAGAAATGAATATCAAATTGTAAAAGAACAAGGTGGAGACGTTGAT CAATTATTAGATAAGTATAGAATGGAAAATCGTGATAATTCTCGTACACCTATGCAATGGAATAATTCTACAAATGGTGG CTTCACAGAGGGAAAACCTTGGTTCCCAGTTAATCCAAATTATAAAGATATTAATGTAGCTCATCAATTAGAAGACGAGC ATTCTGTACTTAATTTTTACAAAAAATTGATTCAATTAAAAAAATCGCATGATATATATATGTATGGACAGTTTGATTTA ATTGATGCAGAAAATGAAAATGTGTTTGCTTATACTAGACAATTAGAAGGCAAAACTGTAGTGGTTGCAGGTAATTTAAC TGATAAACAAAGTTCATTAACATTACCTTTTGATATCGAAGAGGATGCAATCAAATTACATAACTACAATAGTCAATTAG ATGCAACATCACTTAAGCCATTCGAAGCATTTGTAGCAGAAATATAA Protein sequence : MNKNWWKEVVAYQVYPRSFNDSNNDGIGDLPGVIEKLDYFKDLGIDVIWLSPMYKSPNDDNGYDISDYQDIMDEFGTMED FDCLLKGVHDRGMKLILDLVVNHTSDEHPWFIESKSSKDNPKRDWYIWADPKDDGSEPNNWESIFNGSTWQFDETTNQYY FHLFSKKQPDLNWDNPEVRESVFNMMNWWFEKGIDGFRVDAITHIKKTFEAGDLPAPEGKKYAPAFDVDMNQPGIQNWLQ EMKDESLSQYDIMTVGEANGVNPDNAEEWVGEDKGKFNMIFQFEHLGLWSTGDSQFDVKSYKEVLNRWQKRLEGIGWNAL FIENHDQPRRVSTWGNDKDYWFESATSHAVVYFLQQGTPFIYQGQEIGMTNYPFESIETFNDVAVRNEYQIVKEQGGDVD QLLDKYRMENRDNSRTPMQWNNSTNGGFTEGKPWFPVNPNYKDINVAHQLEDEHSVLNFYKKLIQLKKSHDIYMYGQFDL IDAENENVFAYTRQLEGKTVVVAGNLTDKQSSLTLPFDIEEDAIKLHNYNSQLDATSLKPFEAFVAEI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-124 | 49 |